Informacija

Kaip galima nutildyti fenotipinį naviko slopintuvo mutacijos poveikį?

Kaip galima nutildyti fenotipinį naviko slopintuvo mutacijos poveikį?


We are searching data for your request:

Forums and discussions:
Manuals and reference books:
Data from registers:
Wait the end of the search in all databases.
Upon completion, a link will appear to access the found materials.

Aš šiek tiek skaičiau apie "dviejų smūgių" hipotezę dėl auglio slopinimo genų, kurioje minima, kad kai kurie genai, turintys haploinsufficientą, yra hipotezės išimtys. Skaičiau kitur šioje svetainėje (būtent atsakymą į šį klausimą), kuriame teigiama, kad haplosufficiency yra priemonė „nutildyti“ naviko slopinimo geno mutaciją taip, kad laukinio tipo alelio ekspresija kompensuotų mutantinį alelį.

Ar yra kokių nors kitų mechanizmų, kurie prisideda prie nepilno naviko slopinimo mutacijų įsiskverbimo?


Tai daugiau komentaras


Naviko slopintuvo mutacija yra recesyvinis požymis ir nėra aktyvaus mutacijos „nutylėjimo“. Jei naviko slopintuvas yra TF, mutacija DNR surišimo srityje negali turėti jokio poveikio, jei jo surišimo vietoje yra komplementari mutacija. Tai tik teorinė galimybė ir aš negirdėjau apie tokius pavyzdžius. Nemanau, kad egzistuoja kiti mechanizmai, leidžiantys „nutildyti“ bet kokią funkcijų mutacijos praradimą.


Kodėl naviką slopinantys genai yra svarbūs vėžiui

Auglį slopinantys genai gamina baltymus, reguliuojančius ląstelių augimą, ir jie atlieka svarbų vaidmenį užkertant kelią vėžinių ląstelių vystymuisi.

Kai naviką slopinantys genai pakeičiami arba inaktyvuojami dėl mutacijos (kurios yra gimimo metu arba atsiranda vėliau), jie gamina baltymus, kurie yra mažiau veiksmingi kontroliuojant ląstelių augimą ir (arba) atstatymą. Rezultatas yra nekontroliuojamas pažeistų ar nenormalių ląstelių augimas, dėl kurio atsiranda nekontroliuojamas augimas ir vėžinių navikų vystymasis.

Auglio slopinimo genai taip pat žinomi kaip antionkogenai arba funkcijos praradimo genai.


Sujungimo pakitimų pasekmės šeimos, turinčios subklinikinį Peutz-Jegherso sindromo pasireiškimą, atsiradimo ir fenotipinio kintamumo: bioinformatiniai ir molekuliniai įrodymai

Peutz-Jegherso sindromas (PJS) yra autosominis dominuojantis ikivėžinis sutrikimas, kurį 80–90% atvejų sukelia naviko slopinimo geno gemalo linijos mutacijos. STK11. Atlikome genetinį tyrimą STK11 Dviejų jaunų italų seserų, įtariamų PJS, geno, nes joms pasireiškė patognomoninės café au lait dėmės, nesant kitų simptomų ir pažįstamų. Visų egzonų seka STK11 genas ir kiti 8 genai, kurie, kaip manoma, gali būti susiję su hamartomatiniais sindromais,PTEN, BMPR1A, SDHB, SDHD, SMAD4, AKT1, LIT, PIK3CA). Be to, jis turėjo antrą introninį pakaitalą, pavadintą c.465-51 T>C (rs2075606), kurio nepaveldėjo jo dukterys. Mes taip pat pastebėjome, kad visi šeimos nariai, turintys c.597 G>A mutaciją, turėjo nenormalų STK11 mRNR sujungimo variantą, neturintį 4 egzono. Be to, c.465-51 T>C pakeitimo in silico analizė parodė, kad ji gali suaktyvinti stiprintuvo sujungimo elementą. Galiausiai, STK11 ekspresijos lygių qRT-PCR analizė parodė nedidelį laukinio tipo alelio reguliavimą tėve ir 2 kartus sumažintą probandų reguliavimą, palyginti su nepakitusia motina. Mūsų rezultatai leido iškelti hipotezę, kad c.465-51 T>C introninis variantas, kuris atsiskiria su laukinio tipo aleliu, gali padidinti STK11 laukinio tipo alelio sujungimo efektyvumą ir kompensuoti šalutinį c.597 G>A splaisingo mutacijos poveikį, yra atsakingas už fenotipinį kintamumą, pastebėtą šioje šeimoje. Ši išvada pabrėžia RNR analizės svarbą atliekant genetinius tyrimus ir pažymi, kad tylus DNR variantas dažnai gali būti sujungimo variantas, susijęs su ligos atsiradimu ir progresavimu. Šių variantų nustatymas turi lemiamą vaidmenį užtikrinant tinkamą stebėjimą ir vėžio prevenciją rizikos grupės asmenims.

Raktiniai žodžiai: Stiprinančiojo sujungimo elemento Peutz-Jegherso sindromo (PJS) kavinė au lait aptinka vėžio prevencijos presimptominės diagnostikos rizikos valdymo sujungimo variantus.

Interesų konflikto pareiškimas

Autoriai pareiškia, kad neturi interesų konflikto.

Figūros

Café au lait spots of probands. ( A ) gleivinės išsibarsčiusios juodos dėmės...

STK11/LKB1 geno molekulinė analizė...

STK11/LKB1 geno molekulinė analizė. ( A ) Peutz-Jegherso sindromo kilmė…

Pakeisto sujungimo identifikavimas…

Pakitusios sujungimo izoformos identifikavimas. ( A ) RT-PGR analizė…


REZULTATAI

Bendras nutildymas KLF17, CDH1, ir LASS2 ekspresija koreliuoja su padidėjusiu naviko piktybiniu naviku

Norėdami ištirti naviko slopinimo genų poveikį pacientų išgyvenamumo laikui skirtinguose navikuose, ieškojome Kaplan-Meier braižytuvo duomenų bazėje (14) ir hierarchine klasterine analize palygino vidutinį išgyvenamumo laiką, susietą su 51 naviko slopinimo genu sergant krūties, plaučių ir kiaušidžių vėžiu (1A pav.). Mes taip pat išanalizavome, kurių bendrų naviko slopinimo genų ekspresija buvo susijusi su santykinai didesniu vidutiniu išgyvenimo laiku trijose vėžio formose. Pastebėta, kad iš šių genų, kurie galėjo turėti įtakos vidutiniam išgyvenamumo laikui, penki sutampa tarp trijų vėžio formų (1B pav.). Išgyvenimo kreivės suskirstytos pagal bet kurio iš jų išraišką KLF17, CDH1, arba LASS2 sergant krūties, plaučių ir kiaušidžių vėžiu, nustatyta, kad bet kurio iš šių naviko slopinimo genų ekspresija yra susijusi su ilgesniu vidutiniu išgyvenamumu (S1 pav.). Trijų genų ekspresija buvo teigiamai koreliuojama sergant krūties vėžiu (S2 pav.). Toliau išbandėme ryšį tarp išgyvenimo laiko ir trijų baltymų ekspresijos kepenų ląstelių karcinomos audiniuose ir nustatėme, kad tuo pačiu metu esanti žema KLF17, CDH1 ir LASS2 ekspresija buvo susijusi su trumpesniu bendru kepenų ląstelių karcinoma sergančių pacientų išgyvenamumu (1C pav.). Be to, ištyrėme koreliacijas tarp KLF17, CDH1 ir LASS2 ekspresijos ir klinikinės stadijos arba patologinio laipsnio kepenų ląstelių karcinomos atvejais. I ir II klinikinių stadijų procentas buvo 50,8 ir 63,9 %, o III ir IV stadijų procentas buvo 49,2 ir 36,1 % grupėse, kurių trijų naviko slopinimo genų ekspresija buvo maža ir aukšta.P = 0,029). III patologinio laipsnio procentas buvo atitinkamai 23,8 ir 7,4% mažos ir didelės ekspresijos grupėse (P = 0,004) (1D pav.). Metastazių procentas buvo 63,3 ir 26,7% (P = 0,002) (1E pav.), o α-fetoproteino (AFP) procentas didesnis nei 400 ng/ml buvo atitinkamai 69,2 ir 58,8 % mažos ir didelės ekspresijos grupėse (P = 0,010) (1F pav.). Šie radiniai parodė, kad bendras KLF17, CDH1 ir LASS2 nutildymas sergant kepenų ląstelių karcinoma yra stipriai susijęs su prasta prognoze, naviko progresavimu, metastazėmis ir AFP kiekiu serume.

(A) Klasterinė analizė, pagrįsta pacientų, turinčių skirtingą 51 naviką slopinančio geno ekspresijos lygį tarp krūties, plaučių ir kiaušidžių vėžio, vidutinės išgyvenimo trukmės skirtumais Kaplan-Meier braižytuvu (14). (B) Penkių naviko slopinimo genų, kurių vidutinis išgyvenamumas skiriasi, nustatymas. (C) Kepenų ląstelių karcinoma sergančių pacientų, kurių KLF17, CDH1 ir LASS2 ekspresija yra maža arba didelė, išgyvenamumas. (D) Klinikinės stadijos procentas, patologinis laipsnis, (E) metastazės ir (F) AFP pacientų, sergančių kepenų ląstelių karcinoma, grupėse, kurių KLF17, CDH1 ir LASS2 ekspresija yra maža (-) arba didelė (+).

MiR-9 prisideda prie KLF17, CDH1, ir LASS2 bendras nutildymas ir piktybinio naviko progresavimas

Ištyrėme KLF17, CDH1 ir LASS2 bendro nutildymo atpalaidavimo poveikį vėžio ląstelėse, kurios per daug ekspresuoja šiuos genus po transfekcijos (2A pav.). Per didelė trijų genų ekspresija slopino ląstelių dauginimąsi (2B pav.), migraciją (2C pav.), invaziją (2D pav.) ir kolonijų susidarymą (2E pav.) ir skatino ląstelių apoptozę (2F pav.). Poveikis buvo akivaizdesnis, kai trys genai buvo per daug ekspresuojami vienu metu, nei tada, kai kiekvienas genas buvo per daug išreikštas atskirai.

(A) KLF17, CDH1 ir LASS2 ekspresijos Western blot analizė HeLa ląstelėse, transfekuotose atitinkamai pcDNA3.1-KLF17, pcDNA3.1-CDH1 arba pcDNA3.1-LASS2. (B) ląstelių dauginimasis,C) migracija (skalės juostos, 50 μm), (D) invazija (mastelio juostos, 100 μm), (E) kolonijų susidarymas (2 mm skalės juostos) ir (F) buvo išmatuota HeLa ląstelių, transfekuotų pcDNA3.1-KLF17, pcDNA3.1-CDH1 ir pcDNA3.1-LASS2, apoptozė. FITC, fluoresceino izotiocianatas. Visi duomenys pateikiami kaip vidurkiai ± SEM, palyginti su kontroline grupe. *P < 0,05, **P < 0,01, ***P < 0,001, ****P < 0,0001.

Atsižvelgiant į naviko ląstelių slopinimo efektyvumą su pernelyg išreikšta KLF17, CDH1, ir LASS2, mes patikrinome miRNR duomenų bazes, ieškodami įprastų kancerogeninių miRNR, nukreiptų į tris genus, ir patikrinome šių miRNR slopinamąjį poveikį trims tiksliniams genams kiekybine atvirkštinės transkripcijos polimerazės grandinine reakcija (qRT-PCR) (S3A pav.). Be to, mes nustatėme, kad 11 miRNR sėklų sekų turėjo tam tikrą sekos panašumą su miR-9 (3A pav.). Mes aptikome proliferacijos slopinimą, kurį sukelia šie miRNR HeLa ląstelėse, o miR-9 slopinantis poveikis proliferacijai buvo akivaizdžiausias (S3B pav.). TCGA (The Cancer Genome Atlas) duomenų bazės užklausos rezultatai taip pat patvirtina mintį, kad miR-9 ekspresija yra didesnė įvairiuose naviko audiniuose nei normaliuose audiniuose (S4 pav.). Bioinformatinė analizė naudojant miRTarBase (15), TargetScan (16), arba miRanda (17) atskleidė, kad miR-9 turi labai konservuotas surišimo vietas 3′ netransliuotuose regionuose (3′UTR). KLF17, CDH1, ir LASS2 (S5A pav.). Be to, mes nustatėme, kad miR-9 slopino KLF17, CDH1, ir LASS2 3′UTR luciferazės aktyvumas (S5B pav.) ir sumažėjo ekspresija KLF17, CDH1, ir LASS2 (3B pav.). Taigi, šių trijų genų ekspresija gali būti padidinta slopinant miR-9.

(A) MiRNR taikymo motyvai KLF17, CDH1, ir LASS2 rasta duomenų bazėje. (B) KLF17, CDH1 ir LASS2 baltymų lygiai, įvertinti Western blot analize po transfekcijos miR-9 48 valandas. (C) Buvo sukurtos kelios miR-9 kempinės (linijinė RNA-9, circR-9, CSSD-9-s ir CSSD-9). (D) Sukurtų miRNR kempinių stabilumas po egzonukleazės VII (Exo VII), T5 egzonukleazės (T5 Exo), RNazės R, terpės su serumu arba apdorojimo transfekcijos reagentu. (E) Reprezentatyvūs skenuojamosios elektroninės mikroskopijos nanodalelių vaizdai. (F) qRT-PCR miR-9 ekspresijos aptikimas HeLa ląstelėse po nanodalelių transfekcijos skirtingomis miR-9 kempinėmis skirtingais laiko momentais. miR-9 ekspresija buvo normalizuota etaloninio geno U6 mažos branduolinės RNR ekspresija. (G) KLF17, CDH1 ir LASS2 baltymų Western blot analizė HeLa ląstelėse, transfekuotose nanodalelėmis su skirtingomis miR-9 kempinėmis. (H) Skenuojantys elektronų mikroskopiniai fenotipinių pokyčių vaizdai, pastebėti praėjus 48 valandoms po to, kai HeLa ląstelės buvo transfekuotos CSSD-9 nanodalelėmis. Raudonos rodyklės rodo apoptotines pūsleles. Mastelio juostos, 10 μm (kairėje) ir 5 μm (dešinėje). () ląstelių dauginimasis,J) migracija, (K) invazija, (L) kolonijų susidarymas ir (M) apoptozė buvo aptikta HeLa ląstelėse, transfekuotose CSSD-9 nanodalelėmis 0,25, 0,5 ir 1 μg dozėmis 10 5 ląstelėms. Visi duomenys pateikiami kaip vidurkiai ± SEM. *P < 0,05, **P < 0,01, **** P < 0,0001.

Nanodalelėmis pakrautas CSSD-9 tarnauja kaip miR-9 kempinė, kuri padidina naviko slopinimo geno ekspresiją ir slopina naviko piktybiškumą

Norėdami sumažinti miR-9 kiekį naviko ląstelėse, sukūrėme keletą inhibitorių, pagrįstų brandaus miR-9 seka. Linijinė RNR yra oligonukleotidas, turintis vieną miR-9 surišimo vietų kopiją circR-9 ir CSSD-9-s, turinčias dvi surišimo vietas, o CSSD-9 - keturias miR-9 surišimo vietas (3C pav.). Atsižvelgiant į tai, kad netobulos miRNR išsipūtusios kempinės yra efektyvesnės nei kempinės su tobula antisensine seka (10, 11, 18), kiekvienoje miRNR surišimo vietoje buvo išsipūtusi vieta. Tada naudojome egzonukleazę VII, T5 egzonukleazę, ribonukleazę (RNase) R, terpę su serumu arba transfekcijos reagentą, kad būtų galima fermentuoti inžinerijos būdu sukurtų miRNR kempinių virškinimą. Palyginti su circR-9, CSSD-9 buvo atsparesnis fermentiniam skilimui ir stabilesnis terpėje su serumu arba transfekcijos reagentu (3D pav.).

Nanodalelių morfologija buvo stebima skenuojančiu elektroniniu mikroskopu (3E pav.). CSSD-9 ir kiti mūsų sukurti miR-9 inhibitoriai buvo perkelti į ląsteles ant nanodalelių. CSSD-9 poveikis mažinant miR-9 kiekį ir didinant KLF17, CDH1 ir LASS2 baltymų ekspresiją buvo akivaizdžiausias (3 pav., F ir G). Mes stebėjome HeLa ląstelių fenotipą po gydymo CSSD-9, naudodami skenuojantį elektroninį mikroskopą. Ląstelių morfologija tapo sferinė dėl pradinės verpstės formos ląstelės paviršiaus schistozės pseudopodijos sumažėjo, atsirado apoptozinių pūslelių (3H pav.). Taip pat įvertinome CSSD-9 gebėjimą slopinti naviko ląstelių piktybiškumą ir nustatėme, kad CSSD-9 slopina ląstelių proliferaciją (3I pav.), migraciją (3J pav.), invaziją (3K pav.) ir kolonijų susidarymą (3L pav.) ) ir skatino ląstelių apoptozę (3M pav.). Šis CSSD-9 poveikis ląstelių proliferacijai, migracijai, invazijai, kolonijų susidarymui ir apoptozei priklausė nuo dozės (0, 0, 25, 0, 5 ir 1 μg 10 5 ląstelėms), o didesnis poveikis pasiekiamas vartojant didesnes dozes (1 pav.). 3).

Viso genomo geno ekspresijos lusto analizė atskleidžia pagrindines biologines funkcijas, kurias veikia CSSD-9

Norėdami įvertinti CSSD-9 įtaką pagrindinėms biologinėms funkcijoms, išanalizavome viso genomo geno ekspresiją HeLa ląstelėse, apdorotose CSSD-9. Genų ekspresijos profiliavimas buvo atliktas siekiant įvertinti CSSD-9 poveikį vėžio ląstelėms. Tūrinė RNR buvo išskirta iš ląstelių, apdorotų CSSD-9, o išreikšti transkriptai buvo analizuojami viso genomo geno ekspresijos lustu (4A pav.). Norėdami išanalizuoti chemokino ir augimo faktorių raišką viso genomo genų ekspresijos lusto duomenyse, optimizavome analizės sąlygas ir pasirinkome genus, kurie buvo skirtingai išreikšti daugiau nei dvigubai genų ontologijos (GO) analizei. Rezultatai parodė, kad po gydymo CSSD-9 pasireiškė apoptozė, tarpląstelinis pH reguliavimas, imuninis atsakas, uždegiminis atsakas, su interleukinu-18 (IL-18) ir IL-8 susiję biologiniai procesai ir su CCR chemokino receptorių prisijungimu susijusi molekulinė funkcija. viskas reguliuojama aukštyn. Priešingai, ląstelių adhezija, invazija, migracija, angiogenezė ir teigiamas su IL-4 gamyba susijusių biologinių procesų reguliavimas ir su augimo faktoriaus aktyvumu susijusios molekulinės funkcijos buvo sumažintos (4B pav.). Sureguliuoti genai buvo susiję su uždegiminiu atsaku, imuniniu atsaku, apoptoze, chemokinais ir chemokinų receptoriais (4C pav.), o žemyn reguliuojami genai buvo susiję su migracija, invazija, angiogeneze, ekstraląsteline matrica, chemokinais, chemokinų receptoriais ir augimu. faktorius (4D pav.). Be to, mes išanalizavome baltymų ir baltymų sąveiką, esančią tarp skirtingai išreikštų genų (reguliuojamų aukštyn arba žemyn), naudodami STRING duomenų bazę (19). Genai, reguliuojami po gydymo CSSD-9, buvo praturtinti baltymų ir baltymų sąveika, susijusia su ląstelių apoptoze ir uždegiminiu atsaku (4E pav.), o sureguliuoti genai buvo susiję su ląstelių invazija, metastazėmis ir proliferacija (4F pav.).

(A) Ląstelių, apdorotų CSSD-9, viso genomo geno ekspresijos lusto analizės darbo eiga. (B) Aukštyn ir žemyn reguliuojami biologiniai procesai ir molekulinės funkcijos HeLa ląstelėse praėjus 48 valandoms po gydymo CSSD-9. Sureguliuoti biologiniai procesai, įskaitant imuninį ir uždegiminį atsaką bei apoptozinį signalizacijos kelią, rodomi žaliai. Žemiau reguliuojami biologiniai procesai, įskaitant migraciją, invaziją, proliferaciją, angiogenezę ir augimo faktorius, rodomi raudonai. IκB, branduolinio faktoriaus κB inhibitorius NF-κB, branduolinio faktoriaus κB. (C) Sureguliuoti genai HeLa ląstelėse po gydymo CSSD-9 buvo susiję su uždegiminiu atsaku, imuniniu atsaku, apoptoze ir chemokinų / chemokinų receptoriais. (D) Sumažinti reguliuojami genai HeLa ląstelėse po gydymo CSSD-9 buvo susiję su migracija, invazija, angiogeneze, ekstraląsteline matrica, augimo faktoriais ir chemokinų / chemokinų receptoriais. (E) Numanyti, aukštai reguliuojami baltymų ir baltymų sąveikos tinklai, pagrįsti skirtingai išreikštais genais po gydymo CSSD-9, buvo praturtinti apoptoze ir uždegiminiu atsaku. (F) Numanyti, kad baltymų ir baltymų sąveikos tinklai, pagrįsti skirtingai išreikštais genais po gydymo CSSD-9, buvo praturtinti invazijai, migracijai ir proliferacijai.

CSSD-9 slopina navikus ląstelėse, ekspresuojančiose miR-9

Norėdami ištirti kitų naviko ląstelių jautrumą CSSD-9, išmatavome miR-9 ekspresiją (S6 pav.) ir mRNR ekspresiją KLF17, CDH1, ir LASS2 (S7 pav.) įvairių tipų navikų ląstelėse, naudojant qRT-PGR. Norėdami ištirti CSSD-9 slopinamąjį poveikį, pasirinkome HeLa, SiHa, A549, H1299 ir HepG2 ląsteles, nes šios ląstelės turėjo aukščiausią santykinę miR-9 ekspresiją ir mažiausią santykinę tikslinių naviko slopinimo genų ekspresiją iš visų tirtų ląstelių. linijos. CSSD-9 sumažino ląstelių proliferaciją visose ląstelių linijose praėjus 48 valandoms po transfekcijos (5A pav.). Per didelis CSSD-9 ekspresija slopino matricos metaloproteinazės-2 (MMP2) ir MMP9 metastazes skatinantį aktyvumą ląstelėse, įvertintą želatinos zimografija (5B pav.). Be to, CSSD-9 slopino ląstelių invaziją (5C pav.) ir migraciją (5D pav.) ir skatino apoptozę (5E pav.). Be to, CSSD-9 nebuvo toksiškas HEK293, LO2, HUVEC ar HaCaT ląstelėms (S8 pav.).Mes taip pat sukūrėme kitus CSSD, skirtus kancerogeninėms miRNR, ir patvirtinome jų slopinamąjį poveikį HeLa ląstelėse (S9 pav.).

