Informacija

1.II:. Įvadas į biochemiją – biologija

1.II:. Įvadas į biochemiją – biologija


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

A. Kas yra biochemija ir kam ji reikalinga?

Pažodžiui „Biochemija“ yra gyvenimo chemija. Tai yra „molekulinės biologijos“ sinonimas, tačiau tradiciškai biochemija daugiau nagrinėjo baltymų ir mažesnių biomolekulių tyrimus, o molekulinė biologija daugiau nagrinėjo genų ekspresiją ir susijusias molekules. Davis, „Biochemija ir molekulinė biologija“. Kadangi biomolekulės yra visų gyvųjų sistemų fiziologijos ir elgesio aspektų pagrindas, kiekvienas, kuris pasirenka dirbti su biologine veikla susijusioje srityje, turi išmanyti biochemiją.

B. Molekulės an E. coli ląstelė

Junginys% svoriopr. MW#/ląstelė# rūšiųkomentarą
(H_2O)7018(4kartus 10^{10})1
Jonai (Na, K, SO4 ir kt.)140(2,6 kartai 10^8)20 majoraspavyzdysNa+ ~0,050 M
Angliavandeniai3150(2 kartai 10^8)250
Amino rūgštys0.4120(3 kartai 10^7)20 pagrindinių ~120 viso
Nukleotidai0.4300(1,2 kartai 10^7)5 pagrindiniai ~100 viso
Lipidai2750(2,5 kartai 10^7)50
Baltymai1540,000(1 kartai 10^6)4,28835–85 000 žmonėms!
RNR6(10^6)(2 kartai 10^4)~2,00035–85 000 žmonėms
DNR1(2,5 kartai 10^9)(1, (4))146 @ 5 imes 10^10 (žmogus)

Įvadas į biochemiją ir molekulinę biologiją

PRIVALOMA SVEIKATOS MOKSLŲ PROGRAMOS.
PASIRENGIMAS MCAT.
UF INTERNETO LAIPSNIO KURSINIAI.

Kurso aprašymas

BCH 4024 (Specialios programos – internete)
BCH 4024 tiria aminorūgščių, baltymų, angliavandenių, lipidų ir nukleorūgščių struktūrą, funkciją ir metabolizmą. Jame pristatomos ląstelės struktūros, replikacijos ir augimo bei medžiagų apykaitos reguliavimo sąvokos. Paskaitų konspektus galima atsisiųsti kaip PDF failus, o kiekvienos paskaitos vaizdo įrašus galima tiesiogiai transliuoti iš UF E-Learning svetainės. Aukščiau pateiktame PDF faile rasite konkrečios informacijos apie testavimą internetu, taip pat galimą mokymą ir egzaminų apžvalgą.

Siūlomi semestrai

Siūloma kiekvieną semestrą ir vyksta tuo pačiu laikotarpiu kaip ir įprasti UF semestrai.

Būtinos sąlygos

CHM 2210 Organinė chemija 1 ir CHM 2211 Organinė chemija 2 (arba jų atitikmenys kituose universitetuose).

Ne laipsnio nuorašas

Visi kursai, kurių studentas nesiekia laipsnio, yra įskaitomi. Jūsų oficialiame nuoraše bus nurodyti kursiniai darbai, kurso numeris, kurso pavadinimas ir gautas įvertinimas. Uždirbtos valandos, pervežtos valandos ir GPA jūsų oficialioje nuorašoje bus rodomos kaip nulis, nes šie laukai yra užpildyti tik UF laipsnio siekiantiems studentams.

Jei planuojate UF laipsnio nesuteikiančius kursinius darbus perkelti į kitą įstaigą, kad gautumėte kreditą, patartina pirmiausia kitoje institucijoje patikrinti, ar kreditas bus priimtas.

Tinkamumas

Reikalavimus atitinkantys studentai yra tie, kurie įstojo į Floridos universiteto nuotolinio mokymosi studijų programą, ir tie studentai, kurių priėmimo statusas nėra baigtas. Jei norite kreiptis, žr. toliau pateiktą informaciją.

Paraiškos Paskutinis pristatymo laikas

Kadangi paraiškų teikimo procesas gali užtrukti iki vieno mėnesio, abi paraiškos turi būti pateiktos iki toliau nurodyto termino, kad galėtumėte užsiregistruoti tam konkrečiame semestre.

– 2021 m. pavasaris: 2020 m. gruodžio 1 d
– Vasara C, 2021: 2021 m. balandžio 15 d
– 2021 m. ruduo: 2021 m. rugpjūčio 1 d

Atkreipkite dėmesį, kad paraiškos, pateiktos pasibaigus terminui, turės būti pateiktos dėl kito semestro priėmimo.


Atsiliepimai

Apžvalgą pateikė Jeffry Nichols, Vusterio valstijos universiteto docentas, 21-06-01

Pateikta medžiaga yra gana panaši į kitus biochemijos vadovėlius, tačiau joje trūksta kai kurių išsamesnio biochemijos teksto (t. y. Lehningerio teksto) detalių. Tai nėra neigiamas dalykas, tik pastebėjimas. Tvarka, kuria. Skaityti daugiau

Apžvalgą pateikė Jeffry Nichols, Vusterio valstijos universiteto docentas, 21-06-01

Išsamumo įvertinimas: 3 žr. mažiau

Pateikta medžiaga yra gana panaši į kitus biochemijos vadovėlius, tačiau joje trūksta kai kurių išsamesnio biochemijos teksto (t. y. Lehningerio teksto) detalių. Tai nėra neigiamas dalykas, tik pastebėjimas. Sąvokų pateikimo tvarka yra skirtinga, bet vėlgi gana išsami.

Turinio tikslumo įvertinimas: 4

Kiek galėjau pasakyti, informacija yra tiksli. Atrodo, kad pavyzdžiai yra nešališki ir suteikia gerą kasdienį ryšį su biochemijos idėjomis.

Aktualumo / ilgaamžiškumo įvertinimas: 3

Tikėtina, kad biochemijos pagrindų ir pagrindų medžiaga nepasikeis, todėl šia prasme jie yra svarbūs. Dėl medžiagos pateikimo būdo, t. y. formatavimo, kartais sunku ją sekti. Lentelės ir paveikslai ne visada yra šalia atitinkamo teksto ir dažnai yra paveikslų / lentelių, esančių prieš teksto skyrių. Vėlgi, tai gali būti formatavimo problema.

Tekstą lengva sekti, dažniausiai vengiama žargono (kol reikia apibrėžti). Kaip minėta pirmiau, nuorodų į lenteles / paveikslus sunku sekti, o kai kurios lentelės / paveikslai atrodo „įstrigę“ atsitiktiniais taškais. Tai pažeidžia teksto aiškumą skaitant.

Kiekvienas skyrius prilimpa prie žinomo išdėstymo ir nuosekliai perveda mokinį per įvairias temas.

Apskritai tekstas gali būti suskaidytas, bet vėlgi, galbūt dėl ​​formatavimo, daugelis nuorodų neveikia, o tai nutraukia srautą. Visuose skyriaus pabaigoje nepavyko gauti jokios nuorodos. pranešimas apie "to bus sukurtas" arba "breiles". Gaila, nes šios nuorodos gali būti naudingos tolesniam tyrinėjimui ir tolesniems darbams atlikti.

Organizacijos / struktūros / srauto įvertinimas: 3

Taip, organizacija yra gana gera, nors aš manau, kad elektronų pernešimas ir elektrochemija turėtų būti įvedami supratus, IŠ KUR šios molekulės atsiranda, ty medžiagų apykaitą, cukrų, riebalų, aminorūgščių skaidymą ir t. t. Tai nereiškia, kad tai "blog", tik ne mano asmeninis pasirinkimas. Ir, kaip minėta anksčiau, lentelių / paveikslų gausa gali būti didžiulė, kai jie ne visada atitinka teksto aptarimą.

Nepavyko gauti nuorodų į darbą, nors atrodo, kad daugelis nuorodų yra „atspausdintos“ pasibaigus visai knygai. Taigi medžiaga gali būti ten, tačiau, kadangi ji šiuo metu yra sudaryta, dėstytojams ar studentams būtų sunku veiksmingai naudotis šiomis nuorodomis.

Gramatinių klaidų įvertinimas: 4

Kiek galiu pasakyti, gramatika yra gera visame tekste.

Kultūrinės svarbos įvertinimas: 4

Vėlgi, iš to, ką perskaičiau, nepastebėjau jokių nejautrių ar įžeidžiančių dalių. Pavyzdžiai buvo aiškūs ir išryškino biocheminius aspektus be būtinybės spręsti socialines ar kitas problemas. (tai gali būti gerai, atsižvelgiant į klasės pobūdį ir mokinių susidomėjimą tuo, kaip mokslas paliečia daugelį mūsų gyvenimo aspektų)

Turiu vilties dėl šios knygos, bet negalėjau pasakyti, ar ši knyga yra reguliariai prižiūrima ar atnaujinama, ar tai tik pagrindas, kuriuo gali remtis kiti. Organizacija nėra ideali, kyla problemų dėl nuorodų ir panašių dalykų, tačiau bendra medžiaga ir aprėptis atrodo gana gerai.

Apžvalgą pateikė Joyce Easter, Virdžinijos Wesleyan universiteto profesorius, 2021-05-31

Pagrindinės sąvokos, kurias nustatė ir apibrėžė ASBMB, apimančios energijos ir medžiagų apykaitą, struktūrą ir funkciją, informacijos saugojimą ir perdavimą, homeostazę ir evoliuciją, yra pakankamai aprėptos bakalauro tyrimo kursui. Skaityti daugiau

Apžvalgą pateikė Joyce Easter, Virdžinijos Wesleyan universiteto profesorius, 2021-05-31

Išsamumo įvertinimas: 4 žr. mažiau

Pagrindinės sąvokos, kurias nustatė ir apibrėžė ASBMB, apimančios energiją ir medžiagų apykaitą, struktūrą ir funkcijas, informacijos saugojimą ir perdavimą, homeostazę ir evoliuciją, yra pakankamai aprėptos biochemijos bakalauro studijų kursui. Apskritai pločio ir gylio pusiausvyra yra gera, tačiau yra keletas temų, kurios yra pernelyg supaprastintos arba trūksta kai kurių pagrindinių dalykų. Pavyzdžiui, skyriuje apie fermentų mechanizmus pateikiami keli geri fermentų ir jų mechanizmų pavyzdžiai, tačiau nėra bendrų sampratų ar bendrų temų, susijusių su fermentų mechanizmais. Žodynėlyje yra daugiau nei 2400 įrašų, daugelis iš kurių yra iliustruoti ir (arba) turi nuorodą į papildomą internetinį šaltinį. Tačiau atsisiųstoje PDF teksto versijoje neveikia mygtukas „Rasti terminą“, nurodantis hipersaitą su terminu tekste.

Turinio tikslumo įvertinimas: 4

Didžioji turinio dalis yra tiksli, tačiau kai kuriuose aprašymuose trūksta detalių, dėl kurių paaiškinimas būtų aiškesnis ir išsamesnis.

Aktualumo / ilgaamžiškumo įvertinimas: 5

Tai gana neseniai išleistas teksto leidimas, kuris buvo atnaujintas, kad būtų įtrauktas mūsų dabartinis biocheminių procesų ir sistemų supratimas, kaip juos suprantame šiandien.

Rašymas tinkamas bakalauro studijų auditorijai ir turi pakankamai grafikos, kad papildytų tekstą. Sąvokos yra aiškiai apibrėžtos pristatant, tačiau išsamus žodynas yra geras šaltinis tiems studentams, kuriems gali prireikti tolesnio pastiprinimo.

Naudojama terminija ir teksto struktūra yra nuosekli, tačiau vaizdų ir grafikos nuoseklumas yra mažesnis dėl vaizdiniam turiniui naudojamų šaltinių ir menininkų įvairovės. Grafikos ženklinimas taip pat nenuoseklus, o kai kuriose figūrose tekstas yra neryškus.

Tekstas suskirstytas į biologines makromolekules, pirmiausia įvedamas sudėtingesnes struktūras, procesus ir kelius. Skyrius galima lengvai priskirti kita tvarka, kad jie atitiktų dėstytojo pageidaujamą kursų tvarką.

Organizacijos / struktūros / srauto įvertinimas: 5

Kiekvienas skyrius sutvarkytas logiškai, atitinkama tvarka pateikiant supratimui reikalingų idėjų įvedimą. Skyriai išdėstyti taip, kad logiška seka būtų pristatomos panašios ir susijusios temos, taip pat turinys, kuris tekste yra anksčiau nei taikomas vėlesniame skyriuje.

Ši knyga iš esmės yra daugiau nei 3600 puslapių PDF failas. Kai failas atsisiunčiamas į mokinio kompiuterį, turinyje esančios hipersaitos nesusieja su failo žymėmis, o tai reiškia, kad šią knygą sunkiau naršyti neprisijungus. Jei norite skaityti tekstą taip, kaip skaitytumėte spausdintą kopiją, tada rasti skyrių pagal puslapio numerį ir perskaityti skyrių yra pakankamai paprasta, tačiau jei norite elektroninio vadovėlio pranašumų, šis tekstas yra labiau ribotas nei kitų elektroninių knygų. tuo atžvilgiu. Hipersaitai į internetinius išteklius (vaizdo įrašus, vaizdus ir kt.) nukreips mokinius į atitinkamą žiniatinklio šaltinį.

Gramatinių klaidų įvertinimas: 5

Patikslintame leidime, kurį daugelį metų naudojo daugelis studentų, jame nėra gramatinių klaidų.

Kultūrinės svarbos įvertinimas: 3

Nors pateikti pavyzdžiai nėra kultūriškai nejautrūs ar įžeidžiantys, pavyzdžiai neapima įvairių rasių, etninių grupių ir kilmės.

Apžvalgą pateikė Quan Wang, Indianos universiteto (Bloomington) mokslo darbuotojas, 21-05-18

Autoriai pateikė išsamią pagrindinių sąvokų aprėptį su pagrindine pirmojo semestro biochemijos koledžo kurso informacija. Aprašymai yra trumpi ir tikslūs. Turėdami daugiau nei 30 metų patirtį klasėje ir jų trejus. Skaityti daugiau

Apžvalgą pateikė Quan Wang, Indianos universiteto (Bloomington) mokslo darbuotojas, 21-05-18

Išsamumo įvertinimas: 5 žr. mažiau

Autoriai pateikė išsamią pagrindinių sąvokų aprėptį su pagrindine pirmojo semestro biochemijos koledžo kurso informacija. Aprašymai yra trumpi ir tikslūs. Turėdami daugiau nei 30 metų patirtį klasėje ir turėdami tris populiarius vadovėlius, autoriai aplanko skaitytojus su intensyviomis nuotraukomis ir nuolat stebi juos, net aiškindami sudėtingus glikolizės ir Krebso citrinų rūgšties ciklo kelius – du iš pagrindinių etapų, vedančių maistas į energiją. Vienas iš svarbiausių knygos akcentų yra „medžiagų apykaitos melodijos“ – sumanūs autorių eilėraščiai ir dainos, padedančios mokiniams įsiminti medžiagą.