(A) HeLa, SiHa, A549, H1299 ir HepG2 ląstelių dauginimasis buvo išmatuotas praėjus 48 valandoms po transfekcijos CSSD-9. (B) Želatinos zimografija, rodanti represuotą MMP2 ir MMP9 aktyvumą HeLa, SiHa, A549, H1299 ir HepG2 ląstelėse po gydymo CSSD-9. (C) Ląstelių invazija buvo nustatyta Matrigel dengtu transwell tyrimu. Ląstelės, kurios kirto Matrigel dengtą filtrą, buvo fiksuotos, nudažytos ir suskaičiuotos. (D) HeLa, SiHa, A549, H1299 ir HepG2 ląstelių migracija buvo aptikta praėjus 24 ir 48 valandoms po transfekcijos CSSD-9. Duomenys buvo normalizuoti iki 0 valandų. (E) CSSD-9 poveikis naviko ląstelių apoptozei, analizuojamas srauto citometrijos metodu. Surinktos ląstelės buvo nudažytos aneksinu V ir propidžio jodidu, siekiant nustatyti ankstyvųjų ir vėlyvųjų apoptozinių ląstelių ir gyvybingų ląstelių procentą. Visi duomenys pateikiami kaip vidurkiai ± SEM. **P < 0,01, ****P < 0,0001.

Norint ištirti CSSD-9 slopinamąjį poveikį in vivo, maždaug 1 × 106 HeLa ląstelių buvo sušvirkšta po oda į BALB / c nuogų pelių vidurinę nugaros sritį. Kai naviko tūris pasiekė 100–200 mm 3 , pelės buvo gydomos mišriomis CSSD-9 (10 μg) ir nanodalelėmis (10 μl) arba mišriomis CSSD-9 (20 μg) ir nanodalelėmis (20 μl) intratumoraliniu (IT) arba Į veną (IV) injekciją kas 3 dienas, kad įsitikintumėte, ar poveikis priklauso nuo dozės (6A pav.). Palyginti su gydymu 10 μg CSSD-9, 20 μg CSSD-9 vartojimas parodė ryškesnį naviką slopinantį poveikį. Todėl pasirinkome didelę (20 μg) gydymo CSSD-9 dozę, kad slopintume naviko aptikimą in vivo. 20 μg CSSD-9 ir 20 μl nanodalelių mišinys buvo sušvirkštas į SiHa, A549 ir ​​HepG2 auglius turinčias peles IV. arba I.T. kas 3 dienas. CSSD-9 sumažino naviko augimą šiuose trijuose modeliuose, o slopinamasis poveikis labiau akivaizdus I.T. injekcijų grupėse nei I.V. injekcijų grupės (6B pav.). Pelėms, kurios buvo gydomos CSSD-9 (dviejų uodegų nesuporuotas Studento liga), sumažėjo metastazavusių plaučių mazgų skaičius. t testas arba Mann-Whitney testas, P < 0,05) (6 pav., C ir D). Mes taip pat nustatėme miR-9 ir mRNR ekspresiją KLF17, CDH1, ir LASS2 naviko audiniuose naudojant qRT-PGR. Rezultatai parodė, kad CSSD-9 slopino miR-9 ekspresiją (6E pav.) ir padidino KLF17, CDH1, ir LASS2 išraiška (6F pav.). KLF17, CDH1 ir LASS2 baltymų ekspresija taip pat padidėjo gydytoje CSSD-9 grupėje, kaip rodo Western blot analizė (6G pav.). Kai kurių chemokinų, chemokinų receptorių ir augimo faktorių mRNR ekspresija naviko audiniuose buvo aptikta qRT-PGR metodu CSSD-9 gydymo grupėse. mRNR ekspresijos variacija CXCR5, IL33, CCL18, FGF11, ir VEGFB audiniuose atitiko viso genomo geno ekspresijos lusto duomenis: raiška CXCR5 padidėjo, tuo tarpu IL33, CCL18, FGF11, ir VEGFB sumažėjo CSSD-9 gydytų naviko audinių (S10 pav.).

(A) HeLa naviko tūriai po gydymo CSSD-9 skirtingomis dozėmis. Kai navikai pasiekė 100–200 mm 3 dydį, pelės buvo gydomos 10 ir 20 μg CSSD-9 per I.T. arba I. V. injekcija. Naviko dydžiai buvo matuojami kas 3 dienas ir apskaičiuojami naviko tūriai. (B) SiHa, A549 ir ​​HepG2 navikų vaizdai ir augimo kreivės po IV gydymo CSSD-9. ir tai. injekcija. (C) Kontrolinių ir CSSD-9 gydytų pelių plaučių paviršiuje matomi metastazuojantys mazgeliai (viršuje). Reprezentatyvūs hematoksilino ir eozino (H&E) dažymo skaičiai buvo atlikti serijiniuose metastazavusių navikų plaučiuose pjūviuose. Mastelio strypai, 50 μm. (D) Metastazavusių plaučių mazgų skaičius buvo kiekybiškai įvertintas kontrolinėje ir CSSD-9 gydymo grupėse. (E) miR-9 ekspresija kontrolinėje ir CSSD-9 grupėse buvo aptikta qRT-PGR metodu po naviko audinių lizės ir RNR ekstrahavimo. (F) mRNR ekspresija KLF17, CDH1, ir LASS2 kontrolinėje ir CSSD-9 gydymo grupėse buvo aptiktas qRT-PGR. (G) KLF17, CDH1 ir LASS2 ekspresija buvo patvirtinta Western blot analize po naviko audinių lizės. (H) Kairėje: BALB/c nuogos pelės, kuriai buvo atlikta I.V., fluorescencinis vaizdas. A549-GFP ląstelių injekcija ir apdorota CSSD-9 IV. injekcija. Dešinėje: CTC buvo aptikti srauto citometrija. () CD8 + T ląstelių (CD3 + CD8 + ) ir IFN-γ + ląstelių infiltracija naviko audiniuose po gydymo CSSD-9 I.T. arba I. V. injekcija. (J) MDSC procentinė dalis naviko audiniuose, kaulų čiulpuose (KM) ir blužnyje po gydymo CSSD-9. Visi duomenys pateikiami kaip vidurkiai ± SEM. *P < 0,05, **P < 0,01, ***P < 0,001, **** P < 0,0001.

Toliau ištyrėme nanodalelių, tiekiamų su CSSD-9, poveikį normalioms ląstelėms gyvūnų modeliuose. Įvertinome pilną kraujo tyrimą, kepenų funkciją ir inkstų funkciją normalioms pelėms (normali grupė), auglį turinčioms pelėms (kontrolinė grupė) ir pelėms, gydomoms skirtingomis I.T. dozėmis. arba I. V. CSSD-9 injekcija (ty I.T.-20 μg, I.T.-10 μg, I.V.-20 μg ir I.V.-10 μg grupės). Palyginti su įprastomis pelėmis, neutrofilų procentas padidėjo [vienpusė dispersijos analizė (ANOVA), P < 0,0001], tačiau reikšmingo statistinio skirtumo tarp navikų turinčių pelių ir normalių pelių monocitų, limfocitų ir eozinofilų nebuvo. Bazofilų procentas buvo artimas 0. Po gydymo CSSD-9 statistinio neutrofilų, monocitų, limfocitų, eozinofilų ir bazofilų skirtumo nebuvo (S11 pav., A ir B). Taip pat atlikome alanino aminotransferazės (ALT), aspartataminotransferazės (AST), šarminės fosfatazės (ALP), bendro bilirubino (TBIL), bendro baltymo (TP), albumino (ALB), kreatinino (CREA) ir karbamido (URA) tyrimus. įvertinti CSSD-9 poveikį kepenų ir inkstų funkcijoms. Palyginti su įprastomis pelėmis, ALT, ALP, TP ir ALB koncentracijos auglių turinčiose pelėse sumažėjo, o AST ir TBIL koncentracijos padidėjo. Po gydymo CSSD-9 šie rodikliai grįžo į beveik normalų, tačiau šie pokyčiai nebuvo statistiškai reikšmingi. Be to, nebuvo ryškių skirtumų tarp CREA ir UREA koncentracijų visose grupėse (S11 pav., C ir D). Rezultatai parodė, kad CSSD-9 turi nedidelį poveikį pelių kraujo skaičiui, kepenų funkcijai ir inkstų funkcijai.

Norint ištirti CSSD-9 poveikį in vivo metastazėms, buvo naudojamas eksperimentinis metastazių tyrimas, siekiant palyginti plaučių metastazavusias ir cirkuliuojančias naviko ląsteles (CTC) pelėms, kurioms buvo sušvirkštos A549 ląstelės, stabiliai pažymėtos žaliu fluorescenciniu baltymu (GFP). Praėjus šešioms savaitėms po injekcijos, kontrolinės grupės pelėms fluorescenciniu vaizdavimu in vivo buvo nustatyta ryški metastazė plaučiuose. CTC buvo analizuojami srauto citometrijos metodu, ir rezultatai parodė, kad CTC buvo didesnis kontrolinėje grupėje nei CSSD-9 grupėje (6H pav.). Pelėms, kurios buvo gydomos CSSD-9 (dviejų uodegų nesuporuotas Studento liga), sumažėjo metastazavusių plaučių mazgų skaičius. t bandymas, P < 0,05) (S12 pav.).

Be to, ištyrėme imuninių ląstelių vystymąsi ir funkciją po CSSD-9 transfekcijos in vivo . Mes įvertinome CD8 + T ląstelių ir interferono-γ teigiamų (IFN-γ +) ląstelių infiltraciją naviko audiniuose po CSSD-9 transfekcijos I.T. arba I. V. injekcija naudojant srauto citometriją. Infiltruojančių CD8 + T ląstelių ir IFN-γ + ląstelių procentas auglio audiniuose padidėjo po gydymo CSSD-9, o 20 μg CSSD-9 gydymo grupėje padidėjimas buvo akivaizdesnis (6I pav.). Norėdami nustatyti imunosupresijos ir tikslinių ląstelių, išskyrus naviko ląsteles, pasikeitimą, išmatavome mieloidinių supresorių ląstelių (MDSC) procentą navikuose, kaulų čiulpuose ir blužnyje. MDSC procentas sumažėjo po gydymo CSSD-9 (6J pav.).

CSSD-9 specifiškai slopina auglius, turinčius didelę miR-9 ekspresiją paciento gautame naviko ksenografijos modelyje

Iš 61 paciento gavome 43 skirtingus pirminio naviko fragmentus (kepenų ląstelių karcinomą, plaučių vėžį, gimdos kaklelio vėžį, kiaušidžių vėžį ir krūties vėžį) ir sukūrėme 43 pacientų gautus naviko ksenografijos (PDX) modelius, kurių klinikinės ir patologinės savybės parodytos Fig. 7A. Eksperimentų schema, įskaitant šviežio chirurginio naviko audinio gydymą, paskyrimą in vivo ir I.T. CSSD-9 įpurškimas PDX modelyje parodytas 7B pav. Mes nustatėme KLF17, CDH1, LASS2, ir miR-9 ekspresija šiuose navikuose imunohistochemijos (IHC) ir fluorescencinės in situ hibridizacijos (FISH) metodu (7C pav.). Statistinė analizė parodė, kad išraiška KLF17, CDH1, ir LASS2 buvo neigiamai koreliuojamas su miR-9 šiuose naviko audiniuose (7D pav.). Norint ištirti CSSD-9 slopinamąjį aktyvumą pacientų navikų augimui, pelėms buvo implantuoti skirtingi naviko audiniai ir priskirtos kontrolinėms ir CSSD-9 grupėms. Išanalizavome ryšį tarp CSSD-9 naviko slopinimo greičio ir miR-9 ekspresijos ir KLF17, CDH1, ir LASS2 sergant pacientų navikais. Rezultatai parodė, kad naviko slopinimo greitis buvo teigiamai koreliuojamas su miR-9 ekspresija, bet neigiamai koreliavo su KLF17, CDH1, ir LASS2 išraiška (7E pav.). PDX modelio rezultatai rodo galimą klinikinę terapinę CSSD-9 vertę, kuri gali būti vertinama kaip ikiklinikinis jautrumo įvertinimas prieš pradedant gydymą CSSD.

(A) Informacija apie pacientų, sergančių skirtingais navikais, klinikopatologinius požymius. (B) Pirminio naviko gydymo schema ir I.T. CSSD-9 įpurškimas PDX modelyje. (C) Reprezentatyvūs teigiamo ir neigiamo įvaizdžiai KLF17, CDH1, ir LASS2 ekspresija ir miR-9 ekspresija skirtinguose kepenų ląstelių karcinomos audiniuose, aptiktuose IHC ir FISH. (D) Tiesinės regresijos analizė parodė reikšmingą neigiamą koreliaciją tarp miR-9 ir raiškos KLF17, CDH1, ir LASS2 pacientų navikiniuose audiniuose. (E) CSSD-9 naviko augimo slopinimo greitis teigiamai koreliavo su miR-9 ir neigiamai koreliavo su KLF17, CDH1, ir LASS2.


Haplonepakankami naviko slopinimo genai

Nepaisant ilgos genetikos haploinsufficiencijos istorijos, šios sąvokos vertimas į naviko slopinimo genus buvo lėtas. Tikėtina, kad vėlavimas atsirado dėl to, kad trūksta eksperimentinių įrodymų, taip pat dėl ​​suvokto konflikto tarp haploinsufficiency (vieno alelio neužtenka) ir pradinio naviko slopinančio geno apibrėžimo (reikia dviejų paspaudimų). Tradicinėje naviko slopinimo genetikoje paveldėtas vieno naviko slopinimo alelio praradimas pagreitina naviko atsiradimą, nes reikia inaktyvuoti tik vieną likusį alelį. Nepakankami naviko slopinimo genai taip pat lemia pagreitintą naviko atsiradimą, tačiau nereikalaujama paveldimos vieno alelio mutacijos (1 pav.).

1998 metais Fero ir kt . (15) pranešė, kad nuo ciklino priklausomas kinazės inhibitorius p27 kip1 yra nepakankamas naviko slopinimui ir venkatachalamui ir kt . (16) parodė, kad p53 gali slopinti naviko vystymąsi priklausomai nuo genų dozės. Panašiai, Tangas ir kt . (17) pranešė, kad Tgfβ yra nepakankamas naviko slopinimui, nors jo haploinsufficiencijos mechanizmas iš esmės skiriasi, nes Tgfβ yra išskiriamas baltymas ir todėl veikia nepriklausomai nuo ląstelių.

1996 m. trys laboratorijos savarankiškai sukūrė p27 išmuštas peles ir pranešė apie panašius fenotipus (18-20). p27 −/− pelių augimo greitis pagreitėja, o suaugusieji yra 20–30% didesni nei laukinio tipo vados. Padidėjęs dydis p27 −/− gyvūnus lėmė padidėjęs ląstelių skaičius, o ne padidėjęs ląstelių dydis, o tai rodo pagrindinį p27 vaidmenį kontroliuojant augimą visuose audinių skyriuose. in vivo ir suteikia pirmąją užuominą apie jo jautrumą genų dozei. Įdomu tai, kad audiniai iš p27 +/− pelės išreiškė maždaug 50% normalaus p27 baltymo lygio ir šių pelių augimo greitis buvo vidutinis. Tarpinis heterozigotinių gyvūnų fenotipas parodė, kad proliferacijos ir net suaugusių gyvūnų dydžio kontrolė yra labai jautri p27 baltymo lygiui. Be to, pelėms, kurioms trūksta p27, pasireiškė hipofizės tarpinės skilties hiperplazija ir beveik 100 proc. p27 −/− pelių (129/Sv genetinio fono) galiausiai pasidavė dėl gerybinių hipofizės adenomų (18). p27 −/− pelėms nebuvo nustatytas padidėjęs jautrumas spontaniškam naviko vystymuisi kituose audiniuose.

Tačiau yra daugybė žmonių vėžio įrodymų, rodančių, kad sumažėjęs p27 baltymas yra susijęs su agresyvesniais navikais ir sumažėjusiu pacientų išgyvenamumu (apžvelgta 21 nuorodoje). Kadangi vėžys yra daugiapakopis procesas, reikalaujantis kelių genetinių įvykių, spontaniško naviko polinkio stoka pelėms, kurioms trūksta p27, buvo nepakankamas įrodymas, kad būtų galima atmesti p27 naviką slopinantį vaidmenį. Gali prireikti kitų genetinių įvykių, kad p27 sukeltų latentinį naviką slopinantį poveikį. Iš tiesų, kai p27 stokojančios pelės buvo paveiktos arba taškiniu mutagenu ENU, arba plataus spektro mutagenine medžiaga jonizuojančia spinduliuote, joms buvo nustatytas polinkis į naviką keliuose epitelio audiniuose (15). Grupėje, kuri buvo paveikta vienkartine 1 Gy spinduliuotės doze, vidutinis išgyvenamumas be naviko laukinio tipo kontrolinių pelių buvo sumažintas nuo daugiau nei 70 savaičių iki 40 savaičių. p27 −/− pelėms dėl padidėjusio naviko dauginimosi įvairiose vietose, įskaitant plonąją ir storąją žarną, plaučius, kiaušides, gimdą ir antinksčius. p27 +/− pelėms buvo vidutinis jautrumas tiek išgyvenimui be naviko, tiek naviko daugybei. Genetinė ir biocheminė navikų analizė iš p27 +/− pelės atskleidė, kad laukinio tipo 27 p alelis nebuvo mutavęs ir baltymų ekspresija nebuvo nutildyta p27 +/− navikai. Panašiai, kai pelėms, kurioms trūksta p27, buvo naudojamas kancerogenas 1,2-dimetilhidrazinas (DMH), alkilinantis agentas, sukeliantis adenomas ir adenokarcinomas būtent gaubtinėje žarnoje, bendras išgyvenamumas be naviko žymiai sumažėjo p27 −/− pelėms ir vidutiniu mastu p27 +/− pelių, palyginti su laukinio tipo vados kontrolinėmis grupėmis (22). Kolorektalinės adenokarcinomos dažnis, taip pat adenokarcinomų ir adenomų santykis bei naviko elgesio histologinis agresyvumas labai padidėjo pelėms, kurioms trūksta p27. Nors p27 +/− pelėms pasireiškė gaubtinės ir tiesiosios žarnos naviko latentinis laikotarpis ir histologiškai agresyvus naviko elgesys tarp p27 −/− ir p27 +/+ pelėms, likęs laukinio tipo alelis buvo išsaugotas ir toliau buvo ekspresuojamas DMH sukeltuose kolorektaliniuose navikuose nuo p27 +/− pelėms.

Šie rezultatai skyrėsi nuo tų, kurie anksčiau buvo pateikti kituose pelių modeliuose, kuriuose buvo numuštas naviko slopintuvas. Pavyzdžiui, navikai iš Rb +/− ( 23 , 24 ) ir Apc +/− (25) visos pelės dažnai mutuoja arba praranda likusius laukinio tipo alelius, atitinkančius Knudsono dviejų smūgių modelį (2). Tokiais atvejais naviko slopintuvas atrodo recesyvus ląstelių lygiu: visiškas abiejų alelių praradimas suteikia daug didesnį selektyvų pranašumą nei vieno alelio praradimas. Tačiau net ir šiais atvejais negalima atmesti galimybės, kad vieno alelio praradimas suteikia selektyvų pranašumą galbūt ankstyvame naviko vystymosi etape. Pelės genetinė inaktyvacija Rb ir Apc genai imituoja tai, kas pastebima žmogaus navikuose, kur stebimos dvialelinės šių naviką slopinančių genų mutacijos. Priešingai, dvialelinės mutacijos 27 p retai pastebimi nei žmogaus, nei pelių navikuose. Pelių duomenys neabejotinai rodo didelį selektyvų pranašumą naviko vystymuisi praradus vieną 27 p alelis. Duomenys rodo, kad augimo (18) ir naviko vystymosi (15) slopinimas yra labai jautrus p27 geno dozei. Taigi, perpus sumažinti įprastą p27 kiekį pakanka, kad augimas būtų nekontroliuojamas, o tai rodo, kad gali būti ne jo aktyvumo slenkstis, o dozės ir atsako tęstinumas.

Kitame gerai žinomame pavyzdyje Trp53 tam tikromis aplinkybėmis ir tam tikruose audiniuose yra inaktyvuojamas naudojant tradicinę „dviejų smūgių“ kinetiką, tačiau kitais atvejais rodomas aiškus haploinsufficiencijos įrodymas. Ankstyvieji įrodymai, kad elgesys yra nepakankamas Trp53 ląstelių lygyje pastebėjo Bouffler ir kt . (26). Šiame tyrime, p53 +/− pelėms buvo žymiai didesnis spontaninių chromosomų aberacijų skaičius, palyginti su p53 +/+ pelėms, o dažnis yra tarpinis tarp p53 +/+ ir p53 −/− pelėms. Panašiai, Clarke ir kt . (27) pranešė, kad apoptozė yra iš dalies sutrikusi p53 +/− pelėms. Venkatachalamas ir kt . ( 16 ) vėliau patvirtino haploinsufficiency Trp53 analizuojant navikus iš p53 +/− pelėms. Tyrime 217 m p53 +/− pelių, maždaug pusė visų navikų išliko laukinio tipo 53 p alelis. Priešingai nei p53 +/− navikai, kurie praranda likusį laukinio tipo alelį, tie navikai, turintys laukinio tipo alelio susilaikymą, išreiškė funkcinį p53 baltymą, kuris išsaugojo gebėjimą sukelti apoptozę po švitinimo, sukelti p21 ir Mdm2 ekspresiją ir slopinti PCNA ekspresiją.

Nuo 1998 m. augantis auglių slopinančių genų skaičius parodė haploinsufficientą (I lentelė). Vienas iš naujausių pavyzdžių su geriausiai suprantamu haploinsufficiento mechanizmu yra Nkx3.1. Nkx3.1 koduoja homeobox baltymą, kuris yra specifiškai ekspresuojamas luminaliniame prostatos epitelyje. Nkx3.1 +/− pelėms išsivysto prostatos hiperplazija, neprarandant likusio laukinio tipo alelio (28). „Microarray“ analizė nustatė keletą Nkx3.1 tikslinių genų, kurie reprezentavo įvairius atsakymus į Nkx3.1 genų dozė (29). Kai kurie genai, pvz. probazinai buvo santykinai nejautrūs genų dozei ir sudarė 70–80 % normalios ekspresijos Nkx3.1 hemizigotų, o kitų genų, tokių kaip intelektinas, ekspresija buvo prarasta Nkx3.1 hemizigotai.Tarp dviejų kraštutinumų buvo keletas genų, kurių ekspresija Nkx3.1 hemizigotų svyravo nuo 16 iki 55% laukinio tipo ekspresijos. Autoriai pasisakė už stochastinį genų ekspresijos modelį, kuriame Nkx3.1 geno dozė turi įtakos tikslinio geno ekspresijos bet kurioje ląstelėje tikimybei. Nkx3.1 atveju haploino nepakankamumo įrodymai daugiausia priklausė nuo konkretaus tiriamo fenotipo (ty probazino ekspresijos, palyginti su intelektino ekspresija), o tai rodo, kad sunku nustatyti daugiafunkcinį naviko slopintuvą kaip haplonepakankamą ar ne.

Haplonepakankami naviko slopinimo genai

Genas . Paveldima žmogaus vėžio asociacija. Sporadinė žmogaus vėžio asociacija. Haplonepakankamas fenotipas.
7 priedas? Sumažėjęs sporadinio prostatos, daugiaformės glioblastomos ir hormonų receptorių neigiamo krūties vėžio reguliavimas (71–73) Keli pelės audiniai: limfoma, kepenų ląstelių karcinoma ir plaučių adenoma (74)
Apc FAP coli sindromo mutacija ( 75 , 76 ) Mutuoja sporadiniais gaubtinės ir tiesiosios žarnos, skrandžio, kasos, skydliaukės ir kiaušidžių vėžio atvejais (77) Ląstelių linijų su aktyvuota v-Ha-ras navikiškumas nuogoms pelėms (78)
Arf Mutuota sergant šeimine melanoma ir nerviniais navikais ( 79 ) Mutuoja esant daugeliui sporadinių vėžio tipų (specifinis ARF sergant ūmine T-ląstelių limfoblastine leukemija ir metastazavusia melanoma) (80–82) Skatina hipermetilaciją sergant burnos plokščiųjų ląstelių karcinoma (83) Žmogaus melanoma (84) pelių DMBA/TPA sukelta papiloma (85)
Atm ** Mutavo sergant ataksija telangiektazija (86) Padidėjęs heterozigotų jautrumas krūties vėžiui (apžvelgta 87 nuorodoje) Mutuoja keliose leukemijos ir limfomos formose (apžvelgta 88 nuorodoje) Retai mutavusi, bet dažnai sumažėjusi reguliacija sergant sporadiniu krūties vėžiu (89–91) Padidėjęs jautrumas subletalinėms jonizuojančiosios spinduliuotės dozėms, nulemtas gyvenimo trukmės ir priešlaikinio papilkėjimo (92)
Atr Seckel sindromo mutacija (peržiūrėta 93 nuorodoje) Mutuotas mikrosatelite nestabiliame endometriumo ir virškinimo trakto vėžyje ( 94 , 95 ) Mlh1 sukelta pelių užkrūčio liaukos limfoma ir žarnyno adenokarcinomos (96)
Beclin1? Sumažėjęs sporadinio krūties vėžio reguliavimas (97, 98) Pelių limfoma, kepenų ląstelių karcinoma ir plaučių adenokarcinoma (99, 100)
Bim? Mantijos ląstelių limfomose dažnai reguliuojamas kartu su lydinčiu LOH (101), bet šiaip iki šiol buvo paskelbta nedaug mutacijų ekranų. Eμ-Myc sukelta pelių B ląstelių leukemija (102)
Blm Mutated in Blooms sindromas ( 103 ) Mutavo sporadinio mikrosatelito nestabilaus virškinimo trakto vėžio atveju ( 104 , 105 ) Pelių leukemijos viruso sukelta limfoma, Apc min sukelta žarnyno adenoma (106)
BRCA1 ** Mutacija sergant šeiminiu krūties ir kiaušidžių vėžio sindromu ( 107 , 108 ) Retai mutavęs, bet dažnai sumažintas sporadinio krūties (apžvelgta 109 nuorodoje), kiaušidžių (apžvelgta 110 nuorodoje) ir kasos (111) vėžio atveju. Žmogaus limfoblastoidų ( 112 ) ir fibroblastų ( 113 ) linijų radiosensibilizacija ir genomo stabilumo palaikymas
BRCA2 ** Mutacija sergant šeiminiu krūties ir kiaušidžių vėžio sindromu ( 114 , 115 ) Retai mutavęs sporadinio vėžio atveju, analizuotas iki šiol (116–120) Žmogaus limfoblastoidų ( 112 ) ir fibroblastų ( 113 ) linijų radiosensibilizacija ir genomo stabilumo palaikymas
Bub3 ** ? Dažnas LOH sergant osteosarkoma (121), bet retai mutavęs sporadinio vėžio atveju, išanalizuotas iki šiol (122, 123) Genomo stabilumo palaikymas MEF, bet nėra aptinkamo naviko formavimosi skirtumo in vivo ( 124 )
CBFA2 / AML1 / RUNX1 Mutavo dėl šeiminio trombocitų sutrikimo su polinkiu į ūminę mieloleukemiją ( 30 ) Mutuota sporadinėje ūminėje mielogeninėje leukemijoje ( 125 , 126 ) Žmogaus ūminė mielogeninė leukemija ( 30 )
Cdh1 (E-cad) Mutacija sergant šeiminiu skrandžio vėžiu ( 127 ) Mutuoja sergant sporadine difuzinio tipo skrandžio ir skiltine krūties karcinoma (128) Dažnai sumažėjęs sporadinis epitelio vėžys (apžvelgta 129 nuorodoje) Apc 1638N sukelta pelių adenoma ir adenokarcinoma (130)
Cdkn1a (p21 Waf1 / Cip1 )** Genetiniai variantai, susiję su padidėjusia krūties vėžio ir sarkomos (131), plaučių vėžio (132, 133), odos, galvos ir kaklo vėžio (134, 135) ir gimdos kaklelio vėžio (136) rizika Sumažėjusi raiška sergant kepenų ląstelių karcinoma (137), tačiau retai mutavusi iki šiol analizuotų vėžio formų atveju (137–141) Pelės epitelio audiniai: kietosios liaukos adenokarcinoma ir granulozės ląstelių kiaušidžių navikas (142)
Cdkn1b (p27 Kip1 ) ? Retai mutuojantis, bet dažnai sumažintas daugelio atsitiktinių vėžio tipų reguliavimas (apžvelgta 46 nuorodoje) Keli pelių epitelio audiniai: žarnyno adenoma ir adenokarcinoma, plaučių adenoma, granulozinių ląstelių kiaušidžių navikas, endometriumo adenoma ir adenokarcinoma, angiosarkoma, antinksčių adenoma, hipofizės adenoma, užkrūčio liaukos limfoma (15)
Cdkn2c (p18 Ink4c ) ? Retai mutavęs, bet sumažėjęs kai kurių atsitiktinių vėžio formų reguliavimas (143–145) Pelių DMN sukelta plaučių adenokarcinoma ir kepenų hemangiosarkoma (146)
Chk1 ** ? Mutavo dėl mikrosatelito nestabilaus endometriumo ir virškinimo trakto vėžio ( 95 , 147 ) Genomo stabilumo palaikymas normaliose pelių pieno liaukose ( 148 )
Dmp1? Iki šiol paskelbta nedaug mutacijų ekranų Eμ-Myc sukelta pelių limfoma (149)
Fbxw7 (Cdc4) ? Mutuoja sporadiniuose endometriumo (150), kasos (151) ir gaubtinės ir tiesiosios žarnos (152) vėžio atveju Keli pelės audiniai: plaučių adenokarcinoma, hepatokarcinoma, cholangiokarcinoma, granuliozinių ląstelių navikas, hemangiosarkoma, fibrosarkoma, užkrūčio liaukos limfoma (153)
Fen1? Retai mutavęs sporadinio vėžio atveju, išanalizuotas iki šiol ( 154 , 155 ) Apc 1638N sukelta pelių adenoma ir adenokarcinoma (156)
H2AX? Retai mutavusi, bet dažnai LOH sergant B ląstelių limfoma (157, 158) Pelių užkrūčio liaukos limfoma, sarkoma ir leukemija (159)
Lig4 Lig4 sindromo mutacija (apžvelgta 93 nuorodoje) Genetiniai variantai, susiję su padidėjusia krūties vėžio (160), daugybinės mielomos (161) ir plaučių vėžio (162) rizika Retai mutavusi sporadinio vėžio atveju, analizuota iki šiol ( 163 ) Pelių minkštųjų audinių sarkomos ink4a/arf −/− pelėms (164)
Lkb1 Mutacija sergant Peutz-Jeghers sindromu (165, 166) Mutuoja sergant sporadiniu plaučių, kasos ir tulžies takų vėžiu, bet retai mutavo sergant kitais atsitiktiniais vėžiniais susirgimais, susijusiais su Peutz-Jeghers sindromu (167–171). Pelių skrandžio adenoma, žarnyno adenoma (172)
Beprotis2 ** ? Dažnai sumažėjęs kepenų ląstelių karcinomos reguliavimas (173), bet retai mutavęs sporadinio vėžio atveju, išanalizuotas iki šiol (123, 174, 175). Genomo stabilumo palaikymas pelių embrioniniuose fibroblastuose ( 176 )
Mlhl ** Paveldimo nepolipozinio coli vėžio (HNPCC) sindromo mutacija (177, 178) Mutavo sergant sporadiniu mikrosatelito nestabiliu gaubtinės ir tiesiosios žarnos vėžiu (179, 180) Skatina hipermetilinimą sergant sporadiniu mikrosatelitu nestabiliu gaubtinės ir tiesiosios žarnos vėžiu (181), skrandžio (182), galvos ir kaklo vėžiu (183), taip pat melanoma (184 ir 185) Mutacijų dažnis in Mgmt -/- fibroblastai, apdoroti alkilinančiomis medžiagomis ( 186 )
Msh2 Mutacija sergant paveldimu nepolipozės coli vėžio (HNPCC) sindromu (187) Mutuotas sporadiniame mikrosatelito nestabiliame gaubtinės ir tiesiosios žarnos vėžyje ( 179 , 180 , 188 ) Keli pelės audiniai: plaučių adenoma, kepenų adenoma, pieno liaukos adenoma, gimdos adenoma, hemangiosarkoma (189) Seserų chromatidų pasikeitimas MNNG apdorotuose MEF (190) ir oksidacinis pažeidimas apšvitintuose MEF (191)
Mus81? Iki šiol paskelbta nedaug mutacijų ekranų Pelės užkrūčio liaukos limfoma, sarkoma, krūties karcinoma, kiaušidžių karcinoma (192)
Nf1 Mutavo sergant 1 tipo neurofibromatoze ( 193 ) Mutuota sergant sporadine gaubtinės žarnos adenokarcinoma (194), mielodisplaziniu sindromu (194) ir astrocitoma (194, 195), taip pat glioblastoma, ependimoma ir primityviais neuroektoderminiais navikais (195) Ne autonominis veikimas putliosiose ląstelėse, supančiose pelių neurofibromą (196)
Nkx3.1 (NKX3A) ? Retai mutavęs, bet dažnai sumažintas sporadinio sėklidžių lytinių ląstelių vėžio ir metastazavusio prostatos vėžio atveju (197–199) Pelės prostatos intraepitelinė neoplazija ( 29 )
Plk4? Iki šiol paskelbta nedaug mutacijų ekranų Pelių kepenų ląstelių karcinoma ir plaučių adenokarcinoma ( 200 )
Prkar1a Mutavo Carney komplekse, šeiminiame daugybinio neoplazijos sindromo (201, 202) Dažnas sumažėjęs reguliavimas ir LOH sporadinio skydliaukės, antinksčių, kiaušidžių ir gaubtinės žarnos vėžio atvejais, tačiau retai mutavo esant sporadiniam vėžiui, analizuotam iki šiol (apžvelgta 203 nuorodoje) Pelių sarkomos ir hepatoceliulinės karcinomos ( 204 ) Žmogaus akių vokų miksoma Carney komplekse ( 205 )
Ptch Nevoidinių bazinių ląstelių karcinomos sindromo mutacija ( 206 , 207 ) Mutavo sergant sporadine medulloblastoma (208–211) Pelės meduloblastoma ( 212 )
Pten Mutuoja keliuose retuose autosominiuose dominuojančiuose hamartomatoziniuose sindromuose, įskaitant Cowden sindromą (213). Mutuoja daugybinių sporadinių vėžio atvejų (peržiūrėta 214 nuorodoje) Pelės TRAMP sukelta prostatos adenokarcinoma (215) ir pelių prostatos intraepitelinė neoplazija (216)
Rb ** Mutuota sergant šeimine retinoblastoma ( 4 ) Mutavo sergant daugybe sporadinių vėžio formų, įskaitant retinoblastomą (217), smulkialąstelinį plaučių (218, 219), osteosarkomą (220) ir latakų kasą (221). Žymeklių priežiūra pelių embrioninėse kamieninėse ląstelėse ( 222 )
Ribosomų baltymų genai (pvz. L35 , L37a , RPS19 ir S8 ) RPS19 , žmogaus ribosomų baltymo genas, yra mutavęs sergant šeimine Diamond-Blackfan anemija, turinčia polinkį į leukemiją (kai kuriose šeimose yra haploinsufficiento įrodymas) (223, 224). Iki šiol paskelbta nedaug mutacijų ekranų Keli zebražuvių audiniai: piktybinis periferinio nervo apvalkalo navikas, limfoma, žarnyno adenokarcinoma, kasos latakų karcinoma (225)
Smad4 / Dpc4 Mutuota sergant šeimine jaunatvine polipoze ( 226 ) Mutuoja sporadiškai gaubtinės žarnos ir kasos vėžio atveju (227–229) Pelės skrandžio adenoma ( 230 )
Tsc2 Mutavo gumbinės sklerozės komplekse ( 231 , 232 ) Mutavo sergant plaučių limfangioleiomiomatoze (233), bet retai mutavo esant kitiems sporadiniams iki šiol analizuojamiems vėžiams (apžvelgta 234 nuorodoje) Pelių sukelta prostatos adenokarcinoma (216)
Trp53 Li-Fraumeni sindromo mutacija (peržiūrėta 235 nuorodoje) Mutuoja daugybinių sporadinių vėžio atvejų (peržiūrėta 236 nuorodoje) Pelių sarkoma, osteosarkoma ir limfoma ( 16 ) Pelių šlapimo pūslės karcinoma ( 237 ) Žmogaus Li-Fraumeni sindromas ( 238 )
Tgfb Mutavo sergant Camurati-Engelmann liga, retu kaulų sutrikimu (239), (peržiūrėta 240 nuorodoje) Retai mutavo sporadiniuose vėžiuose, kurie iki šiol buvo analizuojami, nors daugelis kelio komponentų yra mutuoti (apžvelgta 241 nuorodoje) Pelės dietilnitrozamino (DEN) sukelta kepenų ląstelių adenoma, etilo karbamato sukelta plaučių adenoma (17)
Genas . Paveldima žmogaus vėžio asociacija. Sporadinė žmogaus vėžio asociacija. Haplonepakankamas fenotipas.
7 priedas? Sumažėjęs sporadinio prostatos, daugiaformės glioblastomos ir hormonų receptorių neigiamo krūties vėžio reguliavimas (71–73) Keli pelės audiniai: limfoma, kepenų ląstelių karcinoma ir plaučių adenoma (74)
Apc FAP coli sindromo mutacija ( 75 , 76 ) Mutuoja sporadiniais gaubtinės ir tiesiosios žarnos, skrandžio, kasos, skydliaukės ir kiaušidžių vėžio atvejais (77) Ląstelių linijų su aktyvuota v-Ha-ras navikiškumas nuogoms pelėms (78)
Arf Mutuota sergant šeimine melanoma ir nerviniais navikais ( 79 ) Mutuoja esant daugeliui sporadinių vėžio tipų (specifinis ARF sergant ūmine T-ląstelių limfoblastine leukemija ir metastazavusia melanoma) (80–82) Skatina hipermetilaciją sergant burnos plokščiųjų ląstelių karcinoma (83) Žmogaus melanoma (84) pelių DMBA/TPA sukelta papiloma (85)
Atm ** Mutavo sergant ataksija telangiektazija (86) Padidėjęs heterozigotų jautrumas krūties vėžiui (apžvelgta 87 nuorodoje) Mutuoja keliose leukemijos ir limfomos formose (apžvelgta 88 nuorodoje) Retai mutavusi, bet dažnai sumažėjusi reguliacija sergant sporadiniu krūties vėžiu (89–91) Padidėjęs jautrumas subletalinėms jonizuojančiosios spinduliuotės dozėms, nulemtas gyvenimo trukmės ir priešlaikinio papilkėjimo (92)
Atr Seckel sindromo mutacija (peržiūrėta 93 nuorodoje) Mutuotas mikrosatelite nestabiliame endometriumo ir virškinimo trakto vėžyje ( 94 , 95 ) Mlh1 sukelta pelių užkrūčio liaukos limfoma ir žarnyno adenokarcinomos (96)
Beclin1? Sumažėjęs sporadinio krūties vėžio reguliavimas (97, 98) Pelių limfoma, kepenų ląstelių karcinoma ir plaučių adenokarcinoma (99, 100)
Bim? Mantijos ląstelių limfomose dažnai sumažinamas kartu su lydinčiu LOH (101), tačiau šiaip iki šiol buvo paskelbta nedaug mutacijų ekranų. Eμ-Myc sukelta pelių B ląstelių leukemija (102)
Blm Mutated in Blooms sindromas ( 103 ) Mutavo sporadinio mikrosatelito nestabilaus virškinimo trakto vėžio atveju ( 104 , 105 ) Pelių leukemijos viruso sukelta limfoma, Apc min sukelta žarnyno adenoma (106)
BRCA1 ** Mutacija sergant šeiminiu krūties ir kiaušidžių vėžio sindromu ( 107 , 108 ) Retai mutavęs, bet dažnai sumažintas sporadinio krūties (apžvelgta 109 nuorodoje), kiaušidžių (apžvelgta 110 nuorodoje) ir kasos (111) vėžio atveju. Žmogaus limfoblastoidų ( 112 ) ir fibroblastų ( 113 ) linijų radiosensibilizacija ir genomo stabilumo palaikymas
BRCA2 ** Mutacija sergant šeiminiu krūties ir kiaušidžių vėžio sindromu ( 114 , 115 ) Retai mutavęs sporadinio vėžio atveju, analizuojamas iki šiol (116–120) Žmogaus limfoblastoidų ( 112 ) ir fibroblastų ( 113 ) linijų radiosensibilizacija ir genomo stabilumo palaikymas
Bub3 ** ? Dažnas LOH sergant osteosarkoma (121), bet retai mutavęs sporadinio vėžio atveju, išanalizuotas iki šiol (122, 123) Genomo stabilumo palaikymas MEF, bet nėra aptinkamo naviko formavimosi skirtumo in vivo ( 124 )
CBFA2 / AML1 / RUNX1 Mutavo dėl šeiminio trombocitų sutrikimo su polinkiu į ūminę mieloleukemiją ( 30 ) Mutavo sergant sporadine ūmine mieloleukemija ( 125 , 126 ) Žmogaus ūminė mielogeninė leukemija ( 30 )
Cdh1 (E-cad) Mutacija sergant šeiminiu skrandžio vėžiu ( 127 ) Mutuoja sergant sporadine difuzinio tipo skrandžio ir skiltine krūties karcinoma (128) Dažnai sumažėjęs sporadinis epitelio vėžys (apžvelgta 129 nuorodoje) Apc 1638N sukelta pelių adenoma ir adenokarcinoma (130)
Cdkn1a (p21 Waf1 / Cip1 )** Genetiniai variantai, susiję su padidėjusia krūties vėžio ir sarkomos (131), plaučių vėžio (132, 133), odos, galvos ir kaklo vėžio (134, 135) ir gimdos kaklelio vėžio (136) rizika Sumažėjusi raiška sergant kepenų ląstelių karcinoma (137), bet retai mutavusi iki šiol analizuotų vėžio formų atveju (137–141) Pelės epitelio audiniai: kietosios liaukos adenokarcinoma ir granulozės ląstelių kiaušidžių navikas (142)
Cdkn1b (p27 Kip1 ) ? Retai mutuojantis, bet dažnai sumažintas daugelio atsitiktinių vėžio tipų reguliavimas (apžvelgta 46 nuorodoje) Keli pelių epitelio audiniai: žarnyno adenoma ir adenokarcinoma, plaučių adenoma, granulozinių ląstelių kiaušidžių navikas, endometriumo adenoma ir adenokarcinoma, angiosarkoma, antinksčių adenoma, hipofizės adenoma, užkrūčio liaukos limfoma (15)
Cdkn2c (p18 Ink4c ) ? Retai mutavęs, bet sumažėjęs kai kurių atsitiktinių vėžio formų reguliavimas (143–145) Pelių DMN sukelta plaučių adenokarcinoma ir kepenų hemangiosarkoma (146)
Chk1 ** ? Mutuotas mikrosatelite nestabiliame endometriumo ir virškinimo trakto vėžyje ( 95 , 147 ) Genomo stabilumo palaikymas normaliose pelių pieno liaukose ( 148 )
Dmp1? Iki šiol paskelbta nedaug mutacijų ekranų Eμ-Myc sukelta pelių limfoma (149)
Fbxw7 (Cdc4) ? Mutuoja sporadiniuose endometriumo (150), kasos (151) ir gaubtinės ir tiesiosios žarnos (152) vėžio atveju Keli pelės audiniai: plaučių adenokarcinoma, hepatokarcinoma, cholangiokarcinoma, granuliozinių ląstelių navikas, hemangiosarkoma, fibrosarkoma, užkrūčio liaukos limfoma (153)
Fen1? Retai mutavęs sporadiniuose vėžiuose, išanalizuoti iki šiol ( 154 , 155 ) Apc 1638N sukelta pelių adenoma ir adenokarcinoma (156)
H2AX? Retai mutavusi, bet dažnai LOH sergant B ląstelių limfoma (157, 158) Pelių užkrūčio liaukos limfoma, sarkoma ir leukemija (159)
Lig4 Lig4 sindromo mutacija (apžvelgta 93 nuorodoje) Genetiniai variantai, susiję su padidėjusia krūties vėžio (160), daugybinės mielomos (161) ir plaučių vėžio (162) rizika Retai mutavusi sporadinio vėžio atveju, analizuota iki šiol ( 163 ) Pelių minkštųjų audinių sarkomos ink4a/arf −/− pelėms (164)
Lkb1 Mutacija sergant Peutz-Jeghers sindromu (165, 166) Mutuoja sergant sporadiniu plaučių, kasos ir tulžies takų vėžiu, bet retai mutavo sergant kitais atsitiktiniais vėžiniais susirgimais, susijusiais su Peutz-Jeghers sindromu (167–171). Pelių skrandžio adenoma, žarnyno adenoma (172)
Beprotis2 ** ? Dažnai sumažėjęs kepenų ląstelių karcinomos reguliavimas (173), bet retai mutavęs sporadinio vėžio atveju, išanalizuotas iki šiol (123, 174, 175). Genomo stabilumo palaikymas pelių embrioniniuose fibroblastuose ( 176 )
Mlhl ** Paveldimo nepolipozinio coli vėžio (HNPCC) sindromo mutacija (177, 178) Mutavo sergant sporadiniu mikrosatelito nestabiliu gaubtinės ir tiesiosios žarnos vėžiu (179, 180) Skatina hipermetilinimą sergant sporadiniu mikrosatelitu nestabiliu gaubtinės ir tiesiosios žarnos vėžiu (181), skrandžio (182), galvos ir kaklo vėžiu (183), taip pat melanoma (184 ir 185) Mutacijų dažnis in Mgmt -/- fibroblastai, apdoroti alkilinančiomis medžiagomis ( 186 )
Msh2 Mutacija sergant paveldimu nepolipozės coli vėžio (HNPCC) sindromu (187) Mutuotas sporadiniame mikrosatelito nestabiliame gaubtinės ir tiesiosios žarnos vėžyje ( 179 , 180 , 188 ) Keli pelės audiniai: plaučių adenoma, kepenų adenoma, pieno liaukos adenoma, gimdos adenoma, hemangiosarkoma (189) Seserų chromatidų pasikeitimas MNNG apdorotuose MEF (190) ir oksidacinis pažeidimas apšvitintuose MEF (191)
Mus81? Iki šiol paskelbta nedaug mutacijų ekranų Pelės užkrūčio liaukos limfoma, sarkoma, krūties karcinoma, kiaušidžių karcinoma (192)
Nf1 Mutavo sergant 1 tipo neurofibromatoze ( 193 ) Mutuota sergant sporadine gaubtinės žarnos adenokarcinoma (194), mielodisplaziniu sindromu (194) ir astrocitoma (194, 195), taip pat glioblastoma, ependimoma ir primityviais neuroektoderminiais navikais (195) Ne autonominis veikimas putliosiose ląstelėse, supančiose pelių neurofibromą (196)
Nkx3.1 (NKX3A) ? Retai mutavęs, bet dažnai sumažintas sporadinio sėklidžių lytinių ląstelių vėžio ir metastazavusio prostatos vėžio atveju (197–199) Pelės prostatos intraepitelinė neoplazija ( 29 )
Plk4? Iki šiol paskelbta nedaug mutacijų ekranų Pelių kepenų ląstelių karcinoma ir plaučių adenokarcinoma ( 200 )
Prkar1a Mutavo Carney komplekse, šeiminiame daugybinio neoplazijos sindromo (201, 202) Dažnas sumažėjęs reguliavimas ir LOH sporadinio skydliaukės, antinksčių, kiaušidžių ir gaubtinės žarnos vėžio atvejais, tačiau retai mutavo esant sporadiniam vėžiui, analizuotam iki šiol (apžvelgta 203 nuorodoje) Pelių sarkomos ir hepatoceliulinės karcinomos ( 204 ) Žmogaus akių vokų miksoma Carney komplekse ( 205 )
Ptch Nevoidinių bazinių ląstelių karcinomos sindromo mutacija ( 206 , 207 ) Mutavo sergant sporadine medulloblastoma (208–211) Pelės meduloblastoma ( 212 )
Pten Mutuoja keliuose retuose autosominiuose dominuojančiuose hamartomatoziniuose sindromuose, įskaitant Cowden sindromą (213). Mutuoja daugybinių sporadinių vėžio atvejų (peržiūrėta 214 nuorodoje) Pelės TRAMP sukelta prostatos adenokarcinoma (215) ir pelių prostatos intraepitelinė neoplazija (216)
Rb ** Mutuota sergant šeimine retinoblastoma ( 4 ) Mutavo sergant daugybe sporadinių vėžio formų, įskaitant retinoblastomą (217), smulkialąstelinį plaučių (218, 219), osteosarkomą (220) ir latakų kasą (221). Žymeklių priežiūra pelių embrioninėse kamieninėse ląstelėse ( 222 )
Ribosomų baltymų genai (pvz. L35 , L37a , RPS19 ir S8 ) RPS19 , žmogaus ribosomų baltymo genas, yra mutavęs sergant šeimine Diamond-Blackfan anemija, turinčia polinkį į leukemiją (kai kuriose šeimose yra haploinsufficiento įrodymas) (223, 224). Iki šiol paskelbta nedaug mutacijų ekranų Keli zebražuvių audiniai: piktybinis periferinio nervo apvalkalo navikas, limfoma, žarnyno adenokarcinoma, kasos latakų karcinoma (225)
Smad4 / Dpc4 Mutuota sergant šeimine jaunatvine polipoze ( 226 ) Mutuoja sporadiškai gaubtinės žarnos ir kasos vėžio atveju (227–229) Pelės skrandžio adenoma ( 230 )
Tsc2 Mutavo gumbinės sklerozės komplekse ( 231 , 232 ) Mutavo sergant plaučių limfangioleiomiomatoze (233), bet retai mutavo esant kitiems sporadiniams iki šiol analizuojamiems vėžiams (apžvelgta 234 nuorodoje) Pelių sukelta prostatos adenokarcinoma (216)
Trp53 Li-Fraumeni sindromo mutacija (peržiūrėta 235 nuorodoje) Mutuoja daugybinių sporadinių vėžio atvejų (peržiūrėta 236 nuorodoje) Pelių sarkoma, osteosarkoma ir limfoma ( 16 ) Pelių šlapimo pūslės karcinoma ( 237 ) Žmogaus Li-Fraumeni sindromas ( 238 )
Tgfb Mutavo sergant Camurati-Engelmann liga, retu kaulų sutrikimu (239), (peržiūrėta 240 nuorodoje) Retai mutavo sporadiniuose vėžiuose, kurie iki šiol buvo analizuojami, nors daugelis kelio komponentų yra mutuoti (apžvelgta 241 nuorodoje) Pelės dietilnitrozamino (DEN) sukelta kepenų ląstelių adenoma, etilo karbamato sukelta plaučių adenoma (17)