Turinio tikslumo įvertinimas: 5

Autoriai suorganizavo knygos informaciją pagal Amerikos biochemijos ir molekulinės biologijos draugijos (ASBMB) apibrėžtas pagrindines sąvokas. Turinys tikslus ir nešališkas.

Aktualumo / ilgaamžiškumo įvertinimas: 5

Šios knygos dabartinė versija (1.3) išleista 2018 m. ir visiškai atnaujinta, atspindinti dalyką, kaip šiandien dėstoma klasėje. Pavyzdžiui, kažkada buvo manoma, kad 3-D baltymų struktūros yra santykinai fiksuotos pagal kristalų struktūrą. Tačiau pastaruoju metu pažengus į kriogeninės elektroninės mikroskopijos (krio-EM) metodus, žmonės nustatė, kad daugelis baltymų turi iš esmės netvarkingą sritį, kuri leidžia jiems lanksčiai bendrauti su įvairesniais partneriais. Ši knyga tinka vieno semestro biochemijos įvadinei klasei.

Septynios „taškas po taško“ dalys yra tos pačios temos skyriaus ir skyriaus santraukos, kurios gali būti naudojamos kaip mokymosi vadovai studentams.

Tekstas yra nuoseklus pagal terminiją ir struktūrą.

Prie knygos pridedami 26 mokomieji „PowerPoint“ failai skirtingomis temomis, taip pat nuorodos į „Youtube“ paskaitas, kurias vedė profesorius Kevinas Ahernas.

Organizacijos / struktūros / srauto įvertinimas: 5

Nuostabu, kad biochemija daugiausia susijusi su tik šešiais jungiamaisiais elementais (iš daugiau nei 100 periodinėje elementų lentelėje). Knyga prasidėjo nuo vandens, kuris yra pats gausiausias kiekvienos ląstelės komponentas su paprastais cheminiais ryšiais. Tada autoriai išplėtė šias temas ir cheminių jungčių pobūdį iki dvidešimties aminorūgščių, kurios sudaro baltymų statybinius blokus, kurie yra visų gyvų audinių pagrindas. O baltymų kūrimo instrukcijos yra genuose, kuriuos sudaro DNR ir su ja susijusi molekulė RNR. Kai tęsiate kursą, sudėtingumas didėja intriguojančiais būdais, tačiau visada yra stebinančių nuorodų į stulbinamą klausimų rinkinį.

Be rašytinio turinio, E-knyga taip pat suteikia prieigą prie vaizdo įrašų paskaitų, interaktyvių mokymosi modulių ir pasukamų 3-D molekulių. Knyga geriausiai tinka (šiuo metu) „iBooks“ (galima naudoti „Mac“ ir „iPad“ kompiuteriuose), todėl skaitytojai spustelėję paveikslėlius juos padidina, žiūrėti kiekvienai temai aktualias vaizdo paskaitas, klausytis pasirinktų dainų ir prisijungti prie interneto daugiau informacijos rasite tiesiog spustelėję bet kurį terminą. Kiti formatai, pvz., PDF ir „Kindle“, suteikia prieigą prie visų hipersaitų, bet ne visos daugialypės terpės. Jei naudojate PDF versiją, galite atsisiųsti Metabolic Melody dainas iš http:www.davincipress.com.

Gramatinių klaidų įvertinimas: 5

Nuo tada, kai knyga pirmą kartą buvo išleista 2016 m., kai ši knyga buvo plačiai naudojama autorių klasėje ir šimtai mokinių ją korektūravo, dabartinėje versijoje (1.3) gramatikos klaidų nerasta.

Kultūrinės svarbos įvertinimas: 5

Ši knyga yra apie chemines reakcijas ląstelėse, o realaus pasaulio pavyzdžiai buvo kruopščiai parinkti, kad nebūtų kultūriškai nejautrūs ar įžeidžiantys.

Susijusios PPT skaidrės ir susijusios „Youtube“ paskaitos, kurias vedė profesorius Kevinas Ahernas, yra gausūs ištekliai ir šią knygą besinaudojantiems mokytojams, ir studentams. 2019 m. profesorius Kevinas Ahernas, pagrindinis šios knygos autorius, išleido internetinį kursą „Biochemija ir molekulinė biologija: kaip veikia gyvenimas“ Didžiųjų kursų svetainėje su toliau pateikta nuoroda: https://www.thegreatcourses.com/fb9572?ai= 180339&cmp=Social_Facebook_Advertising_2019BioChemistry&fbclid=IwAR0AOo9CUYm0ZsXKSCfG9ct5NmoFSSZZ245C50aWbNDY56tSnrGDuv8Rw64

Apžvalgą pateikė Justinas P'Poolas, kviestinis chemijos docentas, Franklino koledžas 21-04-22

Tai išsamus tekstas, kuris gali būti naudojamas vieno semestro įvadui į biochemiją arba dviejų semestrų sekai. Žodynėlis yra išsamus ir iliustruotas, skaitykite daugiau

Apžvalgą pateikė Justinas P'Poolas, Franklino koledžo kviestinis chemijos profesoriaus asistentas, 21-04-22

Išsamumo įvertinimas: 5 žr. mažiau

Tai išsamus tekstas, kuris gali būti naudojamas vieno semestro įvadui į biochemiją arba dviejų semestrų sekai. Žodynėlis yra išsamus ir iliustruotas

Turinio tikslumo įvertinimas: 5

Turinys yra tikslus ir be klaidų.

Aktualumo / ilgaamžiškumo įvertinimas: 5

2018 m. išleistos knygos turinys yra atnaujintas. Šiame tekste pagrindinis dėmesys skiriamas įvadui į medžiagą, kurios pagrindai greičiausiai nepasikeis. Tai palieka erdvę lengvai atnaujinti medžiagą.

Tekstas yra lengvai skaitomas, paaiškinamos santrumpos ir terminija.

Tekstas viduje nuoseklus.

Skyrius sudaro daug temų su mažesnėmis antraštėmis, todėl kiekvieną skyrių galima pritaikyti atsižvelgiant į skaitymo užduotis. Skiltys „Taškas po taško“ taip pat bus labai naudingos studentams, kad jie galėtų greitai peržiūrėti.

Organizacijos / struktūros / srauto įvertinimas: 5

Knygos eiga yra logiška eiga, bet nesudėta taip, kad būtų sunku pritaikyti medžiagų tvarką.

Visi vaizdai yra aiškūs ir neiškraipyti. Tačiau kaip pdf, naršymas yra šiek tiek sunkesnis, nes neveikia navigacijos nuorodos. Mokiniai neturės šios problemos, jei naudosis iPad ar panašiu įrenginiu.

Gramatinių klaidų įvertinimas: 5

Knygoje nėra gramatinių klaidų

Kultūrinės svarbos įvertinimas: 5

Tai ne tik išsami knyga, bet ir gerai parengti galios taškai. Daugelyje teksto temų yra santraukų skyriai, leidžiantys mokiniams greitai peržiūrėti, taip pat skambios dainos, kurios daugeliui bus naudingos kaip įsiminimo šaltinis. Dėl medžiagų derinio tai puikus atviros prieigos šaltinis, kurį naudosiu savo klasėje.


Kontūras

1 blokas: ląstelės, vanduo ir buferiai

  • 1 pamoka: įvadas į biochemiją ir biocheminių tyrimų literatūrą
  • 2 pamoka. Ląstelės: biochemijos biografija
  • 3 pamoka: vanduo
  • 4 pamoka: pH ir buferiai
  • 1 pamoka: energijos reakcijos
  • 2 pamoka: termodinamika
  • 3 pamoka: ląstelių fosforilinimas ir elektronų pernešimas
  • 4 pamoka: energijos vartojimo efektyvumas
  • 5 pamoka: Metabolizmo kontrolė

3 skyrius: struktūra ir funkcijos

  • 1 pamoka: Baltymai
  • 2 pamoka: Nukleino rūgštys
  • 3 pamoka: angliavandeniai
  • 4 pamoka: lipidai
  • 5 pamoka: membranos ir transportas
  • 6 pamoka: vitaminai ir kofaktoriai
  • 1 pamoka: aktyvinimo energija
  • 2 pamoka: fermentų katalizė
  • 3 pamoka: fermentų kinetika
  • 4 pamoka: fermentų slopinimas
  • 5 pamoka: Fermentų kontrolė

5 skyrius: Genetinės informacijos srautas

  • 1 pamoka: DNR replikacija
  • 2 pamoka: DNR taisymas
  • 3 pamoka: transkripcija
  • 4 pamoka: transkripcijos reguliavimas
  • 5 pamoka: RNR apdorojimas
  • 6 pamoka: Vertimas
  • 1 pamoka: medžiagų apykaitos sąvokų apžvalga
  • 2 pamoka: glikolizė, fermentacija ir gliukoneogenezė
  • 3 pamoka: citrinos rūgšties ir glioksilato ciklai
  • 4 pamoka: Acetil-CoA ir cholesterolio metabolizmas
  • 5 pamoka: Ketoniniai kūnai
  • 6 pamoka: riebalų rūgščių oksidacija ir sintezė
  • 1 pamoka: angliavandenių saugojimas ir skaidymas
  • 2 pamoka: Pentozės fosfato kelias
  • 3 pamoka: Kalvino ciklas
  • 4 pamoka: Karbamido ciklas
  • 5 pamoka: Azoto fiksavimas
  • 6 pamoka: aminorūgščių metabolizmas ir katabolizmas
  • 7 pamoka: Nukleotidų metabolizmas ir de novo Biosintezė
  • 1 pamoka: ląstelių signalizacija
  • 2 pamoka: ligandiniai jonų kanalų receptoriai
  • 3 pamoka: Branduoliniai hormonų receptoriai
  • 4 pamoka: G-baltymų susieti receptoriai (GPCR)
  • 5 pamoka: tirozino kinazės receptoriai (RTK)

9 skyrius: Biocheminiai metodai

  • 1 pamoka: ląstelių ardymas ir frakcionavimas
  • 2 pamoka: chromatografija
  • 3 pamoka: elektroforezė
  • 4 pamoka: Blotavimas
  • 5 pamoka: DNR metodai

10 skyrius: Biochemijos sąvokų sintezė


Absolventų kursų pasiūlymai UP

Norėdami gauti naujausią kursų pasiūlymų sąrašą pagal semestrą, apsilankykite MSU kursų tvarkaraščio puslapyje: www.schedule.msu.edu

Kursas: BMB 801 "Molekulinė biologija" UP Aprašymas: Genų organizavimas. Genų ekspresijos, replikacijos ir rekombinacijos reguliavimas. Siūlomas (-i) semestras (-iai): Kiekvienų metų ruduo Kreditai: 3 Rekomenduojamas pagrindas: BMB 462, CEM 383 Naujausia programa: 2019 m. ruduo (PDF) Ankstesnis: 2017 m. ruduo (PDF) Kursas: BMB 802 "Metabolinis reguliavimas ir signalų perdavimas Aprašymas:"ole medžiagų apykaitos reguliavimo pagrindas. Molekuliniai signalizacijos mechanizmai ir alosterinių bei kovalentinių baltymų modifikacijų mechanizmai. Siūlomas (-i) semestras (-ai): Kiekvienų metų pavasaris Kreditai: 3 Rekomenduojamas pagrindas: BMB 801 Naujausia programa: 2021 m. pavasaris (PDF) Ankstesnis: 2020 m. pavasaris (PDF) Kursas: BMB 803 "Proteinų struktūra ir funkcijos" UP Aprašymas: Baltymų struktūra ir santykiai funkcija struktūrai. Kinetinių metodų taikymas fermentų mechanizmams ir reguliavimui išsiaiškinti. (PASTABA: Šis kursas skirtas ne BMB programų studentams, kurie nori gauti baltymų struktūros kursą, bet kuriems nereikia mokytis fermentų mechanizmų. NĖRA skirtas biochemijos specialybėms arba studentams, kurie jau turi BMB 805 kreditą.) Semester( s) siūlomi: kiekvienų metų pavasaris (1 dešimt semestro savaičių) Kreditai: Iš viso kreditų: 2 paskaitų / deklamavimo / diskusijų valandos: 2 rekomenduojamos žinios: BMB 462 ir CEM 383 Naujausia programa: 2020 m. pavasaris (PDF) Ankstesnis: Pavasaris 2019 (PDF) Kursas: BMB 805 "Proteinų struktūra, dizainas ir mechanizmas" UP Aprašymas: Baltymų architektūra, dinamika, lankstymas, stabilumas ir evoliucija. Konformaciniai pokyčiai, ligandų surišimas ir kinetika. Fermentų mechanizmų išaiškinimas. Siūlomas (-i) semestras (-ai): kiekvienų metų pavasaris Kreditai: 3 Rekomenduojamas pagrindas: BMB 462 ir CEM 383 Naujausia programa: 2020 m. pavasaris (PDF) Ankstesnis: 2019 m. pavasaris (PDF) Kursas: BMB 816 "Integracinė toksikologija: mechanizmai ir reguliavimas, patologija (patologija) Tarpžinybinis su PHM) UP Aprašymas: Biocheminiai, molekuliniai ir fiziologiniai toksikologijos mechanizmai. Pagrindinių organų sistemų funkciniai ir patologiniai atsakai į cheminį įžeidimą. Mutagenezės, kancerogenezės ir reprodukcinės toksikologijos mechanizmai. Rizikos ir saugos vertinimo sampratos. Siūlomas (-i) semestras (-iai): nelyginių metų rudenį Kreditai: 3 Būtina sąlyga: PHM 819 Naujausia programa: 2019 m. ruduo (PDF) Kursas: BMB 825 "Ląstelių struktūra ir funkcijos" (Tarpžinybinis su MMG ir PSL) UP Aprašymas: Molekulinis pagrindas . Ląstelių savybės: dauginimasis, dinamiškas organizavimas, integravimas, programuojamas ir integruojamas informacijos perdavimas. Originalūs tyrimai visose penkiose karalystėse. Siūlomas (-i) semestras (-ai): kiekvienų metų pavasaris Kreditai: 3 Rekomenduojamas fonas: BMB 401 arba BMB 461. Naujausia programa: 2020 m. pavasaris
Ankstesnis: 2018 m. pavasaris (PDF) Kursas: BMB 829 "Makromolekulinės analizės ir sintezės metodai" UP Aprašymas: Makromolekulių išskyrimo ir apibūdinimo būdai. Kompiuterio naudojimas makromolekulių struktūros ir funkcijų analizėje. Siūlomas semestras (-ai): Kiekvienų metų rudenį Kreditai: 2 Rekomenduojamas fonas: BMB 462 arba tuo pačiu metu. Naujausia programa: 2019 m. ruduo Ankstesnis: 2017 m. ruduo (PDF) Kursas: BMB 855 "Specialios problemos" UP Aprašymas: Laboratoriniai arba bibliotekos tyrimai specialioms biochemijos problemoms spręsti. Siūlomas (-i) semestras (-ai): kiekvienų metų ruduo, pavasaris ir vasara. Kreditai: 1-4 Apribojimai: Skyriaus tvirtinimas. Studentas gali uždirbti ne daugiau kaip 8 kreditus iš visų registracijų į šį kursą. Kursas: BMB 856 "Augalų molekulinė ir ominė biologija" (Tarpžinybinė su PLB, CSS. Administruoja PLB.) UP Aprašymas: Naujausi aukštųjų augalų genetikos ir molekulinės biologijos pasiekimai. Siūlomas (-i) semestras (-iai): 2021 m. pavasaris, o vėliau kiekvieną pavasario semestrą Kreditai: 3 Rekomenduojamas fonas: ZOL 341 Naujausia programa: 2021 m. pavasaris (PDF) Tvarkaraštis: 2018 m. ruduo (PDF) --> Ankstesnis: 2019 m. ruduo (PDF) Kursas: BMB 864 "Augalų biochemija" (Tarpžinybinis su PLB) UP Aprašymas: Unikali fotosintetiniams organizmams būdinga biochemija. Fotosintetinis ir kvėpavimo elektronų transportavimas, azoto fiksavimas, anglies dioksido fiksavimas, lipidų metabolizmas, anglies skaidymas, ląstelių sienelės, sieros ir azoto metabolizmas ir specializuotas metabolizmas, įskaitant izoprenoidus, fenilpropanoidus ir alkaloidus. Siūlomas (-i) semestras (-iai): 2017 m. rudenį, o po to TBD Kreditai: 3 Rekomenduojamas pagrindas: (BMB 401 arba BMB 462) ir ankstesnis augalų fiziologijos bakalauro kursas. Naujausia mokymo programa: 2017 m. ruduo (PDF)
Ankstesnis: 2016 m. ruduo (PDF) Kursas: BMB 866 „Molekulinė augalų fiziologija“ (tarpžinybinė su PLB) UP Aprašymas: PLB 866 skirtas molekulinių augalų mokslų programos pirmo kurso absolventams, tačiau yra atviras visiems, norintiems visapusiško molekulinių augalų fiziologijos gydymo. . Tai yra pagrindinis MPS programos kursas ir daroma prielaida, kad studentas bus išklausęs PLB 856. Šio kurso temos šiame kurse nebus kartojamos. Pagrindinės temos bus molekuliniai (įskaitant biocheminius) augalų fiziologijos aspektus, įskaitant ląstelių biologiją, fotosintezę, ląstelių sienelių metabolizmą, lipidų apykaitą ir kitas temas. Kiekybinis augalų procesų supratimas bus pabrėžiamas atliekant namų darbų pratimus. Siūlomas (-i) semestras (-iai): 2020 m. rudenį, o vėliau kiekvieną rudens semestrą Kreditai: 3 Rekomenduojamas fonas: Įstojo į augalų molekulinių mokslų studijų programą. Išplėstinis biochemijos arba augalų fiziologijos bakalauro kursas. Naujausia programa: 2019 m. pavasaris (PDF) Kursas: BMB 888 "Laboratorijos rotacija" UP Aprašymas: Dalyvavimas mokslinių tyrimų laboratorijose, siekiant išmokti eksperimentinių metodų ir metodų, išplėsti mokslinių tyrimų patirtį ir įvertinti mokslinių interesus prieš pasirenkant baigiamąjį darbą ar disertacijos patarėją. Siūlomas (-i) semestras (-ai): kiekvienų metų ruduo, pavasaris ir vasara Kreditai: 1–4 Apribojimai: Galimi tik biochemijos absolventai. Studentas gali uždirbti ne daugiau kaip 12 kreditų iš visų registracijų į šį kursą. Kursas: BMB 899 "Magistro baigiamojo darbo tyrimas" UP Aprašymas: Magistro baigiamojo darbo tyrimas. Siūlomas (-i) semestras (-ai): kiekvienų metų ruduo, pavasaris ir vasara Kreditai: 1-12 Apribojimai: Atvira tik biochemijos magistrantams. Studentas gali uždirbti ne daugiau kaip 36 kreditus iš visų registracijų į šį kursą.