Haploinsufficientas navikams slopinti in vivo (kaip nustatyta pagal pagreitėjusią naviko atsiradimą heterozigotiniame organizme, aiškiai išlaikant naviko laukinio tipo alelį) nėra aiškiai įrodyta.

Haplonepakankami naviko slopinimo genai

Genas . Paveldima žmogaus vėžio asociacija. Sporadinė žmogaus vėžio asociacija. Haplonepakankamas fenotipas.
7 priedas? Sumažėjęs sporadinio prostatos, daugiaformės glioblastomos ir hormonų receptorių neigiamo krūties vėžio reguliavimas (71–73) Keli pelės audiniai: limfoma, kepenų ląstelių karcinoma ir plaučių adenoma (74)
Apc FAP coli sindromo mutacija ( 75 , 76 ) Mutuoja sporadiniais gaubtinės ir tiesiosios žarnos, skrandžio, kasos, skydliaukės ir kiaušidžių vėžio atvejais (77) Ląstelių linijų su aktyvuota v-Ha-ras navikiškumas nuogoms pelėms (78)
Arf Mutuota sergant šeimine melanoma ir nerviniais navikais ( 79 ) Mutuoja esant daugeliui sporadinių vėžio tipų (specifinis ARF sergant ūmine T-ląstelių limfoblastine leukemija ir metastazavusia melanoma) (80–82) Skatina hipermetilaciją sergant burnos plokščiųjų ląstelių karcinoma (83) Žmogaus melanoma (84) pelių DMBA/TPA sukelta papiloma (85)
Atm ** Mutavo sergant ataksija telangiektazija (86) Padidėjęs heterozigotų jautrumas krūties vėžiui (apžvelgta 87 nuorodoje) Mutuoja keliose leukemijos ir limfomos formose (apžvelgta 88 nuorodoje) Retai mutavusi, bet dažnai sumažėjusi reguliacija sergant sporadiniu krūties vėžiu (89–91) Padidėjęs jautrumas subletalinėms jonizuojančiosios spinduliuotės dozėms, nulemtas gyvenimo trukmės ir priešlaikinio papilkėjimo (92)
Atr Seckel sindromo mutacija (peržiūrėta 93 nuorodoje) Mutuotas mikrosatelite nestabiliame endometriumo ir virškinimo trakto vėžyje ( 94 , 95 ) Mlh1 sukelta pelių užkrūčio liaukos limfoma ir žarnyno adenokarcinomos (96)
Beclin1? Sumažėjęs sporadinio krūties vėžio reguliavimas (97, 98) Pelių limfoma, kepenų ląstelių karcinoma ir plaučių adenokarcinoma (99, 100)
Bim? Mantijos ląstelių limfomose dažnai sumažinamas kartu su lydinčiu LOH (101), tačiau šiaip iki šiol buvo paskelbta nedaug mutacijų ekranų. Eμ-Myc sukelta pelių B ląstelių leukemija (102)
Blm Mutated in Blooms sindromas ( 103 ) Mutavo sporadinio mikrosatelito nestabilaus virškinimo trakto vėžio atveju ( 104 , 105 ) Pelių leukemijos viruso sukelta limfoma, Apc min sukelta žarnyno adenoma (106)
BRCA1 ** Mutacija sergant šeiminiu krūties ir kiaušidžių vėžio sindromu ( 107 , 108 ) Retai mutavęs, bet dažnai sumažintas sporadinio krūties (apžvelgta 109 nuorodoje), kiaušidžių (apžvelgta 110 nuorodoje) ir kasos (111) vėžio atveju. Žmogaus limfoblastoidų ( 112 ) ir fibroblastų ( 113 ) linijų radiosensibilizacija ir genomo stabilumo palaikymas
BRCA2 ** Mutacija sergant šeiminiu krūties ir kiaušidžių vėžio sindromu ( 114 , 115 ) Retai mutavęs sporadinio vėžio atveju, analizuojamas iki šiol (116–120) Žmogaus limfoblastoidų ( 112 ) ir fibroblastų ( 113 ) linijų radiosensibilizacija ir genomo stabilumo palaikymas
Bub3 ** ? Dažnas LOH sergant osteosarkoma (121), bet retai mutavęs sporadinio vėžio atveju, išanalizuotas iki šiol (122, 123) Genomo stabilumo palaikymas MEF, bet nėra aptinkamo naviko formavimosi skirtumo in vivo ( 124 )
CBFA2 / AML1 / RUNX1 Mutavo dėl šeiminio trombocitų sutrikimo su polinkiu į ūminę mieloleukemiją ( 30 ) Mutavo sergant sporadine ūmine mieloleukemija ( 125 , 126 ) Žmogaus ūminė mielogeninė leukemija ( 30 )
Cdh1 (E-cad) Mutacija sergant šeiminiu skrandžio vėžiu ( 127 ) Mutuoja sergant sporadine difuzinio tipo skrandžio ir skiltine krūties karcinoma (128) Dažnai sumažėjęs sporadinis epitelio vėžys (apžvelgta 129 nuorodoje) Apc 1638N sukelta pelių adenoma ir adenokarcinoma (130)
Cdkn1a (p21 Waf1 / Cip1 )** Genetiniai variantai, susiję su padidėjusia krūties vėžio ir sarkomos (131), plaučių vėžio (132, 133), odos, galvos ir kaklo vėžio (134, 135) ir gimdos kaklelio vėžio (136) rizika Sumažėjusi raiška sergant kepenų ląstelių karcinoma (137), bet retai mutavusi iki šiol analizuotų vėžio formų atveju (137–141) Pelės epitelio audiniai: kietosios liaukos adenokarcinoma ir granulozės ląstelių kiaušidžių navikas (142)
Cdkn1b (p27 Kip1 ) ? Retai mutuojantis, bet dažnai sumažintas daugelio atsitiktinių vėžio tipų reguliavimas (apžvelgta 46 nuorodoje) Keli pelių epitelio audiniai: žarnyno adenoma ir adenokarcinoma, plaučių adenoma, granulozinių ląstelių kiaušidžių navikas, endometriumo adenoma ir adenokarcinoma, angiosarkoma, antinksčių adenoma, hipofizės adenoma, užkrūčio liaukos limfoma (15)
Cdkn2c (p18 Ink4c ) ? Retai mutavęs, bet sumažėjęs kai kurių atsitiktinių vėžio formų reguliavimas (143–145) Pelių DMN sukelta plaučių adenokarcinoma ir kepenų hemangiosarkoma (146)
Chk1 ** ? Mutuotas mikrosatelite nestabiliame endometriumo ir virškinimo trakto vėžyje ( 95 , 147 ) Genomo stabilumo palaikymas normaliose pelių pieno liaukose ( 148 )
Dmp1? Iki šiol paskelbta nedaug mutacijų ekranų Eμ-Myc sukelta pelių limfoma (149)
Fbxw7 (Cdc4) ? Mutuoja sporadiniuose endometriumo (150), kasos (151) ir gaubtinės ir tiesiosios žarnos (152) vėžio atveju Keli pelės audiniai: plaučių adenokarcinoma, hepatokarcinoma, cholangiokarcinoma, granuliozinių ląstelių navikas, hemangiosarkoma, fibrosarkoma, užkrūčio liaukos limfoma (153)
Fen1? Retai mutavęs sporadiniuose vėžiuose, išanalizuoti iki šiol ( 154 , 155 ) Apc 1638N sukelta pelių adenoma ir adenokarcinoma (156)
H2AX? Retai mutavusi, bet dažnai LOH sergant B ląstelių limfoma (157, 158) Pelių užkrūčio liaukos limfoma, sarkoma ir leukemija (159)
Lig4 Lig4 sindromo mutacija (apžvelgta 93 nuorodoje) Genetiniai variantai, susiję su padidėjusia krūties vėžio (160), daugybinės mielomos (161) ir plaučių vėžio (162) rizika Retai mutavusi sporadinio vėžio atveju, analizuota iki šiol ( 163 ) Pelių minkštųjų audinių sarkomos ink4a/arf −/− pelėms (164)
Lkb1 Mutacija sergant Peutz-Jeghers sindromu (165, 166) Mutuoja sergant sporadiniu plaučių, kasos ir tulžies takų vėžiu, bet retai mutavo sergant kitais atsitiktiniais vėžiniais susirgimais, susijusiais su Peutz-Jeghers sindromu (167–171). Pelių skrandžio adenoma, žarnyno adenoma (172)
Beprotis2 ** ? Dažnai sumažėjęs kepenų ląstelių karcinomos reguliavimas (173), bet retai mutavęs sporadinio vėžio atveju, išanalizuotas iki šiol (123, 174, 175). Genomo stabilumo palaikymas pelių embrioniniuose fibroblastuose ( 176 )
Mlhl ** Paveldimo nepolipozinio coli vėžio (HNPCC) sindromo mutacija (177, 178) Mutavo sergant sporadiniu mikrosatelito nestabiliu gaubtinės ir tiesiosios žarnos vėžiu (179, 180) Skatina hipermetilinimą sergant sporadiniu mikrosatelitu nestabiliu gaubtinės ir tiesiosios žarnos vėžiu (181), skrandžio (182), galvos ir kaklo vėžiu (183), taip pat melanoma (184 ir 185) Mutacijų dažnis in Mgmt -/- fibroblastai, apdoroti alkilinančiomis medžiagomis ( 186 )
Msh2 Mutacija sergant paveldimu nepolipozės coli vėžio (HNPCC) sindromu (187) Mutuotas sporadiniame mikrosatelito nestabiliame gaubtinės ir tiesiosios žarnos vėžyje ( 179 , 180 , 188 ) Keli pelės audiniai: plaučių adenoma, kepenų adenoma, pieno liaukos adenoma, gimdos adenoma, hemangiosarkoma (189) Seserų chromatidų pasikeitimas MNNG apdorotuose MEF (190) ir oksidacinis pažeidimas apšvitintuose MEF (191)
Mus81? Iki šiol paskelbta nedaug mutacijų ekranų Pelės užkrūčio liaukos limfoma, sarkoma, krūties karcinoma, kiaušidžių karcinoma (192)
Nf1 Mutavo sergant 1 tipo neurofibromatoze ( 193 ) Mutuota sergant sporadine gaubtinės žarnos adenokarcinoma (194), mielodisplaziniu sindromu (194) ir astrocitoma (194, 195), taip pat glioblastoma, ependimoma ir primityviais neuroektoderminiais navikais (195) Ne autonominis veikimas putliosiose ląstelėse, supančiose pelių neurofibromą (196)
Nkx3.1 (NKX3A) ? Retai mutavęs, bet dažnai sumažintas sporadinio sėklidžių lytinių ląstelių vėžio ir metastazavusio prostatos vėžio atveju (197–199) Pelės prostatos intraepitelinė neoplazija ( 29 )
Plk4? Iki šiol paskelbta nedaug mutacijų ekranų Pelių kepenų ląstelių karcinoma ir plaučių adenokarcinoma ( 200 )
Prkar1a Mutavo Carney komplekse, šeiminiame daugybinio neoplazijos sindromo (201, 202) Dažnas sumažėjęs reguliavimas ir LOH sporadinio skydliaukės, antinksčių, kiaušidžių ir gaubtinės žarnos vėžio atvejais, tačiau retai mutavo esant sporadiniam vėžiui, analizuotam iki šiol (apžvelgta 203 nuorodoje) Pelių sarkomos ir hepatoceliulinės karcinomos ( 204 ) Žmogaus akių vokų miksoma Carney komplekse ( 205 )
Ptch Nevoidinių bazinių ląstelių karcinomos sindromo mutacija ( 206 , 207 ) Mutavo sergant sporadine medulloblastoma (208–211) Pelės meduloblastoma ( 212 )
Pten Mutuoja keliuose retuose autosominiuose dominuojančiuose hamartomatoziniuose sindromuose, įskaitant Cowden sindromą (213). Mutuoja daugybinių sporadinių vėžio atvejų (peržiūrėta 214 nuorodoje) Pelės TRAMP sukelta prostatos adenokarcinoma (215) ir pelių prostatos intraepitelinė neoplazija (216)
Rb ** Mutuota sergant šeimine retinoblastoma ( 4 ) Mutavo sergant daugybe sporadinių vėžio formų, įskaitant retinoblastomą (217), smulkialąstelinį plaučių (218, 219), osteosarkomą (220) ir latakų kasą (221). Žymeklių priežiūra pelių embrioninėse kamieninėse ląstelėse ( 222 )
Ribosomų baltymų genai (pvz. L35 , L37a , RPS19 ir S8 ) RPS19 , žmogaus ribosomų baltymo genas, yra mutavęs sergant šeimine Diamond-Blackfan anemija, turinčia polinkį į leukemiją (kai kuriose šeimose yra haploinsufficiento įrodymas) (223, 224). Iki šiol paskelbta nedaug mutacijų ekranų Keli zebražuvių audiniai: piktybinis periferinio nervo apvalkalo navikas, limfoma, žarnyno adenokarcinoma, kasos latakų karcinoma (225)
Smad4 / Dpc4 Mutuota sergant šeimine jaunatvine polipoze ( 226 ) Mutuoja sporadiškai gaubtinės žarnos ir kasos vėžio atveju (227–229) Pelės skrandžio adenoma ( 230 )
Tsc2 Mutavo gumbinės sklerozės komplekse ( 231 , 232 ) Mutavo sergant plaučių limfangioleiomiomatoze (233), bet retai mutavo esant kitiems sporadiniams iki šiol analizuojamiems vėžiams (apžvelgta 234 nuorodoje) Pelių sukelta prostatos adenokarcinoma (216)
Trp53 Li-Fraumeni sindromo mutacija (peržiūrėta 235 nuorodoje) Mutuoja daugybinių sporadinių vėžio atvejų (peržiūrėta 236 nuorodoje) Pelių sarkoma, osteosarkoma ir limfoma ( 16 ) Pelių šlapimo pūslės karcinoma ( 237 ) Žmogaus Li-Fraumeni sindromas ( 238 )
Tgfb Mutavo sergant Camurati-Engelmann liga, retu kaulų sutrikimu (239), (peržiūrėta 240 nuorodoje) Retai mutavo sporadiniuose vėžiuose, kurie iki šiol buvo analizuojami, nors daugelis kelio komponentų yra mutuoti (apžvelgta 241 nuorodoje) Pelės dietilnitrozamino (DEN) sukelta kepenų ląstelių adenoma, etilo karbamato sukelta plaučių adenoma (17)
Genas . Paveldima žmogaus vėžio asociacija. Sporadinė žmogaus vėžio asociacija. Haplonepakankamas fenotipas.
7 priedas? Sumažėjęs sporadinio prostatos, daugiaformės glioblastomos ir hormonų receptorių neigiamo krūties vėžio reguliavimas (71–73) Keli pelės audiniai: limfoma, kepenų ląstelių karcinoma ir plaučių adenoma (74)
Apc FAP coli sindromo mutacija ( 75 , 76 ) Mutuoja sporadiniais gaubtinės ir tiesiosios žarnos, skrandžio, kasos, skydliaukės ir kiaušidžių vėžio atvejais (77) Ląstelių linijų su aktyvuota v-Ha-ras navikiškumas nuogoms pelėms (78)
Arf Mutuota sergant šeimine melanoma ir nerviniais navikais ( 79 ) Mutuoja esant daugeliui sporadinių vėžio tipų (specifinis ARF sergant ūmine T-ląstelių limfoblastine leukemija ir metastazavusia melanoma) (80–82) Skatina hipermetilaciją sergant burnos plokščiųjų ląstelių karcinoma (83) Žmogaus melanoma (84) pelių DMBA/TPA sukelta papiloma (85)
Atm ** Mutavo sergant ataksija telangiektazija (86) Padidėjęs heterozigotų jautrumas krūties vėžiui (apžvelgta 87 nuorodoje) Mutuoja keliose leukemijos ir limfomos formose (apžvelgta 88 nuorodoje) Retai mutavusi, bet dažnai sumažėjusi reguliacija sergant sporadiniu krūties vėžiu (89–91) Padidėjęs jautrumas subletalinėms jonizuojančiosios spinduliuotės dozėms, nulemtas gyvenimo trukmės ir priešlaikinio papilkėjimo (92)
Atr Seckel sindromo mutacija (peržiūrėta 93 nuorodoje) Mutuotas mikrosatelite nestabiliame endometriumo ir virškinimo trakto vėžyje ( 94 , 95 ) Mlh1 sukelta pelių užkrūčio liaukos limfoma ir žarnyno adenokarcinomos (96)
Beclin1? Sumažėjęs sporadinio krūties vėžio reguliavimas (97, 98) Pelių limfoma, kepenų ląstelių karcinoma ir plaučių adenokarcinoma (99, 100)
Bim? Mantijos ląstelių limfomose dažnai sumažinamas kartu su lydinčiu LOH (101), tačiau šiaip iki šiol buvo paskelbta nedaug mutacijų ekranų. Eμ-Myc sukelta pelių B ląstelių leukemija (102)
Blm Mutated in Blooms sindromas ( 103 ) Mutavo sporadinio mikrosatelito nestabilaus virškinimo trakto vėžio atveju ( 104 , 105 ) Pelių leukemijos viruso sukelta limfoma, Apc min sukelta žarnyno adenoma (106)
BRCA1 ** Mutacija sergant šeiminiu krūties ir kiaušidžių vėžio sindromu ( 107 , 108 ) Retai mutavęs, bet dažnai sumažintas sporadinio krūties (apžvelgta 109 nuorodoje), kiaušidžių (apžvelgta 110 nuorodoje) ir kasos (111) vėžio atveju. Žmogaus limfoblastoidų ( 112 ) ir fibroblastų ( 113 ) linijų radiosensibilizacija ir genomo stabilumo palaikymas
BRCA2 ** Mutacija sergant šeiminiu krūties ir kiaušidžių vėžio sindromu ( 114 , 115 ) Retai mutavęs sporadinio vėžio atveju, analizuojamas iki šiol (116–120) Žmogaus limfoblastoidų ( 112 ) ir fibroblastų ( 113 ) linijų radiosensibilizacija ir genomo stabilumo palaikymas
Bub3 ** ? Dažnas LOH sergant osteosarkoma (121), bet retai mutavęs sporadinio vėžio atveju, išanalizuotas iki šiol (122, 123) Genomo stabilumo palaikymas MEF, bet nėra aptinkamo naviko formavimosi skirtumo in vivo ( 124 )
CBFA2 / AML1 / RUNX1 Mutavo dėl šeiminio trombocitų sutrikimo su polinkiu į ūminę mieloleukemiją ( 30 ) Mutavo sergant sporadine ūmine mieloleukemija ( 125 , 126 ) Žmogaus ūminė mielogeninė leukemija ( 30 )
Cdh1 (E-cad) Mutacija sergant šeiminiu skrandžio vėžiu ( 127 ) Mutuoja sergant sporadine difuzinio tipo skrandžio ir skiltine krūties karcinoma (128) Dažnai sumažėjęs sporadinis epitelio vėžys (apžvelgta 129 nuorodoje) Apc 1638N sukelta pelių adenoma ir adenokarcinoma (130)
Cdkn1a (p21 Waf1 / Cip1 )** Genetiniai variantai, susiję su padidėjusia krūties vėžio ir sarkomos (131), plaučių vėžio (132, 133), odos, galvos ir kaklo vėžio (134, 135) ir gimdos kaklelio vėžio (136) rizika Sumažėjusi raiška sergant kepenų ląstelių karcinoma (137), bet retai mutavusi iki šiol analizuotų vėžio formų atveju (137–141) Pelės epitelio audiniai: kietosios liaukos adenokarcinoma ir granulozės ląstelių kiaušidžių navikas (142)
Cdkn1b (p27 Kip1 ) ? Retai mutuojantis, bet dažnai sumažintas daugelio atsitiktinių vėžio tipų reguliavimas (apžvelgta 46 nuorodoje) Keli pelių epitelio audiniai: žarnyno adenoma ir adenokarcinoma, plaučių adenoma, granulozinių ląstelių kiaušidžių navikas, endometriumo adenoma ir adenokarcinoma, angiosarkoma, antinksčių adenoma, hipofizės adenoma, užkrūčio liaukos limfoma (15)
Cdkn2c (p18 Ink4c ) ? Retai mutavęs, bet sumažėjęs kai kurių atsitiktinių vėžio formų reguliavimas (143–145) Pelių DMN sukelta plaučių adenokarcinoma ir kepenų hemangiosarkoma (146)
Chk1 ** ? Mutuotas mikrosatelite nestabiliame endometriumo ir virškinimo trakto vėžyje ( 95 , 147 ) Genomo stabilumo palaikymas normaliose pelių pieno liaukose ( 148 )
Dmp1? Iki šiol paskelbta nedaug mutacijų ekranų Eμ-Myc sukelta pelių limfoma (149)
Fbxw7 (Cdc4) ? Mutuoja sporadiniuose endometriumo (150), kasos (151) ir gaubtinės ir tiesiosios žarnos (152) vėžio atveju Keli pelės audiniai: plaučių adenokarcinoma, hepatokarcinoma, cholangiokarcinoma, granuliozinių ląstelių navikas, hemangiosarkoma, fibrosarkoma, užkrūčio liaukos limfoma (153)
Fen1? Retai mutavęs sporadiniuose vėžiuose, išanalizuoti iki šiol ( 154 , 155 ) Apc 1638N sukelta pelių adenoma ir adenokarcinoma (156)
H2AX? Retai mutavusi, bet dažnai LOH sergant B ląstelių limfoma (157, 158) Pelių užkrūčio liaukos limfoma, sarkoma ir leukemija (159)
Lig4 Lig4 sindromo mutacija (apžvelgta 93 nuorodoje) Genetiniai variantai, susiję su padidėjusia krūties vėžio (160), daugybinės mielomos (161) ir plaučių vėžio (162) rizika Retai mutavusi sporadinio vėžio atveju, analizuota iki šiol ( 163 ) Pelių minkštųjų audinių sarkomos ink4a/arf −/− pelėms (164)
Lkb1 Mutacija sergant Peutz-Jeghers sindromu (165, 166) Mutuoja sergant sporadiniu plaučių, kasos ir tulžies takų vėžiu, bet retai mutavo sergant kitais atsitiktiniais vėžiniais susirgimais, susijusiais su Peutz-Jeghers sindromu (167–171). Pelių skrandžio adenoma, žarnyno adenoma (172)
Beprotis2 ** ? Dažnai sumažėjęs kepenų ląstelių karcinomos reguliavimas (173), bet retai mutavęs sporadinio vėžio atveju, išanalizuotas iki šiol (123, 174, 175). Genomo stabilumo palaikymas pelių embrioniniuose fibroblastuose ( 176 )
Mlhl ** Paveldimo nepolipozinio coli vėžio (HNPCC) sindromo mutacija (177, 178) Mutavo sergant sporadiniu mikrosatelito nestabiliu gaubtinės ir tiesiosios žarnos vėžiu (179, 180) Skatina hipermetilinimą sergant sporadiniu mikrosatelitu nestabiliu gaubtinės ir tiesiosios žarnos vėžiu (181), skrandžio (182), galvos ir kaklo vėžiu (183), taip pat melanoma (184 ir 185) Mutacijų dažnis in Mgmt -/- fibroblastai, apdoroti alkilinančiomis medžiagomis ( 186 )
Msh2 Mutacija sergant paveldimu nepolipozės coli vėžio (HNPCC) sindromu (187) Mutuotas sporadiniame mikrosatelito nestabiliame gaubtinės ir tiesiosios žarnos vėžyje ( 179 , 180 , 188 ) Keli pelės audiniai: plaučių adenoma, kepenų adenoma, pieno liaukos adenoma, gimdos adenoma, hemangiosarkoma (189) Seserų chromatidų pasikeitimas MNNG apdorotuose MEF (190) ir oksidacinis pažeidimas apšvitintuose MEF (191)
Mus81? Iki šiol paskelbta nedaug mutacijų ekranų Pelės užkrūčio liaukos limfoma, sarkoma, krūties karcinoma, kiaušidžių karcinoma (192)
Nf1 Mutavo sergant 1 tipo neurofibromatoze ( 193 ) Mutuota sergant sporadine gaubtinės žarnos adenokarcinoma (194), mielodisplaziniu sindromu (194) ir astrocitoma (194, 195), taip pat glioblastoma, ependimoma ir primityviais neuroektoderminiais navikais (195) Ne autonominis veikimas putliosiose ląstelėse, supančiose pelių neurofibromą (196)
Nkx3.1 (NKX3A) ? Retai mutavęs, bet dažnai sumažintas sporadinio sėklidžių lytinių ląstelių vėžio ir metastazavusio prostatos vėžio atveju (197–199) Pelės prostatos intraepitelinė neoplazija ( 29 )
Plk4? Iki šiol paskelbta nedaug mutacijų ekranų Pelių kepenų ląstelių karcinoma ir plaučių adenokarcinoma ( 200 )
Prkar1a Mutavo Carney komplekse, šeiminiame daugybinio neoplazijos sindromo (201, 202) Dažnas sumažėjęs reguliavimas ir LOH sporadinio skydliaukės, antinksčių, kiaušidžių ir gaubtinės žarnos vėžio atvejais, tačiau retai mutavo esant sporadiniam vėžiui, analizuotam iki šiol (apžvelgta 203 nuorodoje) Pelių sarkomos ir hepatoceliulinės karcinomos ( 204 ) Žmogaus akių vokų miksoma Carney komplekse ( 205 )
Ptch Nevoidinių bazinių ląstelių karcinomos sindromo mutacija ( 206 , 207 ) Mutavo sergant sporadine medulloblastoma (208–211) Pelės meduloblastoma ( 212 )
Pten Mutuoja keliuose retuose autosominiuose dominuojančiuose hamartomatoziniuose sindromuose, įskaitant Cowden sindromą (213). Mutuoja daugybinių sporadinių vėžio atvejų (peržiūrėta 214 nuorodoje) Pelės TRAMP sukelta prostatos adenokarcinoma (215) ir pelių prostatos intraepitelinė neoplazija (216)
Rb ** Mutuota sergant šeimine retinoblastoma ( 4 ) Mutavo sergant daugybe sporadinių vėžio formų, įskaitant retinoblastomą (217), smulkialąstelinį plaučių (218, 219), osteosarkomą (220) ir latakų kasą (221). Žymeklių priežiūra pelių embrioninėse kamieninėse ląstelėse ( 222 )
Ribosomų baltymų genai (pvz. L35 , L37a , RPS19 ir S8 ) RPS19 , žmogaus ribosomų baltymo genas, yra mutavęs sergant šeimine Diamond-Blackfan anemija, turinčia polinkį į leukemiją (kai kuriose šeimose yra haploinsufficiento įrodymas) (223, 224). Iki šiol paskelbta nedaug mutacijų ekranų Keli zebražuvių audiniai: piktybinis periferinio nervo apvalkalo navikas, limfoma, žarnyno adenokarcinoma, kasos latakų karcinoma (225)
Smad4 / Dpc4 Mutuota sergant šeimine jaunatvine polipoze ( 226 ) Mutuoja sporadiškai gaubtinės žarnos ir kasos vėžio atveju (227–229) Pelės skrandžio adenoma ( 230 )
Tsc2 Mutavo gumbinės sklerozės komplekse ( 231 , 232 ) Mutavo sergant plaučių limfangioleiomiomatoze (233), bet retai mutavo esant kitiems sporadiniams iki šiol analizuojamiems vėžiams (apžvelgta 234 nuorodoje) Pelių sukelta prostatos adenokarcinoma (216)
Trp53 Li-Fraumeni sindromo mutacija (peržiūrėta 235 nuorodoje) Mutuoja daugybinių sporadinių vėžio atvejų (peržiūrėta 236 nuorodoje) Pelių sarkoma, osteosarkoma ir limfoma ( 16 ) Pelių šlapimo pūslės karcinoma ( 237 ) Žmogaus Li-Fraumeni sindromas ( 238 )
Tgfb Mutavo sergant Camurati-Engelmann liga, retu kaulų sutrikimu (239), (peržiūrėta 240 nuorodoje) Retai mutavo sporadiniuose vėžiuose, kurie iki šiol buvo analizuojami, nors daugelis kelio komponentų yra mutuoti (apžvelgta 241 nuorodoje) Pelės dietilnitrozamino (DEN) sukelta kepenų ląstelių adenoma, etilo karbamato sukelta plaučių adenoma (17)