Kursas: BMB 960 "Pasirinktos biochemijos temos I" UP Aprašymas: Pasirinktos biochemijos temos su reikšmingais studentų pristatymais Siūlomas(-i) semestras(-ai): Kiekvienų metų ruduo ir pavasaris Kreditai: 1-3 Apribojimai: Atvira Biochemijos ir molekulinės katedros magistrantams Biologija arba skyriaus patvirtinimas. Studentas gali uždirbti ne daugiau kaip 7 kreditus iš visų registracijų į šį kursą. Kursas: BMB 960 Sect 301 "Augalų biotechnologijų tyrimų forumas" UP Siūlomas(-i) semestras(-ai): Ruduo (pirmosios 8 semestro savaitės)
Kreditai: 1 Apribojimai: Tik Biochemijos magistrantams arba dėstytojo patvirtinimas Aprašymas:

Tai pažangus seminaras, kuriame daugiausia dėmesio skiriama literatūros skaitymui ir studentų pranešimams augalų biotechnologijų temomis. Temų sritys apskritai sprendžia šiuolaikines žmonių sveikatos ir aplinkos tvarumo problemas. Konkrečiai, praeityje sritys apėmė lipidų produktyvumo didinimą riebaliniuose mikrodumbliuose, sintetinę biologiją ir mikrobų biosintezę pramoniniu požiūriu, abiotinio streso toleranciją kaip agronominį požymį ir jo kiekybinį įvertinimą, elektroniniu būdu valdomus mikroorganizmus, augalų metabolizmo organizavimą, funkciją ir evoliuciją bei sintetinė biologija ir kosmoso tyrinėjimų ateitis. Kursas yra augalų biotechnologijų mokymo programos „Augalai sveikatai ir tvarumui“ (https://plantmetabolism.natsci.msu.edu/) dalis, tačiau mokymų programoje nedalyvaujantys studentai taip pat labai laukiami. Patvirtinti kasmetinio simpoziumo apie augalų biotechnologiją sveikatai ir tvarumui pranešėjai yra pramonės, mokslinių tyrimų fondų, nacionalinių laboratorijų ir akademinės bendruomenės atstovai.

Kurso tikslai – didinti mokslinės literatūros skaitymo ir žodinio pristatymo įgūdžius bei parengti studentus dalyvauti susijusiame augalų biotechnologijų simpoziume (https://plantmetabolism.natsci.msu.edu/posts/save-the-dates-2019). -kasmetinis simpoziumas/. SVARBU: Dalyvavimas simpoziume, kuris vyks spalio 31–lapkričio 2 d., bus privaloma kurso dalis.

Kiekvienos pamokos metu du mokiniai skaitys pranešimus pagal 2-3 paskelbtus darbus. Temos ir pranešimai bus atrinkti pagal pranešėjų pateiktas temas ir susijusias su jų kilme, todėl kiekvienais metais skirsis. Kursai vyks kartą per savaitę 6-8 savaites. Tikroji kurso diena / laikas / vieta yra trečiadieniais 15:00–16:30, MPS2060. Nors dėstytojai pateiks studentams siūlomas temas ir referatus, studentai raginami daugiau nei siūlomi leidiniai.

Jei nesate paskelbtas biochemijos absolventas, turėsite pateikti internetinę nepaisymo užklausos formą (http://bmb.natsci.msu.edu/undergraduate/override-request-special-permissions-form/) ir susisiekti su instruktoriai (dr. Björn Hamberger, [email protected], Greg Bonito, [email protected], Rob Last, [email protected]) dėl leidimo registruotis. Dalyvauja 14 studentų.

Kursui ir simpoziumui įvertinti bus naudojamas klasės susitikimas po kasmetinio simpoziumo apie augalų biotechnologiją sveikatai ir tvarumui. Tikimės, kad kiekvienas studentas aktyviai dalyvaus simpoziume.

Formatas: per kiekvieną klasės susitikimą du mokiniai pasakys 25+5 pristatymus ir diskusiją pagal paskirtas temas. Siūlome perskaityti mūsų išvardytus straipsnius, kad galėtumėte pradėti. Nedvejodami įtraukite kitus straipsnius, knygų skyrius ar internetinius išteklius skaitydami ir ruošdami pristatymą.

Siūlomas bendras formatas: 5 colių įvadas, tinkamas studentams, susipažinusiems su molekulinėmis technikomis, bet tinkamas įvairių išsilavinimo studentams. 15 colių diskusijos apie pagrindinius eksperimentus, prireikus pabrėždami pagrindines biologines įžvalgas ir pritaikymą. 5 colių išvadų, įskaitant ateities eksperimentinių ir inžinerinių metodų idėjas, įžvalgas ir idėjas jūsų tyrimams, kuriuos jums suteikė darbas, arba bet ką kitą, kas galėtų būti įdomu klasės nariams. 5&rsquo atviros diskusijos, moderuojamos pranešėjos

Įvertinimas bus pagrįstas klasės dalyvavimu (30 %) ir tyrimo pristatymu (70 %).
Kursų medžiaga bus prieinama užsiregistravusiems studentams adresu D2L.msu.edu.

Programa: 2019 m. ruduo (PDF) Ankstesnis: 2018 m. ruduo (PDF) Kursas: BMB 960 001/GEN 800 001 "Genetinės aplikacijos maisto saugumui gerinti" UP Siūlomas(-i) semestras(-iai): 2017 m. ruduo Kreditai: 1 Aprašymas: Aplankytas pasaulis iki 2050 m. pasieks 9 milijardus žmonių, maisto saugumo klausimai tampa vis aktualesni. Šio kurso metu studentai bus supažindinti su būdais, kuriais genetikos ir genomikos įrankiai naudojami siekiant pagerinti pasėlių ir gyvulininkystės gamybą besikeičiančiame pasaulyje. We plan to investigate how -omics and other &ldquobig data&rdquo studies in particular can provide solutions to relevant issues such as climate change, antibiotic resistance, animal welfare concerns, and human malnutrition. Throughout the semester, students will be asked to present scientific papers related to these topics, prepare questions, and moderate class discussion. In addition, a component of this seminar will be focused on improving students&rsquo science communication skills to the general public and understanding how genetic research has manifested in science policy. Syllabus: Fall 2017 (PDF) Course: BMB 960 "Photosynthesis" UP Semester(s) offered: Spring of every year (May vary in the future. Please visit the schedule of courses page for updates: www.schedule.msu.edu) Credits: 3 Restrictions: Approval of the Instructor (Limited to 12 students) Description: The course will focus on the mechanisms and measurements of photosynthetic energy capture, CO2 fixation and production of energy-rich molecules, as well as the limitations and possible improvements to these processes for food and fuel. The course is designed to meet the needs of MSU graduate students with projects related to photosynthesis and integrate knowledge across a range of disciplines, ranging from chemistry and biophysics of light capture, metabolisms, bioenergy and cell biology, through synthetic biology and gene discovery. Each set of lectures will start with background and move to higher-level discussion based on literature and applications (e.g. scientific measurements, data analyses, etc.). Course evaluation will be by research-related presentations and a final poster session that demonstrates the integration of new knowledge of photosynthesis in on-going research projects. NOTE: To reserve a spot in this course, you will first need to contact Dr. David Kramer at [email protected] and you'll also need to complete the BMB Course Override link. Syllabus: Spring 2020 Previous: Spring 2017 (PDF) Course: BMB 960 "Intersection of Mitochondrial Science and Medicine " UP Semester(s) offered: Spring 2018 Credits: 1 Description: BMB and the MSU Center for Mitochondrial Science and Medicine will offer a graduate level seminar course (BMB 960) in Spring Semester 2018 on the topic of &ldquoIntersection of Mitochondrial Science and Medicine,&rdquo with the objective of exploring mitochondrial biochemistry in the context of the current field of mitochondrial medicine, including clinical correlations. The course will feature a combination of faculty and student presentations and consider topics such as: impact of nuclear and mitochondrial DNA mutagenesis and variability on organismal function, regulation of respiration and mitochondrial transcription by cell signaling, role of mitochondria in memory and neurodegenerative disease and the general field of mitochondrial health, oxidative stress and stress response, toxicity and disease. Syllabus: Spring 2018 (PDF) Course: BMB 961 "Selected Topics in Biochemistry II" UP Semester(s) offered: Fall and Spring of every year Credits: 1-3 Restrictions: Open to graduate students in the Department of Biochemistry and Molecular Biology or approval of department. Description: Selected topics in Biochemistry with faculty lectures, laboratory, or other instruction Course: BMB 961 "Genomics and Proteomics and Complex Genetic Systems" UP Semester(s) offered: Fall of even years Credits: 2 Restrictions: Restricted to Biochemistry Graduate Students or Approval of the Instructor Prerequisites: BMB 801 or instructor approved equivalent Description: Coming Soon NOTE: If you are NOT a Biochemistry major, you must contact Dr. John Lapres ([email protected]) for approval. (NOTE: Please fill out this override request form and then contact the instructor: https://bmb.natsci.msu.edu/undergraduate/override-request-special-permissions-form/). Syllabus: Fall 2016 (PDF) Course: BMB 961 "Metals in Biology" UP Semester(s) offered: Varies - please check the schedule of courses page for updates: www.schedule.msu.edu Credits: 2 Restrictions: Restricted to Biochemistry Graduate Students or Approval of the Instructor Description: Sec 004-Topic: "Metals in Biology" is intended for graduate students with backgrounds in biochemistry, molecular/cellular biology, microbiology, and/or chemistry. (May be cross-listed with the MMG and CMB departments.) In this course we will discuss the roles of metals in biological systems, including metalloenzymes, metallocenter biosynthesis, metal transport, metal toxicity, and metaloregulation. Discussions will focus on the catalytic mechanisms as well as they way in which the different protein environments 'tune' their active site. Student presentations will be an important emphasis in this class. Syllabus: Spring 2021
Schedule: Spring 2021 Previous: Spring 2020 Course: BMB 961 "Concepts in Protein Structure & Modeling" (formally "Protein Structure Analysis and Modeling") UP Semester(s) offered: Usually offered in Spring (check www. schedule.msu.edu for updates) Credits: 2 Prerequisites: Biochemistry 803 or detailed knowledge of protein and nucleic acid sequences and structures some use of computers and permission of the instructors. Description: This is a hands-on, project-oriented course dealing with several aspects of protein structure analysis and modeling. We will go through UNIX basics and some of the most commonly used graphics software packages for visualizing and manipulating macromolecule structures. Then we will look at the databases of three-dimensional structures of proteins which are determined by X-ray Crystallography and NMR and how one can assess the quality of these structures. This will be followed by identifying and aligning homologous protein sequences and structures analyzing superimposed crystal structures and ligand binding determinants, and designing mutations. Then we will cover the various methods for protein structure prediction such as homology modeling and fold recognition followed by methods for RNA structure prediction. We will be using well tested and documented tools which are available online and other programs which are installed on our UNIX workstations. Lectures will cover the theory and demonstrate the computer methods used lab hours will provide hands-on experience. NOTE: For more information and permission to enroll, please contact Kaillathe (Pappan) Padmanabhan ([email protected]). Please also submit an override request at https://bmb.natsci.msu.edu/undergraduate/override-request-special-permissions-form/ Syllabus: Spring 2017 (PDF) Course: BMB 961 sec 301 "Gaps, Missteps, and Errors in Statistical Data Analysis" UP Semester(s) offered: Fall every year Credits: 1 Restrictions: Restricted to Biochemistry Graduate Students or Approval of the Instructor. If you are not a declared Biochemistry graduate student, please contact the course instructor, Dr. Arjun Krishnan ([email protected]), and then submit the online override request form found here: https://bmb.natsci.msu.edu/undergraduate/override-request-special-permissions-form/. Prerequisites: This is *not* an introductory course in statistics or programming. We will assume: 1) Familiarity with basic statistics & probability. 2) Ability to do basic data wrangling, analyses, & visualization using R or Python.
&bull Strongly recommended MSU courses: CMSE 201 and CMSE 890 Sec 301-or-304 and Sec 302.
Description: Please fill out the course survey to: a) express your interest, b) find out if this course is right for you, and c) provide early input: https://bit.ly/bmb961_nov18_survey
This is an advanced short (1-credit) course designed to:
1) Discuss common misunderstandings & typical errors in the practice of statistical data analysis.
2) Provide a mental toolkit for critical thinking and enquiry of analytical methods and results.