Haploinsufficientas navikams slopinti in vivo (kaip nustatyta pagal pagreitėjusią naviko atsiradimą heterozigotiniame organizme, aiškiai išlaikant naviko laukinio tipo alelį) nėra aiškiai įrodyta.

Daugeliu atvejų auglio slopinančio geno haploinsufficiency įrodyti buvo įmanoma tik griežčiau kontroliuojant pelių modelių genetiką. Viena išimtis yra CBFA2 / AML1 naviko slopintuvas. Daina ir kt . (30) sugebėjo parodyti heterozigotines missense mutacijas CBFA2 segregate su šeiminiu trombocitų sutrikimu, turinčiu polinkį į ūminę mieloleukemiją keturiose skirtingose ​​kilmės dokumentuose. Šių pacientų leukemijos ląstelėse laukinio tipo alelio koduojančioje sekoje somatinių mutacijų nenustatyta ir laukinio tipo alelio ištrynimo įrodymų. Be to, CBFA2 baltymas buvo ekspresuojamas leukemijos ląstelėse ir 100% metafazių iš leukemijos kaulų čiulpų turėjo kariotipinį chromosomos, turinčios CBFA2, žymeklį. Be tokių išimčių, ląstelių kultūros eksperimentai taip pat pasiūlė įrodymų, kad žmonėms yra nepakankamų naviko slopintuvų. Atliekant chromosomų perkėlimo tyrimus su krūties vėžio ląstelių linijomis, buvo nustatyta, kad lokusas trumpojoje 8 chromosomos rankoje, dažnai LOH sergant žmogaus krūties vėžiu, taip pat elgiasi nuosekliai su haplonepakankamu naviko slopinimo mechanizmu (31). Tyrėjai perkėlė 8-ąją chromosomą į krūties vėžio ląstelių linijas, kuriose buvo tik vienas alelis iš visų analizuotų 8p mikrosatelitinių žymenų. Visais atvejais dviejų pilnų 8p chromosomos kopijų buvimas buvo nesuderinamas su ląstelių augimu ir bent vienu atveju donoro 8 chromosoma buvo išsaugota, o 8 recipiento chromosoma buvo prarasta, priešingai nei tikėtasi „dviejų smūgių“ naviko. slopinimas. Tai panašu į islamo pranešimą ir kt . ( 32 ), kuriame 9 išvestinės chromosomos įvedimas buvo susijęs su 10 recipiento chromosomos praradimu, ir užsimenama apie galimą metodą, nors ir daug darbo reikalaujantį, žmogaus navikų slopintuvų haploinsupresorių tyrimui tais atvejais, kai nėra tinkamų duomenų apie paveldėtas mutacijas. .

Kai kuriems genams, kurių trūkumas yra nepakankamas, ekspresijos profiliavimas pasirodė esąs naudingas įrankis šių genų paveiktiems biologiniams keliams išskaidyti (33). Neseniai bandant identifikuoti ankstyvus molekulinius pokyčius, susijusius su dominuojančiu paveldimu polinkiu į inkstų navikus, naudojant ekspresijos profiliavimą (34), nustatyta, kad heterozigotiškumas arba von Hippel-Lindau naviko slopintuvo, arba gumbų sklerozės komplekso genams (įskaitant haploinsucentinį inkstų naviko slopinimo geną) TSC2 ) reikšmingai pakeitė fenotipiškai normalių inkstų epitelio ląstelių ekspresijos profilį genų specifiniu būdu. Ištyrus ląstelių, turinčių vieną mutaciją naviko slopintojo geno, transkripcijos profilius, galima sužinoti apie kitų naviko slopinimo genų haploinsupresorių fenotipą (-us), jei sukursime tinkamas gaires, kaip atskirti dominuojančias neigiamas mutacijas nuo haploinsupresoriaus.

Tačiau žmonėms ir pelėms žinomi haploinsupresoriai, kurių kiekis yra nepakankamas, yra nepakankamas tikrojo skaičiaus įvertinimas, nes sunku patikimai įrodyti, kad abiejų alelių mutacijų nėra, taip pat dėl ​​to, kad trūksta paskelbtų eksperimentų, išsamiai nagrinėjančių hemizigotų fenotipą. Be haploinsufficiento, naviko slopinimo genų mutacijos taip pat gali sukelti dominuojantį neigiamą poveikį ir sustiprinti funkcinį poveikį, kaip aprašyta toliau.


Rebecca&rsquos šeimos medis, kaip parodyta (PageIndex<1>) paveiksle, rodo didelį vėžio dažnį tarp artimų giminaičių. Tačiau ar genai yra vėžio priežastis šioje šeimoje? Tik genetinis tyrimas, kuris yra specifinių genų sekos nustatymas individe, gali atskleisti, ar vėžį sukeliantis genas yra paveldimas šioje šeimoje.

Paveikslas (PageIndex<1>): Rebecca šeimos kilmė, kaip aprašyta šio skyriaus pradžioje, kurioje rodomi vėžiu sergantys (raudona) ir neserga (mėlyna) asmenys. Apskritimai žymi moteris, kvadratai – vyrus.

Rebekos laimei, jos genetinių tyrimų rezultatai rodo, kad ji neturi mutacijų BRCA1 ir BRCA2 genai, kurie dažniausiai padidina žmogaus riziką susirgti vėžiu. Tačiau tai nereiškia, kad ji neturi kitų šių genų mutacijų, kurios gali padidinti jos riziką susirgti vėžiu. BRCA genuose yra daug kitų mutacijų, kurių poveikis vėžio rizikai nėra žinomas, o jų gali būti atrasta dar daug. Svarbu toliau tirti skirtingų žmonių genų, tokių kaip BRCA, variacijas, kad būtų galima geriau įvertinti galimą jų indėlį į ligos vystymąsi. Kaip dabar žinote iš šio skyriaus, daugelis mutacijų yra nekenksmingos, o kitos gali sukelti didelį poveikį sveikatai, priklausomai nuo konkrečios mutacijos ir susijusio geno.

BRCA genų mutacijos ypač gali sukelti vėžį, nes šie genai koduoja naviką slopinančius baltymus, kurie paprastai atkuria pažeistą DNR ir kontroliuoja ląstelių dalijimąsi. Jei šie genai yra mutuojami taip, kad baltymai netinkamai funkcionuoja, gali kauptis kitos mutacijos, o ląstelių dalijimasis nebekontroliuojamas, o tai gali sukelti vėžį.

BRCA1 ir BRCA2 yra atitinkamai 17 ir 13 chromosomose, kurios yra autosomos. Kaip minėjo Rebecca&rsquos genetinis patarėjas, šių genų mutacijos turi dominuojantį paveldėjimo modelį. Dabar, kai žinote autosominių dominuojančių genų paveldėjimo modelį, jei Rebecca ir rsquos močiutė padarė turi vieną mutavusio BRCA geno kopiją, kokia tikimybė, kad Rebecca&rsquos motina taip pat turi šią mutaciją? Kadangi jis yra dominuojantis, norint padidinti vėžio riziką, reikia tik vienos geno kopijos, o kadangi jis yra autosomose, o ne lytinėse chromosomose, tėvo ar palikuonių lytis paveldėjimo modeliui neturi reikšmės. Esant tokiai situacijai, Rebecca&rsquos močiutės ir rsquos kiaušiniai turėjo 50% galimybę turėti BRCA geno mutaciją dėl Mendelio segregacijos įstatymo. Todėl Rebecca&rsquos motina turėjo 50% galimybę paveldėti šį geną. Nors Rebecca neturi dažniausiai pasitaikančių BRCA mutacijų, didinančių vėžio riziką, tai nereiškia, kad jos neturi ir jos mama, nes taip pat būtų tik 50% tikimybė, kad ji perduos Rebekai. Todėl Rebecca&rsquos motina taip pat turėtų apsvarstyti galimybę išsitirti dėl BRCA genų mutacijų. Idealiu atveju, kai įtariama genetinė priežastis, pirmiausia turėtų būti ištirti šeimos vėžiu sergantys asmenys, kad, jei yra paveldima konkreti mutacija, būtų galima ją identifikuoti ir kitus šeimos narius ištirti dėl tos pačios mutacijos.

BRCA1 ir BRCA2 mutacijos dažnai aptinkamos Aškenazių žydų šeimose. Tačiau šie genai nėra susieti chromosomų prasme, nes jie yra skirtingose ​​chromosomose ir todėl yra paveldimi nepriklausomai, pagal Mendelio nepriklausomo asortimento dėsnį. Kodėl tam tikros genų mutacijos yra paplitusios tam tikrose etninėse grupėse? Jei žmonės, priklausantys etninei grupei, yra linkę susilaukti palikuonių, jų genai išliks paplitę grupėje. Tai gali būti nekenksmingų variacijų, pvz., odos, plaukų ar akių spalvos, arba žalingų variantų, pvz., BRCA genų mutacijų, genai. Kitos genetiškai pagrįstos ligos ir sutrikimai kartais dažniau nustatomi tam tikrose etninėse grupėse, pavyzdžiui, cistinė fibrozė europiečių kilmės žmonėms ir pjautuvinė anemija afrikiečių kilmės žmonėms. Daugiau apie tam tikrų genų ir bruožų paplitimą tam tikrose etninėse grupėse ir populiacijose sužinosite skyriuje apie Žmogaus variacija.

Kaip sužinojote šiame skyriuje, genetika nėra vienintelis fenotipą lemiantis veiksnys. Aplinka taip pat gali turėti įtakos daugeliui savybių, tokių kaip suaugusiojo ūgis ir odos spalva. Aplinka taip pat vaidina svarbų vaidmenį vėžio vystymuisi. 90–95 % visų vėžio atvejų nėra nustatytos genetinės priežasties ir dažnai juos sukelia aplinkoje esantys mutagenai, tokie kaip saulės UV spinduliuotė arba toksiškos cheminės medžiagos cigarečių dūmuose. Tačiau tokioms šeimoms kaip Rebecca&rsquos, žinant jų šeimos sveikatos istoriją ir genetinę sudėtį, gali padėti geriau užkirsti kelią ligoms, kurias sukelia jų genetinis paveldėjimas, arba jas gydyti. Jei žmogus žino, kad turi geną, galintį padidinti jo riziką susirgti vėžiu, jis gali keisti gyvenimo būdą, atlikti ankstyvus ir dažnesnius vėžio tyrimus ir netgi pasirinkti profilaktines operacijas, kurios gali padėti sumažinti riziką susirgti vėžiu ir padidinti ilgalaikio išgyvenimo tikimybė, jei vėžys atsirastų. Kai kitą kartą eisite pas gydytoją ir paklausite, ar jūsų šeimos nariai nesirgo vėžiu, geriau suprasite, kodėl ši informacija tokia svarbi jūsų sveikatai.


Koreliacija tarp RASSF1A Metilinimas ir kiti onkogeniniai reiškiniai

Dėl įrodymų susiejimo RASSF1A į Ras signalizacijos kelius, keliuose tyrimuose buvo ieškoma koreliacijos tarp K-Ras mutacijos ir RASSF1A metilinimo būdu. Atvirkštinė koreliacija buvo pastebėta sergant gaubtinės ir tiesiosios žarnos vėžiu (61), kasos adenokarcinomomis (62) ir NSŠPV (63). Tačiau kitoks NSCLC tyrimas (64) nerado jokios koreliacijos tarp metilinimo RASSF1A ir aktyvuojančias K-Ras mutacijas, tačiau asmenys, turintys abu defektus, turėjo prastesnį rezultatą, o tai rodo sinergetinį veikimo mechanizmą. Sinergija taip pat buvo pasiūlyta sergant melanoma (65), kur, be N-Ras, K-Ras ir H-Ras mutacijų atrankos, taip pat buvo analizuojamas B-Raf ir kadangi jokie navikai su B-Raf mutacijomis neturėjo papildomų mutacijų N-Ras. arba K-Ras, dauguma navikų su RASSF1A metilinimas turėjo mutacijų B-Raf arba N-Ras. Tačiau sergant skydliaukės vėžiu buvo pastebėta atvirkštinė situacija, kad jokių navikų, kuriuose RASSF1A buvo metilintas, turėjo mutacijų B-Raf (66). Šie neatitikimai gali atspindėti kitus Ras signalizacijos pokyčius (67).

Gimdos kaklelio vėžys ir galvos bei kaklo plokščialąstelinė karcinoma (HNSCC) yra susiję su žmogaus papilomos viruso (ŽPV) infekcija navikinėse ląstelėse. ŽPV gali daugintis tik besidalijančiose ląstelėse, todėl jis koduoja virusinius baltymus (E6 ir E7), kad pakirstų ląstelių ciklo kontrolę, atitinkamai inaktyvuodamas p53 ir Rb. 16 ir 18 tipų ŽPV DNR yra ypač susijusi su transformacija. ŽPV DNR niekada nebuvo rasta gimdos kaklelio karcinomose su RASSF1A metilinimas (68), o tai rodo, kad viruso baltymų buvimas panaikino bet kokį reikalavimą RASSF1A inaktyvacija, įtraukianti juos abu į tą patį kelią. Panaši koreliacija pastebėta ir tiriant HNSCC (69). Tačiau kiti tyrimai (9, 70) nerado ryšio tarp RASSF1A metilinimas ir virusinės DNR nebuvimas.

Visur paplitęs žmogaus herpeso virusas EBV gali paversti B ląsteles į nuolat augančias limfoblastoidines ląstelių linijas in vitro. Virusinė DNR ir nuorašai yra susiję su daugybe neoplazijų, įskaitant nosiaryklės karcinomą, endeminę Burkitt limfomą, Hodžkino ligą ir skrandžio karcinomas. kadangi RASSF1A metilinimas aptinkamas daugumoje nosiaryklės karcinomų (67 proc.), sunku nustatyti koreliaciją dėl naviko ląstelių virusinės infekcijos, nes beveik visi atvejai yra teigiami EBV. Tačiau, palyginti su kitais galvos ir kaklo navikais, RASSF1A metilinimas vyksta daug dažniau sergant nosiaryklės karcinoma. Palyginimas tarp virusinės infekcijos ir RASSF1A metilinimas buvo įmanomas sergant Hodžkino limfoma ir skrandžio karcinoma, nes tik dalis jų yra susijusi su EBV. Iš 52 Hodžkino limfomų kohortos 27 buvo EBV teigiami, o 34 - RASSF1A metilinimas (18). Tačiau RASSF1A metilinimas nesusijęs su EBV infekcija. Sergant skrandžio karcinoma, nustatyta koreliacija tarp EBV infekcijos ir RASSF1A metilinimo (71). RASSF1A buvo metilintas 14 iš 21 (66,7 %) EBV teigiamų skrandžio karcinomų, tuo tarpu tik 2 iš 56 (3, 6 %) EBV neigiamų skrandžio karcinomų buvo metilinti. Šiame tyrime su EBV susijęs kelių kitų GTG metilinimas, įskaitant PTEN, 16 p, THBS1, ir MINT12 taip pat buvo ištirtas ir apskritai CpG salos metilinimo dažnis buvo didesnis sergant virusu užkrėstomis skrandžio karcinomomis. Viruso genomo metilinimas įvyksta netrukus po užsikrėtimo, kad būtų apribota viruso transkriptų ekspresija, leidžianti EBV išvengti imuninės priežiūros. Šie duomenys rodo, kad EBV yra susijęs su skrandžio karcinomos metilatoriaus fenotipu, o virusas gali būti susijęs su įprastų DNR metilinimo mechanizmų sutrikimu. Atsitiktinai rastas kitas skrandžio karcinomų tyrimas RASSF1A metilinimas buvo susijęs su prastai diferencijuotomis skrandžio karcinomomis (72), kuri taip pat yra labiausiai su EBV susijęs histologinis pogrupis.