Classes will involve lectures, discussions, hands-on exercises, and homework about concepts critical to the day-to-day use and consumption of quantitative/computational techniques.

Topics
Underpowered statistics &bull Pseudoreplication &bull P-hacking & multiple hypothesis correction &bull Difference in significance & significant differences &bull Base rates & permutation tests &bull Regression to the mean &bull Descriptive statistics & spurious correlations &bull Estimation of error and uncertainty &bull (Others under consideration Subject to small changes) Course Flyer: /sites/_bmb/assets/File/syllabi/BMB961-301_Nov18_Flyer.pdf Syllabus: Coming Soon Course: BMB 961 "Drug Discovery and Medicinal Chemistry" UP Semester(s) offered: Please check the schedule of courses page for current information (www.schedule.msu.edu) Credits: 2 Restrictions: Open to doctoral students in the Departments of Biochemistry, Chemistry, Pharmacology and Toxicology or approval of department. Description: Fundamentals of pharmaceutical drug discovery including basic chemistry, drug-design principles, high throughput screening, computational modeling, and drug metabolic pathways. If you are unable to enroll on your own, or are an undergraduate student, you will need to submit the BMB online course override form found in the 'Undergraduate' tab drop down menu on the BMB Dept website homepage: www.bmb.natsci.msu.edu and then contact Dr. KinSing ([email protected]) for approval to enroll.

Syllabus: Academic Year 2020-2021 NOTE: Course is taught in conjunction with PHM 809. Course: BMB 978 Seminar in Biochemistry UP Semester: Fall of every year, Spring of every year Credits: Total Credits: 1 Reenrollment Information: A student may earn a maximum of 8 credits in all enrollments for this course. Restrictions: Open only to graduate students in the Department of Biochemistry and Molecular Biology. Description: BMB Colloquium seminars on biochemistry research mainly with visiting scientists. Seminars are held each Thursday from 11:00 AM - 12:00 PM in room 101, Biochemistry.


Bakalauro kursai

Course Coordinator – Fall/Spring: Lauren Douma, Ph.D. Course Coordinator – Summer: William L. Zeile, Ph.D.
Room: R3-252 ARB Room: R3-206A
Phone: 352-294-8693 Phone: 352-294-4974
E-mail: [email protected] E-mail: [email protected]

Course Description: BCH 4024 surveys the structure, function, and metabolism of amino acids, proteins, carbohydrates, lipids, and nucleic acids. It introduces concepts in cell structure, replication and growth, and metabolic regulation.

Būtinos sąlygos: Organic Chemistry (CHM 2210 and 2211, CHM 2215 and 2216, or their equivalents at other universities) or consent of course coordinator. In certain cases, with permission, CHM 2211 or CHM 2216 may be taken concurrently. CHM 2200 is NOT an acceptable prerequisite for BCH 4024.

BCH 4024, Spring 2021
M-T-W-F (4th and 6th periods)
Room N2-200 (2nd floor Stetson Medical Sciences Bldg Auditorium)

BCH 4024, Fall 2020
M-T-W-F (4th and 6th periods)
Room N2-200 (2nd floor Stetson Medical Sciences Bldg Auditorium)

BCH 4024, Summer A/C 2021
BCH 4024, Summer A/C 2021, Calendar
Days: M-T-W-F
Time: 2nd period, 9:30am – 10:45am
Location: Medical Sciences Building (MSB) Room N2-200

BCH4905 (sec SC4L) Science for Life Research Seminar Course

1 credit
R, 8th period (Fall)

This research seminar course will introduce students to the many research opportunities available to them in bench, field and computer laboratories across all STEM and Health disciplines on campus. Each week, three faculty members will discuss their research focus, how and why they study the systems they do, and the broader impacts of their work. These brief presentations are designed to offer students a deeper awareness and understanding of the breadth of interdisciplinary research ongoing at UF (and globally), and to inspire, encourage, and facilitate student interest in exploring the many opportunities to engage in research at this world-class research university.

Students majoring in STEM fields will find this course to be engaging and valuable. However, non-STEM majors with a strong background in high school science and a passion for research will also benefit from the multi-disciplinary research and guidance offered by the presenters in this course. All students will have the opportunity to enhance their scientific literacy, active listening, and critical thinking skills.

Course Coordinator: Mary Jo Koroly, Ph.D. [email protected]

Research Experience-Based Courses

BCH 4905 Biochemistry Senior Research
1-7 credits Offered each semester (sections for both IDS students and undergraduate students in general)


Biochemistry Careers


This is an image of a biochemist working in a laboratory.

In order to be a competent biochemist, one must be interested in biology or chemistry research and learn proper laboratory skills and safety procedures. It is also important to have an aptitude for mathematics and statistics, and be able to analyze the data generated from experiments. The ability to think outside the box and brainstorm new ideas is important for designing experiments. Biochemists must also keep up with the scientific literature by reading recent publications in scientific journals and attending conferences. Although it takes a lot of hard work, training, and study, biochemists are able to uncover new information about the chemistry of living things and contribute to advancing scientific knowledge.


Bakalauro kursai

The structure and function of biological molecules, enzymology, metabolism and bioenergetics, and recombinant DNA technology.

The structure and function of biological molecules, enzymology, metabolism and bioenergetics, and recombinant DNA technology.

Seminars, readings, and discussions of topics related to biochemistry, biotechnology, and molecular biology. Scientific writing will be emphasized, and visits to laboratories may be scheduled.

Seminars, readings, and discussions of topics related to biochemistry, biotechnology, and molecular biology. Scientific writing will be emphasized, and visits to laboratories may be scheduled.

Selected topics in biochemistry, molecular biology, genetics, and biotechnology involved in modern medicine. Includes cloning, stem cells, endocrinology, human genetics, gene testing, and human population genetics. Bioethical issues will also be discussed. Both formal lectures and discussion…

A focus on the remarkable impact that genome sequencing projects is having on virtually all aspects of biochemistry, as well as on medicine and biotechnology. An introduction to a broad range of 'omic' topics, including functional genomics, microarrays, proteomics, physiological genomics, and…

A focus on the remarkable impact that genome sequencing projects is having on virtually all aspects of biochemistry, as well as on medicine and biotechnology. An introduction to a broad range of 'omic' topics, including functional genomics, microarrays, proteomics, physiological genomics, and…

A comprehensive treatment of biochemistry and molecular biology stressing structures of biological molecules, including proteins, nucleic acids, carbohydrates, and lipids, enzymology and selected aspects of metabolism and bioenergetics.

A comprehensive treatment of biochemistry and molecular biology stressing aspects of metabolism, metabolic regulation, bioenergetics, and recombinant DNA methodologies.

Basic techniques in biochemistry and molecular biology, including enzyme assays and purification, nucleic acid purification and characterization, chromatography, spectroscopy, and other modern methods.

The principles of physical chemistry applied to biological molecules and systems, including current approaches in structural biology.

Integrated treatment of human biochemistry and selected topics on the biochemical basis of human disease. Examples will be given of inheritable and acquired disorders.

Various topics in human biochemistry and pathophysiology.

Examination of the mechanistic basis of inherited and acquired human disorders at the molecular level. Background into the cellular pathways involved in each disease will be presented as well as discussion of recent advances in research and therapeutics.

Examination of the mechanistic basis of inherited and acquired human disorders at the molecular level. Background into the cellular pathways involved in each disease will be presented as well as discussion of recent advances in research and therapeutics.

Instrumental aspects of NMR spectroscopy including pulsed Fourier transform techniques, proton and carbon-13 techniques used in the analysis of organic compounds, polypeptides and other small molecules. The focus is on the operation of NMR spectrometers presently available in the University of…

Principles and instrumental aspects of NMR spectroscopy, including pulsed Fourier transform techniques, proton and carbon-13 techniques used in the analysis of organic compounds, polypeptides and other small molecules. Students also learn to operate NMR spectrometers in the Chemistry Department…

Applied aspects of biochemistry and molecular biology in various fields, with emphasis on the use of recombinant DNA methods and protein engineering.

Molecular and biochemical regulation of plant metabolic pathways activated in response to environmental cues, environmental stress, and interaction with pathogenic and symbiotic organisms. Cell wall formation (primary wall, wood), secondary metabolism (lignin, flavonoids, phenolics), wounding,…

The objective of these courses is to train students in the basic techniques used in biochemistry and molecular biology, and the application of the scientific method. Students typically become part of a dynamic research environment and gain experience in both the experimental approach and the…

The objective of these courses is to train students in the basic techniques used in biochemistry and molecular biology, and the application of the scientific method. Students typically become part of a dynamic research environment and gain experience in both the experimental approach and the…

The objective of these courses is for students to conduct research projects in a team of undergraduate researchers, their faculty mentors, and other scientists such as graduate students, postdoctoral associates, and faculty collaborators. Students will develop research skills, including…

The objective of these courses is to train students in the basic techniques used in biochemistry and molecular biology, and the application of the scientific method. Students typically become part of a dynamic research environment and gain experience in both the experimental approach and the…

The objective of these courses is to train students in the basic techniques used in biochemistry and molecular biology, and the application of the scientific method. Students typically become part of a dynamic research environment and gain experience in both the experimental approach and the…


Introduction to Biochemistry

A question pack on biochemistry in the context of anatomy and physiology. Content courtesy of the Open Learning Initiative.

An ion can be best described as which of the following:

A collection of electrons

An atom with an altered number of electrons

Rank the order of length scales from smallest to largest:

insulin (a protein ̦which is a molecule)

Refer to a periodic table. Which of the atoms in tryotophan is the most electronegative?

Refer to a periodic table. What is the molecular mass of tryptophan in amu (also called Daltons)?

Refer to a periodic table. Estimate the mass of glucose C 6 _6 6 ​ H 12 _ <12>1 2 ​ O 6 _6 6 ​ using the information in the periodic table

Tryptophan is an essential amino acid which is used in proteins and in amino acid derived hormones. The structure is important, but for now we will focus on the atoms involved. The molecular formula is

Which of the following atoms are present in tryptophan?

A molecule would best be described as:

A stable bond between atoms of at least 2 different elements.

A stable bond between 2 atoms of the same element

A charged molecule made up of more than one atom

the first 2 responses are correct.

All three responses are correct.

Identify the type of bond:

DNA is a negatively charged molecule that binds with calcium (Ca2+) and magnesium (Mg2+)

Identify the type of bond:

Within a protein, amino acids are linked by the bonding of carbon (C) to nitrogen (N)

Which of the following is a correct statement?

Only covalent bonds lead to molecules that are stable in air.

Covalent bonds only occur between atoms of similar electronegativies while ionic bonds only occur between atoms of differing electronegativities.

Ionic bonds do not share valence electrons while covalent bonds do.

Only ionic bonds lead to molecules that are stable in air.

The partial negative charge at one end of a water molecule is attracted to the partial positive charge of another water molecule. This attraction is called:


10 Questions for Incredible Learning

Inorganic substances, such as water, mineral salts, molecular oxygen and carbon dioxide, are small molecules made up of few atoms. Organic substances, in general, such as glucose, fatty acids and proteins, are much more complex molecules made of sequences of carbons bound in carbon chains. The capacity of carbon to form chains is one of the main chemical facts that allowed for the emergence of life on the planet.

3. What are the most important inorganic molecular substances for living organisms?

The most important inorganic substances for living organisms are water, mineral salts, carbon dioxide and molecular oxygen. (There are several other inorganic substances without which cells would die.)

Pasirinkite bet kurį klausimą ir bendrinkite jį FB arba Twitter

Tiesiog pasirinkite (arba dukart spustelėkite) klausimą, kurį norite bendrinti. Meskite iššūkį savo Facebook ir Twitter draugams.

Mineral Salts

4. What are mineral salts? Where can mineral salts be found in living organisms?

Mineral salts are simple, inorganic substances made up of metallic chemical elements, such as iron, sodium, potassium, calcium and magnesium, or of non-metallic elements, such as chlorine and phosphorus.

They can be found in their non-solubilized form as a part of structures in an organism, like the calcium in bones. They can also be found solubilized in water as ions: such as, the sodium and potassium cations within cells.

Functions of Organic Molecules

ਅ. What are the most important organic molecules for living organisms?

There are many types of organic molecules that are important for living organisms. Especially important are amino acids and proteins, carbohydrates (including glucose), lipids and nucleic acids (DNA and RNA). 

6. What are the main functions of organic molecules in living organisms?

Organic molecules, such as proteins, lipids and carbohydrates, perform several functions in living organisms. Noteworthy functions are structural functions (as part of the material that composes, surrounds and maintains organs, membranes, cell organelles, etc.), energetic functions (chemical reactions of energetic metabolism), control and informative functions (genetic code control, inter and intracellular signaling, endocrine integration) and enzymatic functions of proteins (facilitation of chemical reactions). 

7. What are some examples of the structural function of organic molecules?

Organic molecules are carrying out a structural function when they form a part of cell membranes, cytoskeletons, organ and blood vessel walls, bones, cartilage and, in plants, of conducting and supporting tissues. 

8. What are some examples of the energetic function of organic molecules?

Since they are complex molecules, which contain many chemical bonds, organic molecules store a large amount of energy.

Glucose, for example, is the main energy source for the formation of ATP (adenosine triphosphate), a molecule that is necessary for several metabolic reactions. ATP is also an organic molecule and is the energy source for many biochemical reactions. Fat, proteins and some types of organic polymers, such as starch and glycogen, which are polymers of glucose, are energy reservoirs for organisms. 

9. What are some examples of the control and informative function of organic molecules?

Based on genetic information, organic molecules control all functions of cells. The nucleic acids, DNA and RNA, are organic molecules that direct protein synthesis, and in turn, proteins are the main molecules responsible for the diversity of cellular biological tasks. In membranes and within the cell, some organic molecules act as information receptors and signalers. Proteins and lipids have an important role in the communication between cells and tissues, acting as hormones, which are substances that transmit information at a distance throughout an organism.

Biopolimerai

10. What are biopolymers?

Polymers are macromolecules made up by the union of several smaller identical molecules, which are then called monomers. Biopolymers are polymers present in living organisms. Cellulose, starch, and glycogen, for example, are polymers of glucose.

Now that you have finished studying the Introduction to Biochemistry, these are your options:


Žiūrėti video įrašą: 1. Introduction to Biological Chemistry II (Birželis 2022).