Piktybinė mezoteliomą sukelia mezotelio ląstelės, dengiančios pilvaplėvę, pleurą ir perikardą. Apie 50% piktybinių mezoteliomų yra susiję su SV40. Tyrime, kuriame lyginamas 66 piktybinių mezoteliomų ir 40 plaučių adenokarcinomų profilių metilinimas, Toyooka ir kt. parodė metilinimą RARβ, CDH13, MGMT, 16 p, ir APC buvo žymiai didesnis sergant plaučių adenokarcinomomis (22-52%) nei piktybinėmis mezoteliomomis (0-10% nuorod. 73). Tačiau metilinimas RASSF1A reikšmingai nesiskyrė tarp dviejų navikų tipų, 32% piktybinės mezoteliomos ir 43% plaučių adenokarcinomos. SV40 žymė buvo 48% (32 iš 66) piktybinių mezoteliomų ir buvo įrodyta, kad ji koreliuoja su didesniu metilinimo indeksu nei SV40 neigiamų piktybinių mezoteliomų atveju. Be to, RASSF1A metilinimas buvo žymiai didesnis SV40 teigiamų piktybinių mezoteliomų atvejais (48 %) nei SV40 neigiamų atvejų (16 %). Autoriai ištyrė ryšį tarp nenormalaus metilinimo ir SV40, užkrėsdami mezotelio ląsteles virusu ir ištyrę promotoriaus metilinimą ankstyvose (8-30) ir vėlyvose (15-86) pasėjusiose ląstelėse. Jokio promotoriaus metilinimo nebuvo aptikta anksti pasėjusiose ląstelėse, bet dviejuose iš šešių vėlyvųjų ląstelių židinių. RASSF1A promotoriaus metilinimas buvo aptiktas kartu su sumažintu reguliavimu RASSF1A. Šios ląstelės taip pat parodė morfologinius transformacijos požymius (74). Ekspresija buvo atkurta naudojant 5-aza-2′ deoksicitidiną, bet ne histono deacetilazės inhibitorių trichostatiną A, o tai rodo, kad SV40 sukelia metilinimą, o ne histono deacetilinimą. RASSF1A propaguotojas.


Genetinės mutacijos ir epigenetinės modifikacijos: užkirsti kelią vėžiui ir informuoti apie tikslią mediciną

Vėžio gydymas patiria reikšmingą revoliuciją nuo „visiems tinkančių“ citotoksinių terapijų iki pritaikytų metodų, kurie tiksliai nukreipti į molekulinius pokyčius. Tikslios vaistų kūrimo ir pacientų stratifikacijos strategijos, pagrįstos navikų molekulinėmis savybėmis, yra kitas logiškas žingsnis ilgoje vėžio gydymo metodų istorijoje. Šioje apžvalgoje aptariame vėžio gydymo istoriją nuo bendrinių natūralių ekstraktų ir radikalių chirurginių procedūrų iki konkrečios vietos ir kombinatorinio gydymo režimų, kurie palaipsniui pagerino pacientų rezultatus. Aptariame susijusį genetikos ir epigenetikos indėlį į vėžio progresavimą ir atsaką į tikslinę terapiją bei nustatome tikslios medicinos sėkmės iššūkius ir galimybes. Nustatyti pacientus, kuriems bus naudinga tikslinė terapija, yra sudėtingiau nei paprasčiausiai nustatyti pacientus, kurių navikai turi tikslinę aberaciją, o dėl intratumorinio heterogeniškumo sunku nustatyti, ar tiksli terapija gydymo metu yra sėkminga. Šis nevienalytiškumas leidžia augliams išsivystyti atsparumui tiksliniams požiūriams, todėl racionalus terapinių agentų derinys apribos įgyto atsparumo grėsmę gydymo sėkmei. Įtraukus piktybinės transformacijos, kurią moduliuoja genetinės ir epigenetinės sąveikos tinklai, vaizdą, molekulinės strategijos leis tikslią mediciną veiksmingam visų vėžio potipių gydymui.

1. Tiksliosios medicinos įtraukimas į kontekstą

Visas vėžio gydymas yra orientuotas į pacientą ir pagrįstai gali būti laikomas individualizuotu arba tiksliuoju gydymu. Šio dokumento kontekste mes vartojome „tikslią mediciną“, nurodydami specifinį molekulinių anomalijų taikymą, kad būtų galima stratifikuoti pacientus, kad padidėtų atsakas į konkrečius vaistus (1 langelis). „Personalizuota medicina“ yra tiksliosios medicinos skėtyje, tačiau tai yra labiausiai individualizuotos terapijos, pritaikytos kiekvienam pacientui. Tikslioji medicina apima vaistus, kurie gali būti naudojami „išparduoti“ (pvz., tamoksifenas, skirtas estrogenų receptorių (ER) teigiamiems krūties navikams gydyti), o individualizuotam gydymui gali prireikti specifinės inžinerijos kiekvienam pacientui (pvz., chimerinio antigeno receptorių CAR) T-ląstelės ir į naviką infiltruojančių limfocitų perkėlimas). Tiek individualizuotam, tiek tiksliam gydymui reikalinga išsami paciento naviko analizė, tačiau tikslios terapijos, paskirstančios kūrimo, licencijavimo ir testavimo naštą pacientams, yra ekonomiškesnės, todėl gali būti prieinamos didesnei pacientų daliai [1 , 2]. Didėjant didelio našumo „omikos“ technologijų ir bioinformatinės analizės prieinamumui, tiksli terapija tampa prieinama vis daugiau pacientų. Šiame darbe pateiksime istorinį kontekstą tiksliam vėžio gydymui, apžvelgsime susijusius genetinius ir epigenetinius indėlius į tikslios medicinos strategijas ir aptarsime tikslios medicinos sėkmės vėžio terapijoje iššūkius ir galimybes.

2. Tiksliosios medicinos istorinė raida

Vėžio terapija istoriškai taikė „viskas, išskyrus virtuvės kriauklę“ metodą. Ir Hipokratas, ir Galenas, senovės gydytojai, sukūrę dabartinę medicinos praktiką, vėžį laikė nepagydoma liga [3]. Vėžio gydymas iš esmės išsivystė nuo tada, kai buvo praktikuojama medicina, o tai rodo pacientų sveikatos ir išgyvenamumo pagerėjimas.

Vėžiu sergantiems pacientams gydyti iš pradžių buvo naudojami vaistai, tokie kaip avinžirnių, avinžirnių, dilgėlių ir kitų augalų ekstraktai [3]. Chirurginiai vėžio gydymo metodai buvo aprašyti jau pirmajame mūsų eros amžiuje, reikalaujant pašalinti pažeistą dalį, kartu su dabar gana pasenusia kai kurių asmenų kraujo leidimo praktika [3]. Vėžio terapija XIX amžiuje ir didžiąją XX amžiaus dalį iš esmės nenukrypo nuo šios senovinės medicinos praktikos, tačiau patobulintas chirurginis tikslumas, skausmo valdymas ir sanitarijos sąlygos nuolat gerino pacientų rezultatus.

Chirurginis pašalinimas, siekiant pašalinti navikus, tebėra vėžio gydymo pagrindas, o vaistų, natūralių ekstraktų, cheminių medžiagų ir spinduliuotės deriniai buvo įvesti siekiant apriboti greitą ląstelių augimą, susijusį su likusiomis naviko ląstelėmis. Vėžio terapija patyrė pirmąją didelę revoliuciją XX amžiaus viduryje, kai buvo naudojamos azoto garstyčios, pastebėjus, kad garstyčių dujų poveikis koreliuoja su limfocitų išsekimu kareivių kraujyje Antrojo pasaulinio karo metu [4–6]. Tai paskatino hipotezę, kad azoto garstyčių junginiai gali būti naudojami baltųjų kraujo kūnelių augimui slopinti, o tai naudinga gydant leukemijas ir limfomas. Tuo pačiu metu Sidney Farber įrodė, kad folio rūgštis gali pagreitinti leukemijos ląstelių augimą. Dėl to buvo atlikti klinikiniai metotreksato, folio rūgšties antagonisto, leukemijos gydymo tyrimai [6, 7]. Trečiasis projektas atskleidė antibiotiko aktinomicino D, kuris buvo naudojamas šeštajame ir septintajame dešimtmečiuose vaikų navikams gydyti, priešnavikinį poveikį [6, 8]. Galiausiai, pagrindinis terapinio chirurgijos ir chemoterapijos režimo papildymas, kurio Hipokratas ir Galenas tikriausiai negalėjo įsivaizduoti, yra jonizuojančiosios spinduliuotės naudojimas XX amžiuje. Pastebėtas dar 1903 m., Charlesas Leonardas rašė, kad spindulinė terapija, iš pradžių taikyta kaip paliatyvioji priežiūra, išgydė ir atkūrė pacientų sveikatą [9]. Nors šie metodai pagerino pacientų, sergančių vėžiu, išgyvenamumą, jie išliko palyginti nerafinuoti, o ūmių komplikacijų rizika buvo didelė.

Iki XX amžiaus dešimtmečio pabaigos vėžio chemoterapijoje buvo naudojami generiniai citotoksiniai vaistai, kuriais buvo siekiama slopinti greitą ląstelių dauginimąsi – būdingą piktybinių ląstelių požymį. Vėžio chemoterapijos arsenalas išsiplėtė ir apėmė 5-fluorouracilą, vinka alkaloidus, platinos agentus ir taksanus [10–13], kurie, nors ir veiksmingi kontroliuojant piktybinį proliferaciją slopindami ląstelių dalijimąsi, yra mažai tikslūs specifiniams navikams ir dažnai pasižymi dideliu rizikos šalutinio poveikio profiliai.

Vėžys vis dažniau laikomas ligų rinkiniu, kurio ypatybės kyla iš jų audinių ir ląstelių tipų bei juos skatinančių mutacijų. Chemoterapija, radioterapija ir chirurginis gydymas dabar parenkami ir derinami atsižvelgiant į jų veiksmingumą tam tikroms vėžio formoms ir histologijoms, o kiekvieno paciento gydymo procesas priklauso nuo konkrečios ligos. Šios strategijos, skirtos stratifikuoti vėžio gydymą pagal kilmės audinį ir specifinį transformuotų ląstelių tipą, buvo pirmasis patobulinimas siekiant labiau į pacientą orientuoto vėžio gydymo (1 pav.).

Kitas vėžio terapijos etapas, tiksli terapija, padidins gebėjimą nukreipti specifines molekulines ypatybes, kad būtų galima gydyti vėžį, remiantis jo savybėmis, o ne tik jo kilmės audiniu. Išsamesnis naviko biologijos supratimas atskleidė, kad kiekvienas atskiras navikas kaupia unikalų pakitimų rinkinį, leidžiantį jam išvengti įprastų kontrolinių taškų, palaikančių homeostazę. Nepaisant to, atskiri vėžio atvejai turi savybių, leidžiančių nekontroliuojamą augimą, pvz., Augimo faktoriaus ar receptorių perdėta ekspresija ir apoptozės bei ląstelių ciklo kontrolės mechanizmų praradimas, kurie pasireiškia kaip molekulinės savybės, į kurias galima nukreipti didėjantį vaistų arsenalą. Vėžio aprašymo patikslinimas iki unikalaus pakeitimų, apibūdinančių kiekvieną atskirą naviką, rinkinio leis naudoti tikslią mediciną ir informuos apie geriausią gydymo metodą, kad būtų galima nukreipti kiekvieną naviką ir apriboti neveiksmingų gydymo būdų taikymą (1 pav.).

Molekulinis supratimas apie audinių vystymąsi, hormonus ir būtinus signalus ląstelių proliferacijai paskatino tamoksifeno, estrogenų receptorių (ER) antagonisto, iš pradžių sukurto siekiant rasti naujų kontraceptikų ir cholesterolio kiekį mažinančių vaistų, vystymąsi (1 lentelė) [14, 15] ]. Tamoksifenas buvo licencijuotas naudoti JAV pacientams, sergantiems pažengusiu krūties vėžiu 1972 m., o dabartinė jo sėkmė gydant pacientes, sergančias ER teigiamu krūties vėžiu, buvo vadinama tikslios medicinos požiūrio į vėžio gydymą katalizatoriumi [16]. Dešimtajame dešimtmetyje ir 2000-ųjų pradžioje buvo sėkmingi kiti gydymo būdai, skirti molekuliniams taikiniams, pvz., imatinibas nuo BCR-ABL translokacija, pastebėta sergant lėtine mieloleukemija, rituksimabas (anti-CD20) kaip B ląstelių limfomų gydymas ir retinoinė rūgštis PML-RAR sintezė ūminė promielocitinė leukemija (1 lentelė) [17–21]. Tą patį dešimtmetį trastuzumabas buvo patvirtintas krūties vėžiu sergančių pacientų, kurių amplifikacija, gydymui ERBB2 (žmogaus epidermio augimo faktoriaus receptorius 2, taip pat žinomas kaip HER2/neu) [22]. Visai neseniai kontrolinius taškus slopinantys antikūnai, anti-PD1 (nivolumabas) ir anti-CTLA-4 (ipilimumabas) (1 lentelė), sistemingai taikomi klinikiniuose tam tikrų vėžio tipų tyrimuose [23–25]. Nors šios terapijos iliustruoja vėžio gydymo pradžią, skirtą konkrečioms vėžio priklausomybėms ar silpnybėms, jos vis tiek daugiausia priklauso nuo konkrečios vietos gydymo metodo (2 pav.).

Geno simbolisGeno vardasPakeitimo poveikisPagrindinės asociacijos su specifiniais navikų tipaisNurodyta terapija
Protoonkogenai ir onkogenai
BCR-ABLLūžio taško klasterio regionas, Abelsono pelių leukemijos viruso onkogeno homologo sulietas baltymasPažeidžia DNR atstatymo tikslumą, panaikina proliferacijos reguliavimą, pablogina apoptozę ir diferenciacijąLėtinė mieloleukemijaImatinibas, dasatinibas,
HRAS/KRASHarvey / Kristen žiurkės sarkomos viruso onkogeno homologasKonstruktyviai aktyvuoja MEK/ERK progrowth signalizacijąNesmulkialąstelinis plaučių vėžysSalirasibas
BRAFv-Raf pelių sarkomos viruso onkogeno homologas BKonstruktyviai aktyvuoja MEK/ERK progrowth signalizacijąMelanomos, V600E arba V600K mutacijosVemurafenibas, dabrafenibas
BCL2B ląstelių limfoma/leukemija-2Sutrinka apoptozėLeukemija, limfoma, melanomaVenetoklaksas
Naviko slopinimo genai
BRCA1/2Krūties vėžys 1/2Sutrikęs DNR atstatymasKrūties ir kiaušidžių vėžysPARP inhibitorius (per sintetinį mirtingumą)
Epigenetiškai modifikuojantys genai
IDH1/2

Svarbu pripažinti, kad vėžio gydymą istoriškai ribojo mūsų gebėjimas rinkti ir analizuoti informaciją apie naviko ontogeniškumą, vairuotojų mutacijas ir fenotipą. Tačiau informacija, kurią dabar galime gauti iš bet kurio paciento ir bet kurio auglio, veda į duomenimis pagrįstą onkologijos transformaciją, kuri įkvepia tiksliam gydymui. Ištekliai, skirti tvarkyti ir analizuoti duomenis, surinktus atliekant viso naviko genominę ir transkriptominę analizę, pvz., Vėžio genomo atlasas (TCGA) ir Tarptautinis vėžio genomo konsorciumas (ICGC), tyrėjams suteikia didžiulius vėžio duomenų rinkinius, kad galėtų patikrinti hipotezes ir tirti genominius variantus. pirminiai duomenų rinkiniai. Tikslią mediciną riboja mūsų supratimas apie vėžį ir pagrindinių naviko ypatybių gydymui skirtų medžiagų prieinamumas. „Omikos“ metodų ir naujų modelių taikymas, siekiant suprasti sudėtingą vėžio grandinę, užgrobtą iš įprastų korinio ryšio tinklų ir kelių, paspartins pacientų priežiūros tobulinimą.

3. Tikslioji terapija pagrįsta genetika ir epigenetika

Du pagrindiniai veiksniai, lemiantys ląstelių elgesį, yra genetika, paveldimų nukleotidų sekų tyrimas ir epigenetika, kuri tradiciškai buvo apibrėžiama kaip paveldimų genų ekspresijos pokyčių, nesusijusių su nukleotidų sekų pasikeitimais, tyrimas. Svarbu pažymėti, kad ne visos epigenetinės modifikacijos yra paveldimos [26–28], todėl šios apžvalgos kontekste terminas vartojamas plačiau. Kanoninės epigenetinės modifikacijos gali pakeisti tam tikrų genų transkripciją ir transliaciją, kad padidėtų arba sumažėtų jų funkcinis lygis [29]. Bene geriausiai ištirta modifikacija, DNR metilinimas reiškia metilo grupių pridėjimą prie CpG dinukleotidų DNR [30, 31] ir dažniausiai vyksta genomo regionuose, kuriuose yra didelis CpG dinukleotidų tankis (CpG salelės) [32]. Nors DNR metilinimas kanoniškai siejamas su genų nutildymu, DNR metilinimo pasekmės labai skiriasi priklausomai nuo genomo konteksto [33]. Kitos epigenetinės modifikacijos, prisidedančios prie genų ekspresijos transkripcijos ir transliacijos kontrolės, apima histono baltymų posttransliacinį modifikavimą (acetilinimo, metilinimo, fosforilinimo, ubikvitiliavimo arba sumoilinimo būdu) [34–36] ir nekoduojančių RNR sąveiką su baltymais ar kitomis nukleino rūgštimis. [37]. Šie epigenetiniai procesai paprastai veikia, kad sudarytų pagrindą vystymuisi ir diferenciacijai, prisidedant prie audinių specifinės genų ekspresijos, X-chromosomos inaktyvavimo ir genomo įspaudimo [38–40]. Epigenetika taip pat prisideda prie senėjimo ir veikia kaip atsakas į aplinkos veiksnius [41, 42].

Tobulėjant supratimui apie vėžį ir jo gydymui, vėžiu sergantiems pacientams terapijos parinkimas taip pat turi būti grindžiamas molekuliniu vėžio supratimu (2 pav.). Tai apima ir genetinius, ir epigenetinius veiksnius, nes jie bendradarbiauja, kad suteiktų vėžiui reikiamų skiriamųjų savybių [43, 44].

3.1. Vėžį skatinančios mutacijos ir epigenetinės modifikacijos

Norint pradėti ir vystytis vėžiui, reikalingi pagrindiniai pokyčiai, įskaitant mutacijas. Apskritai, šios genetinės aberacijos įgalina augimą skatinančius signalus vėžio genams ir (arba) destabilizuoja genomą, kad būtų galima tęsti piktybinę transformaciją, palengvinant padidėjusį mutacijų dažnį [45–48]. Būtent šios mutacijos skatina vėžį ir taip pat informuoja apie vėžio tikslios medicinos strategijas (1 lentelė).

3.1.1. Netinkamas onkogenų aktyvinimas

Onkogenus dažniausiai netinkamai suaktyvina mutacijos, tačiau epigenetinių ženklų pašalinimas taip pat gali būti atsakingas už onkogenų aktyvavimą, o mutacijų greitis skirtingų audinių vėžio atveju labai skiriasi [49]. Epigenetinių ženklų pašalinimas taip pat gali būti atsakingas už onkogenų aktyvavimą. Protoonkogenų hipometilinimas HRAS (Harvey žiurkės sarkomos viruso onkogeno homologas) ir KRAS (Kirsten žiurkės sarkomos viruso onkogeno homologas) buvo pastebėtas pirminiuose žmogaus navikuose [50]. Nors ir trūksta mutacijų, kurios iš esmės suaktyvintų RAS signalizaciją, padidėjusi šių GTPazių ekspresija gali prisidėti prie piktybinio fenotipo, stebimo sergant vėžiu [51], ir gali būti tikslios medicinos metodų taikiniai (1 lentelė). Nors ankstesni skaičiavimai rodo, kad 90% somatiškai mutavusių onkogenų veikė dominuojančiai [52], kai kurie gali veikti recesyviai (ty FOXP1 ir MLLT4) [53]. Kandidatų onkogenų atsiradimas iš išsamių duomenų, turimų per TCGA ir ICGC duomenų bazes, greičiausiai suteiks daugiau informacijos apie santykinį somatinių mutacijų dažnį onkogenuose ir naviko slopinimo genuose [54, 55].

3.1.2. Auglio slopinimo ir genomo stabilumo genų genetinė inaktyvacija arba epigenetinis nutildymas

Daugeliui naviką slopinančių genų reikia abiejų alelių mutacijų [52], todėl inaktyvuojamas genų produktas, kuris kontroliuoja per didelį ląstelių augimą sveikomis homeostatinėmis sąlygomis. Paprastai dėl ląstelių vientisumo praradimo, po kurio vyksta nuolatinis ir nekontroliuojamas ląstelių dalijimasis, reikia inaktyvuoti apsauginius ląstelių mechanizmus (ty naviko slopinimo genus) ir mutacijas, kurios palengvina naviko augimą tiesiogiai (ty aktyvinant onkogeną) arba netiesiogiai (ty sustiprinant). jautrumas augimo faktoriams). „Dviejų smūgių“ hipotezė, kurią pirmą kartą aprašė Knudsonas aštuntajame dešimtmetyje [56, 57], teigia, kad vėžiui vystytis reikalingos bent dvi auglio slopinimo geno mutacijos: pirma, heterozigotiškumo praradimas, o vėliau – mutacija. jo suporuotas alelis, dėl kurio sutrinka ląstelių dalijimosi slopinimas ir vėžio vystymasis. Nors klasikinis naviko slopintuvo apibrėžimas apima trumpinamųjų mutacijų buvimą [58–60], yra įrodymų, kad naviko slopinimo genai yra inaktyvuojami dėl netipinių mechanizmų, tokių kaip haploinsufficientas arba funkcijos padidėjimo izoformos [58]. Klasikiniai naviko slopinimo genai, paprastai apibrėžiami inaktyvuojant mutacija, taip pat gali būti nutildyti epigenetiniais mechanizmais [61–64]. Mes ir kiti teigėme, kad šie „nutildyti“ naviko slopintuvai gali būti puikūs vaistų taikiniai, nes jie gali būti pakartotinai suaktyvinti atšaukus šias slopinimo modifikacijas [65, 66] arba nurodyti kelius ir tolesnius pokyčius, į kuriuos gali būti nukreipta tiksli terapija.

Genominis nestabilumas yra pagrindinė kancerogenezės ir nuolatinio naviko progresavimo ypatybė. TP53 vaidina esminį vaidmenį šiame procese kaip „genomo sergėtojas“ [67] ir yra susijęs su beveik visų tipų žmogaus navikais įvairiais tempais [68]. Apskritai, TP53 ir kitų genų produktų, atsakingų už ląstelių DNR vientisumo apsaugą, inaktyvavimas palaiko labiau kintantį fenotipą, užkertant kelią DNR atstatymui arba leisdamas mutageninėms molekulėms nekontroliuojamai pažeisti DNR [44]. Epigenetinės aberacijos taip pat gali turėti įtakos vėžio ląstelių mutacijos greičiui. Pavyzdžiui, hipometilinimas šalia guanino kvadrupleksų padidina DNR lūžimo greitį ir homologinės rekombinacijos aktyvavimą bei gali veikti kaip mutageninis faktorius [69]. Taip pat yra įrodymų, kad netoli CpG salų mutacijų greitis skiriasi ir kad histono metilinimo lygis gali numatyti somatinių mutacijų lokusus [70–72]. Be to, normalus epigenetinis reguliavimas gali turėti įtakos mutacijų dažniui, nes buvo įrodyta, kad labai išreikšti genai turi didesnį mutacijų dažnį [73].

Epigenetinių modifikatorių poveikis genomo stabilumui dažniausiai stebimas sergant hematologiniais piktybiniais navikais. Sergant ūmine mieloidine leukemija (AML) ir mielodisplazija, izocitrato dehidrogenazės (IDH) 1 arba 2 mutacijos sutrikdo ląstelių diferenciaciją ir skatina leukemogenezę [74]. Mutacijos katalizinėje srityje EZH2 aptinkamos difuzinėse didelių B ląstelių ir folikulinėse limfomose ir sutrikdo H3 K27 metilinimą, skatindamos ląstelių išgyvenimą (1 lentelė) [75, 76]. Panašiai, dažnas mišrios linijos leukemijos translokacijos tikslas yra į DOT1 panašus histonas H3 K79 metiltransferazė. (DOT1L). DOT1L slopinimas padidina leukemijos ląstelių diferenciaciją ir apoptozę, o tai dar kartą rodo, kad leukeminių ląstelių išgyvenimui reikalinga nenormali epigenetinė programa [77]. Kartu šie įrodymai rodo, kad genomo ir epigenomo sąveika vyksta piktybinės transformacijos metu.

Vėžiui paprastai būdinga genomo masto DNR hipometilacija ir promotoriaus hipermetilinimas [78–82], tačiau epigenetikos požiūris ir aiškinimas tiksliosios medicinos kontekste turėtų būti išplėsti ne tik į genus. Epigenomas nėra tik mutacijų pakaitalas ir gali turėti distalinį poveikį, kuris svyruoja už kanoninio promotoriaus metilinimo [72, 83]. Įrodymai, rodantys, kad distalinių reguliavimo elementų metilinimas yra susijęs su genų ekspresija, kelia sudėtingą klausimą, į kurį dabar pradeda atsakyti genomo masto tyrimai.Hipometilinimas, stebimas sergant vėžiu, dažnai vyksta palydovinėje DNR, pagrindinėje funkcinių centromerų sudedamojoje dalyje, ir kitose pasikartojančiose sekose, kurios neveikia kaip transkripcijos vienetai. Hipometilinimas šiose DNR sekose greičiausiai neturi a cis poveikis genų ekspresijai, nebent jis plinta į gretimą chromatiną [78]. Tačiau genų ekspresiją gali paveikti branduolio padėtis, o hipometilacija šalia centromerų gali turėti įtakos genų ekspresijai trans. Centromerinis heterochromatinas veikia kaip transkripcijos kontrolinių baltymų, kuriuos gali sutrikdyti hipometilinimas, rezervuaras [78, 84, 85]. Šis hipometilinimas taip pat gali sutrikdyti heterochromatino ir euchromatino sąveiką [86–88]. Kalbant apie genų specifinį hipermetilinimą, keli tyrimai parodė, kad dauguma hipermetilintų naviko slopintuvų genų susijusių CpG salų nėra genų promotoriuose. Taigi šis hipermetilinimas greičiausiai yra kito su vėžiu susijusio mechanizmo pasekmė, o ne tiesioginė naviko vystymosi ar progresavimo priežastis [89–91]. Tam būtina, kad vėžio epigenetika išeitų iš į genus orientuoto dėmesio ir įveiktų didesnius iššūkius, susijusius su pasaulinių epigenetinių aberacijų padarinių nustatymu.

4. Tikslus požiūris į genetinius ir epigenetinius vėžio įvykius

4.1. Nukreipimas į genominius vėžio progresavimo veiksnius

Mūsų žinios apie vairuotojų mutacijas ir priklausomybę nuo onkogenų daugelio vėžio rūšių atveju paskatino vėžio gydymo metodus, nukreiptus į molekulinius pokyčius (1 lentelė). Nors daugelis vėžio rūšių turi daug genetinių anomalijų, vairuotojų mutacijos leidžia išaugti vėžinėms populiacijoms. Pokyčiai, skatinantys vėžio augimą, atspindi "onkogeno priklausomybę" arba kai kurių vėžio priklausomybę nuo vieno geno ar kelių genų, siekiant išlaikyti piktybinį fenotipą. Priklausomybė nuo konkretaus pokyčio, pvz., augimo faktoriaus receptorių per didelės ekspresijos, gali reikšti „Achilo kulną“, specifinį ir atpažįstamą silpnumą, kurį gali išnaudoti vėžio terapija. Iš tiesų, folio receptorių teigiamų navikų priklausomybė nuo folio rūgšties ir anti-HER2 antikūno trastuzumabo sėkmė buvo apibūdinti kaip „įtikinami ir kliniškai svarbūs įrodymai“ priklausomybės nuo onkogenų teorijai [92, 93].

Kai kurių navikų, turinčių didelę mutacijų apkrovą, atveju gali būti sudėtinga nustatyti konkrečias mutacijas kaip vairuotojo ar keleivio mutacijas. Vairuotojo mutacijos yra tos, kurios leidžia toliau vystytis ir vystytis naviko keleivių mutacijų, atsirandančių dėl genomo nestabilumo ir kitų su naviku susijusių veiksnių, tačiau yra būtinos naviko progresavimui [94]. Pavyzdžiui, DNR polimerazė reguliariai mikčioja trumpais tandeminiais mono-, di-, tri- arba tetranukleotidų pasikartojimais [95]. Kai DNR atstatymas yra sugedęs dėl pagrindinių DNR stabilumo genų (pvz., DNR) nutildymo arba taškinių mutacijų MLH1, MSH2, MSH6, arba PMS2), šių klaidų negalima ištaisyti. Dėl to atsiranda mikrosatelito nestabilumas ir gali atsirasti hipermutuojantis fenotipas [96].

Molekulinių vaistų bumas davė įspūdingą tikslinių vaistų sąrašą klinikinių tyrimų metu, o dar daug kitų yra kuriami. Visai neseniai atsirado vaistų, skirtų vėžiui su specifiniais pakitimais gydyti, naudojimas ne pagal etiketę. Pavyzdžiui, paciento, sergančio metastazavusiu gaubtinės ir tiesiosios žarnos vėžiu, integracinė genomo analizė atskleidė didelę aktyvuojančio baltymo-1 (AP1) komplekso komponentų ekspresiją (1 lentelė). Gydymas angiotenzino II receptorių antagonistu irbesartanu sukėlė visišką radiologinį atsaką [97]. Tai gali būti veiksmingas gydymas nuo kitų navikų, turinčių panašų AP1 komplekso reguliavimą, tačiau mažai tikėtina, kad jis bus veiksmingas jokiems kitiems pokyčiams. Svarbu pripažinti, kad komponentai AP1 Šiam pacientui nebuvo mutavusios ir genų ekspresijos analizės metu buvo atskleistos kaip pašalinės. Taigi, į molekulinės paskirties vaistų repertuarą gali reikėti įtraukti visus įmanomus genų produktus, o ne tik tuos, kurie dažnai mutuoja, arba pasikliauti metodais, siekiant nustatyti mutacijas kiekvienam pacientui a priori. Ši koncepcija paskatino kurti „krepšelio bandymus“, pagrįstus hipoteze, kad individualūs paciento naviko pokyčiai lems atsaką į gydymą, nepriklausomai nuo histologijos [98].

Vienas iš iššūkių, susijusių su priklausomybės nuo onkogenų samprata ir molekulinės tikslinės terapijos prielaida, pastebėtas net krepšelio bandymuose, yra maksimalus atsako dažnis, maždaug 50–60 % [22, 92]. Tai rodo, kad specifinio anomalijos buvimas nėra visiškai atsakingas už vėžio fenotipą ir palaiko evoliucinį vėžio vystymosi modelį, kai pradinė transformacija ir vėlesnis naviko augimas skatina tolesnes mutacijas ir epigenetinius pokyčius. Integruota genetikos ir epigenetikos analizė gali turėti užuominų apie šią trūkstamą grandį.

4.2. Epigenetinės terapijos ir tiksli epigenetinė medicina

Dėl tų pačių savybių, dėl kurių epigenetinį nevienalytiškumą sunku išmatuoti ir modeliuoti, epigenetinės modifikacijos tampa puikiais vaistų taikiniais, o dėl epigenetinių modifikacijų grįžtamumo jie tampa patraukliais tikslais [99]. Priklausomybės nuo onkogeno sampratą galima atspindėti keliuose vėžio epigenetinio kraštovaizdžio aprašymuose [100–102]. Vėžys gali tapti priklausomas nuo kelių svarbių naviko slopinimo genų nutildymo. Pavyzdžiui, epigenetinis neigiamo Wnt kelio reguliatoriaus nutildymas lemia konstitucinį Wnt signalizacijos aktyvavimą, skatinantį proliferaciją [103, 104]. Kitame modelyje epigenetinis nutildymas HIC1 (hipermetilintas sergant vėžiu 1) iš dalies prarado p53 funkciją, bendradarbiavo skatindamas naviko augimą ir progresavimą [105].

Prieš tiriant tikslų epigenetinių aberacijų taikymą, svarbu apsvarstyti įprastus epigenetinės terapijos panaudojimo būdus. Epigenetinė terapija bene labiausiai žinoma dėl savo veiksmingumo gydant mielodisplazinius sindromus (MDS). MDS yra nevienalytė sutrikimų grupė, kuriai būdingas kaulų čiulpų nepakankamumas. Maždaug trečdalis MDS pacientų progresuoja į AML, ir šis pokytis yra susijęs su epigenetinių modifikacijų kaupimu vėžinėse ląstelėse. Daugelis genų buvo aprašyti kaip netinkamai nutildyti sergant MDS ir AML, tačiau mechanizmai, kuriais šių ir kitų genų hipermetilinimas prisideda prie MDS ar AML, nėra ypač gerai apibūdinti [106–108].

Nustatyta, kad azacitidinas (5-azacitidinas) yra veiksmingas maždaug 50–60 % pacientų, sergančių MDS [109, 110]. Azacitidinas yra nukleozido analogas, kuris yra įtrauktas į RNR ir DNR transkripcijos ir DNR replikacijos metu. Įtrauktas į DNR, jis veikia kaip DNR metiltransferazės (DNMT) inhibitorius, surišdamas DNMT, todėl negrįžtamai prarandamas aktyvumas ir jis suyra [111–113]. Be to, jo struktūra neleidžia į DNR pridėti metilo grupių [114]. Taip pat žinoma, kad azacitidinas sukelia apoptozę, ir iki šiol neaišku, ar jo veiksmingumas sergant MDS yra dėl demetilinimo, ar dėl padidėjusios apoptozės [115, 116]. Decitabinas (5-aza-2'-deoksicitidinas) gali būti įtrauktas tik į DNR ir sukelia DNR demetilinimą ir apoptozę panašiai kaip azacitidinas.

Naujausi bandymai derinti epigenetinę terapiją su įprastine chemoterapija parodė daug žadančių. Gali būti įmanoma pakeisti epigenetines modifikacijas, kurios sukelia atsparumą chemoterapijai, pvz., nutildymą. APAF1 sergant metastazavusia melanoma. APAF1 yra paskesnis efektorius TP53 DNR pažeidimo sukeltai apoptozei ir pagrindiniam vidinės apoptozės tarpininkui, o piktybinėje melanomoje jį dažnai sumažina DNR metilinimas, nors nežinoma, ar tai yra tiesioginis ar netiesioginis poveikis [117, 118]. Pastebėta, kad kai kurie antiapopotiniai genai, tokie kaip BCL2, yra pernelyg išreikšti, o tai prisideda prie cheminio atsparumo. Nors aberacijos šaltinis nežinomas, ją galima pašalinti naudojant venetoklaksą, kaip ir sergant lėtine limfocitine leukemija [119]. Epigenetinių pokyčių, kurie sumažina arba padidina specifinių genų, prisidedančių prie cheminio atsparumo (pvz., BCL2), panaikinimo poveikis dar turi būti visiškai apibūdintas, tačiau epigenetinių agentų deriniai su chemoterapija parodė klinikinę naudą [120, 121].

Epigenetinis vėžio perprogramavimas taip pat prisideda prie netinkamos specifinių audinių genų, tokių kaip vėžio / sėklidžių antigenų grupės, ekspresijos. Jie taip pavadinti, nes normaliuose audiniuose jų ekspresija apsiriboja sėklidėmis. Jie nutildomi sveikose ląstelėse dėl DNR metilinimo [122], tačiau jų galima rasti daugelyje vėžio atvejų [123, 124]. Viena šių genų grupė, su melanoma susiję antigenų genai (MAGE), yra labai išreikšti melanomos ir plokščialąstelinio plaučių vėžio atvejais [125]. Vėžio / sėklidžių antigenų ekspresija yra patrauklus imuninės sistemos terapijos taikinys, nes taikymas į antigenus, kurių ekspresijos profiliai yra riboti, sukeltų ribotą pašalinį poveikį. Kaip tarpląsteliniai baltymai, jie laikomi vakcinų taikiniais, o ne antikūnais pagrįsta imunoterapija. Tačiau buvo įrodyta, kad atsakas į MAGE peptidines vakcinas yra gana ribotas, o kombinuotas gydymas su epigenetiniais modifikatoriais, kurie padidina naviko MAGE ekspresiją, gali būti veiksmingesnis [126].

Vėžio / sėklidžių antigenų ekspresija leidžia specifinėms, modifikuotoms T ląstelėms tarpininkauti priešnavikiniam imuniniam atsakui, kaip buvo parodyta klinikiniame individualizuotos medicinos tyrime pacientams, sergantiems mieloma [127]. Be to, neseniai atliktas tyrimas parodė, kad DNR demetilinimas gali sureguliuoti hipermetilintus endogeninius retroviruso genus ir paskatinti dvigubos RNR ekspresiją, kuri gali imituoti virusinį atsaką [128, 129]. Šie reiškiniai rodo, kad epigenomo atstatymas farmakologiniu slopinimu gali sukelti vėžio ląstelių jautrumą kitoms imunoterapinėms procedūroms. Ikiklinikiniame modelyje DNMT slopinimas padidino melanomos jautrumą gydymui anti-CTLA4 antikūnu, imuninės kontrolės taško inhibitoriumi [128], o atsitiktiniai nesmulkialąstelinio plaučių vėžio radiniai patvirtina, kad gydymas anti-PD1 kontrolinio taško inhibitoriumi gali būti naudojamas azacitidinu [130]. , 131]. Sudėtinga epigenomo ir genomo sąveika rodo, kad šis metodas yra perspektyvus būdas padidinti esamų tikslios terapijos veiksmingumą.

Viena iš priežasčių, kodėl sunku tiksliai nustatyti epigenomą, yra ta, kad buvo sudėtinga atskirti vairuotojo pakeitimus nuo keleivių pakeitimų. Nors naujausi evoliuciniai stebėjimai padėjo mums suprasti vairuotojo ir keleivio mutacijas navikogenezės metu [132, 133], mes tik pradedame nustatyti vėžį sukeliančius epigenetinius pokyčius tarp daugybės tūkstančių mažiau svarbių pakitimų, kurie yra vėžio progresavimo pasekmė. . Vienas žymus tyrimas nustatė genų promotorius, kurių DNR metilinimas reikalingas somatinėms ląstelėms, vėžinėms ląstelėms ir ląstelėms kultūroje išgyventi, tiriant promotoriaus metilinimą sutrikus DNR metiltransferazės aktyvumui [134]. Genai, nustatyti kaip būtinai nutildyti vėžio ląstelių išgyvenimui, nebuvo žinomi klasikiniai naviko slopinimo genai. Šis tyrimas parodė, kad vėžio ląstelės iš tiesų gali būti „priklausomos“ nuo konkrečių epigenetinių pakitimų ir jas reikia nutildyti, kad išgyventų [99]. Be to, kai kurių genų hipermetilinimas reikalingas tik ląstelių kultūroje [134], suteikiant daugiau įžvalgų apie kultūrai būdingą fenotipą ir pateikiant abejonių dėl epigenetinių duomenų, surinktų tik kultūroje. Stabilios įamžintos ir naviko ląstelių linijos rodo ryškų CpG salų hipermetilinimą, o kultivuotų ląstelių tyrimai gali atskleisti auginimo proceso artefaktus [135].

Daugeliu atvejų DNMT slopinimo ir HDAC inhibitorių terapinės naudos mechanizmai nėra visiškai suprantami [99]. Buvo sunku modeliuoti ir išmatuoti histono modifikacijų poveikį, nes sudėtingas, kombinacinis histono kodo pobūdis reiškia, kad kiekviena modifikacija turi būti nagrinėjama kitų modifikacijų kontekste [35, 136]. Vykdomi ir būsimi tyrimai, kuriuose diskriminuojami vairuotojo ir keleivių pakeitimai, suteikia svarbios informacijos apie konkrečius pokyčius, kurie turi būti nukreipti siekiant padidinti klinikinį epigenetinės terapijos veiksmingumą. Epigenetinių inhibitorių, nukreiptų į specifinius genus ar genų grupes, kūrimas, pvz., genai, kuriuos nustatė De Carvalho ir kt. (pvz., RAK3, P2RY14, CDO1, BCHE, ESX1 ir ARMCX1), įveiktų didelę šiuo metu naudojamų epigenetinių agentų, turinčių pasaulinį poveikį, riziką ir šalutinį poveikį [134].

Epigenetinė informacija taip pat gali būti naudojama prognozuojant klinikinius rezultatus ir paciento atsaką į specifinius gydymo būdus [137]. Pavyzdžiui, DNR atkūrimo fermento O 6-metilguanino-DNR metiltransferazės geno metilinimas (MGMT) sergant glioma prognozuoja geresnį atsaką į alkilinančius agentus, dažniausiai naudojamus terapijoje [138]. Išreikštas MGMT greitai panaikina alkilinančių medžiagų (pvz., temozolomido) padarytą žalą ir suteikia atsparumą terapijai (1 lentelė) [139, 140]. Kiti epigenetiniai profiliai buvo naudojami gydymo strategijoms teikti pirmenybę arba atmesti, tačiau jiems trūksta aiškaus mechaninio ryšio tarp MGMT ir alkilinančių agentų. Pavyzdžiui, sergant nesmulkialąsteliniu plaučių vėžiu, nemetilintas IGFBP3 promotorius yra susijęs su atsaku į cisplatinos chemoterapiją [141] ir metilinimą. PITX2 prognozuoja pacientų, sergančių ankstyvos stadijos krūties vėžiu, baigtį po adjuvantinio tamoksifeno gydymo [142]. Šie ir kiti žymenys neparodė didelio jautrumo ar specifiškumo, galbūt todėl, kad nėra aiškaus mechanizmo, jungiančio geną, paveiktą metilinimo, ir atsaką į gydymą. Metilo grupių pridėjimas prie citozino nėra nei būtinas, nei pakankamas norint pakeisti genų ekspresiją, todėl DNR metilinimo, kaip genų ekspresijos ar reguliavimo pakaitalo, matavimas gali būti netiksli priemonė nuspėti atsaką į gydymą [143].

Sergant hematologiniu vėžiu, kai epigenetinių reguliatorių mutacijos yra dažnos, tikslinė terapija yra daug žadanti. Įrodyta, kad EZH2 mutantinės limfomos atveju selektyvūs EZH2 inhibitoriai sukelia apoptozę, o laukinio tipo EZH2 ląstelėms turi minimalų poveikį [75]. EZH2 inhibitorių naudojimas sumažina pasaulinį H3 K27 trimetilinimo lygį ir vėl suaktyvina genus, nutildytus dėl mutantinio EZH2 (1 lentelė) [144]. Preliminarūs EZH2 inhibitoriaus tazemetostato naudojimo mutantinės ir laukinio tipo EZH2 limfomos klinikiniuose tyrimuose duomenys parodė palankų saugumo ir veiksmingumo profilį, kad būtų galima atlikti II fazės tyrimą, suskirstytą pagal mutacijos būklę [145]. Panašūs metodai buvo nukreipti į mutantą IDH1 sergant MDS ir AML ir į mutantą DOT1L sergant MLL [77, 146, 147]. Nors šie agentai pasižymėjo klinikine sėkme, jų naudojimą ginčija pastebėjimas, kad epigenetiniai modifikatoriai egzistuoja kompleksuose ir gali būti nukreipti į nehistoninius baltymus.

Tikros epigenetinės terapijos dar turi peržengti tikslaus taikymo slenkstį. Dauguma histono modifikacijos inhibitorių dar nėra pakankamai specifiniai, kad būtų tiksliai nukreipti į specifinius pokyčius [148]. DNR redagavimo ir jo klinikinio pritaikymo atgimimas naudojant CRISPR/Cas9 sistemą atveria duris nukreipti į DNR sekas, kurios yra leistinos epigenetinėms modifikacijoms [149–151]. DNR metilinimo žymių arba chromatino modifikacijų nusodinimas arba pašalinimas gali turėti tiesioginės įtakos genų ekspresijai (apžvelgta [152]). Dar reikia pamatyti, kaip veiksmingos šios strategijos bus tiksliam epigenetiniam taikymui gyvūnų ar ex vivo modeliuose.

5. Tiksliosios medicinos ateities iššūkiai ir galimybės

Tikslios terapijos sėkmė, neatsižvelgiant į jų molekulinius taikinius, priklauso nuo trijų pagrindinių veiksnių: pacientų, kuriems taikinių terapija bus naudinga, nustatymo, gebėjimo nustatyti, ar gydymas yra sėkmingas gydymo metu, ir kovos su atsparumu gydymui strategijų. tikslinės terapijos. Išskirtinių reagorių tyrimas, „omikos“ technologijų naudojimas ir terapinio atsparumo prognozavimo bei atsako į jį metodai yra galimybė spręsti šiuos reikšmingus iššūkius efektyviai įgyvendinant tiksliąją mediciną.

5.1. Paciento identifikavimas tiksliam metodui

Nustatyti pacientus, kuriems gydymas bus naudingas, buvo didžiulis iššūkis net ir taikant populiaciją pagrįstą vėžio terapiją. Moksliniais tyrimais buvo siekiama sumažinti agresyvios terapijos naudojimą, nustatant pacientus, kurie nemato didesnės naudos iš agresyvių gydymo kursų naudojant tokias priemones kaip Oncotype DX – įrankis, skirtas tiksliai nustatyti krūties vėžio gydymo metodus [153], arba SnapShot, identifikuoti vairuotojų mutacijas sergant nesmulkialąsteliniu plaučių vėžiu [154]. Kitas pavyzdys yra pacientų, sergančių medulloblastoma, apibūdinimas, kai molekulinis apibūdinimas atskleidė keturis skirtingus molekulinius potipius: Wnt, garsinį ežį (Shh) ir 3 ir 4 grupės navikus [155]. Pacientai, sergantys Wnt potipiu, pasižymi ilgalaikiu maždaug 90 % išgyvenamumu, todėl jie yra idealūs kandidatai tyrimams, kurie sumažina dabartinės standartinės priežiūros terapijos intensyvumą [156]. Tai ypač svarbu, nes medulloblastoma pirmiausia paveikia vaikus, o chemoterapijos ir spindulinės terapijos šalutinis poveikis gali būti gana sunkus ir turėti ilgalaikį poveikį. Biologinių žymenų ir prognozinių pacientų profilių nustatymas leis gydytojams pasirinkti tinkamiausią terapijos kursą, kad esamų generinių terapijų naudojimas būtų tikslesnis ir sumažėtų sergamumas, susijęs su netiksliais gydymo metodais (1 pav.).

5.1.1. Išskirtiniai reaguotojai

Ko gero, didžiausia galimybė nustatyti pacientus, kuriems bus naudinga dabartinė tiksli terapija, yra išskirtinių reakcijų tyrimas. Yra hipotezė, kad dauguma klinikinių tyrimų, rodančių nedidelę naudą, rodo didelį pacientų skirtumą (1 pav.) ir gali būti suskirstyti į pacientus, kurie ypač gerai reaguoja į gydymą, ir pacientus, kurie nereaguoja [157]. Puikus to pavyzdys yra santykinė trastuzumabo sėkmė gydant HER2 teigiamą krūties vėžį. Maždaug 25–30 % visų krūties vėžio atvejų yra klasifikuojami kaip HER2 teigiami, o atsako į trastuzumabą dažnis šioje grupėje svyruoja nuo 15 iki 80 % (apžvelgta [158]). Taigi galime pagrįstai daryti prielaidą, kad didesniame tyrime, kuriame nebuvo atrinktos pacientės, turinčios HER2 amplifikaciją, o vietoje to būtų įtrauktos visos krūties vėžiu sergančios moterys, būtų padaryta išvada, kad maždaug 4–20 % pacientų (palyginti su 15–80 % HER2 teigiamų pacientų). naudos iš klinikinio trastuzumabo vartojimo. Tą patį galima daryti ir daugelio klinikinių tyrimų, kurie neparodė jokios statistiškai reikšmingos naudos, atveju: yra pacientų, kuriems pasireiškė objektyvus klinikinis atsakas [159, 160]. Šie pacientai laikomi išskirtiniais reaguojančiaisiais, o naujomis iniciatyvomis siekiama apibūdinti šiuos asmenis, kad būtų galima nustatyti, kas išskiria šiuos pašalinius rodiklius.Pagal apibrėžimą, išskirtiniai atsakymai yra reti, o šių neveiksmingų ar riboto veiksmingumo vaistų vartojimo pašalinių atvejų tyrimams trūks statistinės galios [161]. Tai iššūkis, su kuriuo susidurs klinikiniai tiksliausių terapijų ir stratifikacijos metodų tyrimai. Sunku bus nustatyti signalą iš triukšmo net atliekant išsamią sekos duomenų, ekspresijos duomenų, epigenetinių duomenų ir klinikinių rezultatų analizę [161].

Vienas iš būdų yra vertinti vėžį kaip „takų ligą“, o ne tirti specifinius genetinius ar epigenetinius pakitimus [48, 161, 162]. Integruojantis, tinkle pagrįstas metodas, apimantis visus veiksnius, turinčius įtakos ląstelių fenotipams (įskaitant DNR ir mitochondrijų DNR sekos nustatymą, DNR metilinimą, histonų modifikacijas, nekoduojančią RNR, genų ekspresiją, baltymų ekspresiją ir potransliacines modifikacijas), ne tik informuos apie gydymo tikslumą, bet ir taip pat sudaro užgrobtų ląstelių grandinių, matomų sergant vėžiu, sistemą [163].

5.2. Naviko heterogeniškumas yra tiksliosios medicinos iššūkis

Genomo stabilumo genų, tokių kaip DNR atstatymo ar apoptozės indukcija, ekspresijos mutacijos ar kitos aberacijos gali sukelti navikų hipermutatinius fenotipus. Nustatyta, kad kai kurie gaubtinės ir tiesiosios žarnos vėžio atvejai turi daugiau nei 100 mutacijų vienoje DNR megabazėje. Panašūs radiniai buvo pastebėti kai kurių gimdos korpuso endometriumo karcinomų ir plaučių adenokarcinomų bei plokščiųjų ląstelių karcinomų atvejais [49]. Daug mutacijų randama ir melanomos atveju [164]. Tam tikro vėžio evoliucija retai vyksta kaip procesas, paveikiantis vieną, vis agresyvesnį kloną, kloninės evoliucijos teorija siūlo evoliucinius procesus, veikiančius skirtingus subklonus, kurie vystosi vienu metu [165–167]. Ši skirtinga evoliucija gali sukelti didelį intratumorinį nevienalytiškumą, kuris yra didelis iššūkis molekuliniam navikų profiliavimui. Didelis iššūkis atliekant vėžio tyrimus yra užtikrinti, kad iš klinikinių mėginių būtų paimami minimalūs mėginiai, tuo pat metu santykiniu tikslumu modeliuojant būdingą heterogeniškumą [168].

Epigenetiniai reiškiniai taip pat prisideda prie naviko nevienalytiškumo, tačiau sunku visiškai suprasti epigenetinį nevienalytiškumą ir jo išskirtinį indėlį į vėžio progresavimą, nes dėl dinaminio epigenetinių modifikacijų pobūdžio juos sunkiau apibūdinti laike ir erdvėje. Vienos ląstelės analizės naudojimas ir mūsų gebėjimas analizuoti DNR be ląstelių pradėjo atskleisti kai kuriuos iš šių sudėtingų dalykų ir yra aptariami toliau. Genominis ir epigenominis nestabilumas, kurį įgalina onkogenezės, transformacijos, progresavimo ir metastazių procesai, keičia atskirų navikų fenotipus. Nors kloninės evoliucijos augliuose tyrimą daugiausia lėmė genetinė struktūra, naujausi prostatos vėžio įrodymai rodo, kad epigenomas gali vystytis konvergenciškai ir prisidėti prie naviko heterogeniškumo [169]. Be to, kasos latakų adenokarcinomos išvadose nustatyta, kad nors ir mažai nevienalytiškumo vairuotojų mutacijose, epigenetinis heterogeniškumas prisideda prie metastazavimo potencialo [170, 171]. Sudėtinga genetikos ir epigenetikos sąveika, leidžianti kai kuriems navikams tapti invaziniais ir metastazavusiais, palaiko tikslios vėžio medicinos naudojimą siekiant nukreipti vairuotojų mutacijas ir epigenetines modifikacijas bei atitinkamus ląstelių biologijos sukeltus pokyčius.

Laikinas ir erdvinis molekulinis nevienalytiškumas yra pagrindinė kliūtis biomarkerių atradimui, o mūsų nesugebėjimas tiksliai modeliuoti ir išmatuoti nevienalytiškumą yra didžiausia kliūtis sėkmingam tiksliam vėžio gydymui (2 pav.). Pavyzdžiui, krūties navikai klasifikuojami kaip teigiami estrogenų receptorių (ER-) remiantis 10 % ER ekspresuojančių ląstelių riba, tačiau atsakas į gydymą gali būti pastebėtas pacientams, kurių ekspresuoja tik 1 % ląstelių. ER [172]. ER teigiamas, pagrįstas 10 % riba, tiksliai nenumato atsako į selektyvius ER moduliatorius, tokius kaip tamoksifenas, todėl tikėtina, kad molekulinis nevienalytiškumas turi įtakos navikų atsakui į gydymą [173–175]. Akivaizdu, kad dvejetainis skirtumas tarp ER teigiamų ir ER neigiamų neskiria tų, kurie reaguos į tamoksifeną, ir tų, kurie nereaguos, o molekulinis heterogeniškumas gali padėti paaiškinti šią išvadą. Tačiau pagrindinis iššūkis modeliuojant naviko heterogeniškumą yra gauti tinkamus mėginius iš navikų. Tyrimai parodė, kad tuo pačiu metu evoliucija vyksta tarp skirtingų naviko klonų, ir jie gali egzistuoti skirtingose ​​naviko erdvėse. Tiksliau, pasikartojančių gliomų analizė atskleidė, kad bent pusė pirminių vairuotojų mutacijų klasikiniuose vairuotojų genuose, tokiuose kaip TP53, buvo neaptinkamos pasikartojant [176]. Nors biologinių žymenų atradimą riboja sunkumai tinkamai išmatuojant kiekvieną kloną, koks jis yra auglyje, tokie metodai kaip STAR-FISH, apjungiantys vieno nukleotido ir kopijų skaičiaus pakitimų aptikimą vienos ląstelės skiriamosios gebos lygiu, palaikys klinikinį sprendimą. tikslios terapijos kūrimas [177].

Tikslus intratumorinio genetinio ir epigenetinio heterogeniškumo matavimas ir modeliavimas padės nustatyti biomarkerius, kurie parodys, ar gydymas bus sėkmingas gydymo metu. Vienas iš galimų terapinio atsako nustatymo būdų yra cirkuliuojančio naviko DNR (ctDNR) matavimas. Viename melanomos tyrime nustatyta, kad ctDNR yra gana nuosekli ir informatyvi kaip kraujo biomarkeris [178]. CtDNR lygiai atitiko atsaką ir ligos progresavimą. Panašiai krūties vėžio tyrimas parodė, kad ctDNR numatė metastazių atkrytį pacientams, sergantiems ankstyvos stadijos liga, ir galėjo numatyti genetinius įvykius, nustatytus metastazavusio atkryčio metu [179]. Be atkryčio numatymo, ctDNA taip pat gali suteikti informacijos apie atsparumo mechanizmus. Pavyzdžiui, ctDNR aptiko RAS kelio mutacijas kaip kolorektalinio vėžio atsparumo anti-EGFR terapijai mechanizmą [180–182].

CtDNR taip pat galima išmatuoti epigenetinius pokyčius. Nustačius metilintą SEPT9 ctDNR, buvo nustatyta maždaug 70 % gaubtinės ir tiesiosios žarnos vėžio atvejų [183]. CtDNR metilinimas gali būti gana neinvazinis būdas įvertinti paciento atsaką į gydymą. Pavyzdžiui, metilintos GSTP1 DNR buvimas plazmoje buvo naudojamas prostatos vėžiu sergančių pacientų atsakui sekti [184], o dešimties genų grupės metilinimas skyrėsi tarp krūties vėžiu sergančių pacientų, kuriems pasireiškė dalinis arba visiškas atsakas, ir tų, kuriems nebuvo jokio atsako. terapija [185]. Buvo nustatyta daug kitų metilintų biomarkerių, kurie koreliuoja su ligos progresavimu [186–190].

Be didėjančio DNR be ląstelių jautrumo ir specifiškumo, vienos ląstelės sekos nustatymas kaip diagnostikos įrankis pagerins mūsų supratimą apie genetikos ir epigenetikos indėlį į erdvinį ir laikinąjį nevienalytiškumą [191, 192]. Viso genomo bisulfito sekos nustatymas [193, 194] arba kiti vienos ląstelės analizės metodai, įskaitant vienos ląstelės DNazės sekos nustatymą [195] ir vienos ląstelės chromosomų konformacijos fiksavimą (Hi-C) [196, 197], nustatys svarbius epigenetinius modelius, kurie yra svarbūs tikslios terapijos sėkmei. Be įžvalgos apie genetinio ir epigenetinio nevienalytiškumo pobūdį, šie vienaląsčių metodai yra daug žadantys nustatant specifinių naviko ląstelių subpopuliacijų vaidmenį vėžio inicijavimui ir progresavimui. Vienas iš pavyzdžių yra didelis histono jungties H1.0 ekspresijos nevienalytiškumas, kuris, kaip buvo įrodyta, palaiko naviko ląstelių savaiminį atsinaujinimą, o tai yra svarbus veiksnys dėl naviko ląstelių subpopuliacijų tumorigeniškumo [198].

5.2.1. Būtinas „omikos“ technologijų vaidmuo molekulinėje patologijoje

Dabartinė molekulinės patologijos įrankių rinkinys pirmiausia aptinka pagrindinius chromosomų anomalijas, įskaitant genų amplifikacijas ir delecijas. Imunohistocheminis (IHC) HER2 ekspresijos aptikimas, fluorescencinės in situ hibridizacijos (FISH) BCR-ABL translokacijos aptikimas ir PML-RARA translokacijos RT-PCR aptikimas suteikė informacijos apie klinikinį tikslinių agentų, tokių kaip trastuzumabas, imatinibas ir retinoic, naudojimą. rūgšties. Mūsų naujam supratimui apie vėžį kaip fenotipą, kuriam įtakos turi genų ekspresija ir kurį moduliuoja epigenetiniai veiksniai, be genetinių sekų, reikia išsamesnio požiūrio, kad būtų galima visapusiškai informuoti apie tikslinių terapijų kūrimą ir pasirinkimą. Tam reikia naudoti tikslesnes priemones, kad būtų galima nustatyti taškinių mutacijų ir transkripcijos moduliacijos buvimą ir klinikinę reikšmę (2 pav.). Norint susidaryti išsamesnį vaizdą apie vėžio elgesį ir vizualizuoti intervencijos galimybes, būtina integruoti molekulinių „omikos“ technologijų naudojimą. Pavyzdžiui, norint aptikti žinomas vėžio mutacijas, tokias kaip V600E BRAF gene, buvo naudojami riboti molekuliniai tyrimai, tokie kaip PGR ir Sangerio sekos nustatymas (1 lentelė). Šios didesnės skiriamosios gebos diagnostikos priemonės padėjo naudoti specifinius BRAF inhibitorius, įskaitant vemurafenibą ir dabrafenibą [199, 200]. Naudojant „omikos“ technologijas, tokias kaip pilnas DNR ir RNR sekos nustatymas ir baltymų bei metabolitų lygių apibūdinimas, pradedama pateikti išsamesnį vaizdą apie vėžį ir unikalias aberacijas kiekvienu atveju (pvz., duomenys, gauti iš TCGA ir ICGC).

Genetika ir epigenetika nėra du skirtingi procesai, jie yra susipynę ir reguliuojami kiekviename žingsnyje. Turint tai omenyje, tampa aišku, kad vien IHC žymenys ir FISH negali būti patikimai naudojami molekulinei vėžio klasifikacijai. Molekulinė patologija, integruojanti duomenis, surinktus naudojant istorinius ir naujus tyrimo įrankius, siekiant ištirti taškines mutacijas, epigenetinius pokyčius, genų ekspresiją ir potransliacinius pakeitimus, gali suteikti informacijos, reikalingos tiksliam gydymui (2 pav.).

5.3. Atsparumas tikslinei terapijai

Paskutinis tikslios medicinos sėkmės iššūkis yra atsparumo tikslinėms terapijoms atsiradimas. Tai turbūt geriausiai modeliuoja TKI serija, sukurta prieš BCR-ABL translokacija [201]. Imatinibo sėkmę sumenkino atsparių variantų atsiradimas. Dėl to buvo sukurti antrosios ir trečiosios kartos tirozino kinazės inhibitoriai prieš BCR-ABL geno produktą [202–205]. Galiausiai buvo sukurtas naujas LML (omacetaksino) gydymas, veikiantis nepriklausomai nuo BCR-ABL sulieto baltymo. Tai buvo sėkminga pacientams, kuriems nepavyko gydyti ankstesniais BCR-ABL nukreiptais TKI [206]. Turėtume tikėtis, kad nuolatinė vėžio ląstelių kloninė evoliucija leis genetiniams ir fenotipiniams variantams išvengti tikslinės tikslios terapijos.

Pirminis atsparumas tiksliam gydymui buvo pastebėtas naudojant daugybę tikslinių agentų. Sergant plaučių vėžiu, pirminis atsparumas į EGFR arba ALK nukreiptiems tirozino kinazės inhibitoriams atsiranda dėl genetinių pakitimų pirminiame taikinyje arba už jo ribų [207, 208]. Įtraukus genetinę ir epigenetinę informaciją naudojant naujas „omikos“ technologijas ir skaičiavimo metodus, bus palaikoma nuolatinė pacientų stratifikacija, neatsižvelgiant į konkrečių pakitimų nebuvimą ar buvimą (2 pav.). Be to, kai kuriais atvejais klaidingai teigiami diagnostikos rezultatai gali prisidėti prie stebimo atsparumo, kaip buvo dokumentuota dėl plaučių vėžio ALK pertvarkymų [209]. Diagnostikos patobulinimai ir pažanga pašalins šiuos klaidingai informuotus gydymo metodus. Įgytas arba antrinis atsparumas iš esmės atsiranda dėl terapinio tikslo pakitimų, alternatyvaus ar paskesnio signalo aktyvavimo arba fenotipinės transformacijos [210]. Vienas iš būdų kovoti su tuo yra racionalus terapinių priemonių derinys. Pavyzdžiui, mažos molekulės venetoklakso derinimas su anti-CD20 rituksimabu gali užkirsti kelią kai kurioms ūminėms mieloidinėms leukemijoms apeiti BCL2 slopinimą [211].

Turime pabandyti visiškai nustatyti sudėtingą vėžio grandinę, kad būtume vienu žingsniu priekyje terapinio atsparumo, ir tai turi apimti nuolatinius genetinės ir epigenetinės įvairovės stebėjimus prieš gydymą, jo metu ir po jo. Sukaupti duomenys iš klinikinių tyrimų, susijusių su tikslinėmis terapijomis atskirai arba kartu su esamais vaistais, ir toliau leis suprasti galimus būdus, kaip užkirsti kelią įgytam atsparumui.

6. Išvada

Visuomenės sąmoningumas apie tiksliąją mediciną iškėlė daug klausimų, į kuriuos dar reikia atsakyti. Kadangi mes taikome vis rečiau pasitaikančias molekulines aberacijas (1 pav.), vaistų kūrimo kaina verčia mus paklausti, kiek verta išgydyti vėžį, galbūt individualų gyvenimą, artimiausioje ateityje. Tikslus požiūris, o ne individualizuotas požiūris į vėžio terapiją yra ekonomiškesnis ir greičiausiai bus įgyvendintas bet kurioje socializuotos medicinos sistemoje. Kaip minėta anksčiau, nedidelis konkrečių pakeitimų imties dydis apribos statistinę galią ir privers priimti naujus klinikinių tyrimų planus. Naujoviškas požiūris į esamas medicinos politikos sistemas sustiprins tikslios medicinos ateitį, nes paspartins vaistų kūrimo procesą iki patvirtinimo, o dalijimasis informacija tarp pagrindinių tyrimų centrų, atliekančių tiksliosios medicinos tyrimus, taip pat paspartins naują vėžio terapijos amžių.

2016 m. liepos 7 d. JAV prezidentas Barackas Obama pateikė galingą analogiją, apibūdindamas tiksliąją mediciną, sakydamas: „Nepirktume akinių, kurie neatitinka mūsų regėjimo, ir nors daug žmonių susilaužo rankas, visi pasirengia jų pačių aktoriai“ [197]. Moksliniai tyrimai, skirti tirti dabartines grėsmes tikslios medicinos sėkmei, leis klinikinei onkologijai patekti į tai, kas turėtų būti didžiausia revoliucija medicinos istorijoje – duomenimis pagrįstas tikslus požiūris į vėžio gydymą. Mūsų supratimas apie genetiką ir epigenetiką palaiko jų tęstinį tyrimą, nes jie yra pagrindiniai piktybinio fenotipo veiksniai ir yra raktas į piktybinio transformacijos procesą, kad jį būtų galima sustabdyti, kai jis randamas.

Interesų konfliktai

Autoriai pareiškia, kad dėl šio straipsnio publikavimo nėra interesų konfliktų.

Padėkos

Šis darbas buvo paremtas Kanados sveikatos tyrimų instituto (CIHR) dotacija Paolai Marcato (MOP-130304). Krysta Mila Coyle yra garbės Killam mokslininkė ir Scotia mokslininkė, remiama CIHR doktorantūros mokslo apdovanojimu, Dalhousie medicinos tyrimų fondo (DMRF) DeWolfe absolventų studentais ir Beatrice Hunter vėžio tyrimų instituto (BHCRI) stažuotojo apdovanojimu. ). Jeanette E. Boudreau yra DMRF Cameron Cancer Scientist pirmininkė ir ją papildomai remia Bantingo tyrimų fondas ir BHCRI.

Nuorodos

  1. J. L. Jameson ir D. L. Longo, „Tiksli medicina— Personalizuota, problemiška ir daug žadanti“, Naujosios Anglijos medicinos žurnalas, t. 372, Nr. 23, p. 2229–2234, 2015. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  2. R. Rubinas, „Tiksli medicina: ateitis ar tiesiog politika? JAMA, t. 313, Nr. 11, p. 1089–1091, 2015. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  3. A. Karpozilos ir N. Pavlidis, „Vėžio gydymas graikų senovėje“, Europos vėžio žurnalas, t. 40, Nr. 14, p. 2033–2040, 2004. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  4. C. P. Rhoads, „Azoto garstyčios gydant neoplastinę ligą: oficialus pareiškimas“, Amerikos medicinos asociacijos žurnalas, t. 131, Nr. 8, p. 656–658, 1946. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  5. A. Gilman, F. S. Philips ir J. W. Hedgpeth, „B-chloretilaminų ir sulfidų biologiniai veiksmai ir terapinis pritaikymas“, Mokslas, t. 103, Nr. 2675, p. 409–436, 1946. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  6. V. T. deVita Jr. ir E. Chu, „Vėžio chemoterapijos istorija“, Vėžio tyrimai, t. 68, Nr. 21, p. 8643–8653, 2008. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  7. S. Farber, L. K. Diamond, R. D. Mercer, R. F. Sylvester ir J. A. Wolff, „Laikinos vaikų leukemijos remisijos, kurias sukelia folio rūgšties antagonistas, 4-aminopteroil-glutamo rūgštis (aminopterinas)“. Naujosios Anglijos medicinos žurnalas, t. 238, Nr. 23, p. 787–793, 1948. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  8. D. Pinkel, „Aktinomicinas D sergant vaikų vėžiu“, Pediatrija, t. 23, Nr. 2, p. 342–347, 1959. Žiūrėti: Google Scholar
  9. E. C. Halperinas, C. A. Perezas ir L. W. Brady, Perez ir Bradys radiacinės onkologijos principai ir praktika, Lippincott Williams & Wilkins, 2008 m.
  10. M. A. Jordan, D. Thrower ir L. Wilson, „Vinca alkaloidų ląstelių proliferacijos slopinimo mechanizmas“, Vėžio tyrimai, t. 51, Nr. 8, p. 2212–2222, 1991. Žiūrėti: Google Scholar
  11. D. B. Longley, D. P. Harkin ir P. G. Johnston, „5-fluorouracilas: veikimo mechanizmai ir klinikinės strategijos“, Gamtos apžvalgos Vėžys, t. 3, Nr. 5, p. 330–338, 2003. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  12. M. Abal, J. M. Andreu ir I. Barasoain, „Taksanai: mikrotubulų ir centrosomų taikiniai bei nuo ląstelių ciklo priklausomi veikimo mechanizmai“, Dabartiniai vaistų nuo vėžio tikslai, t. 3, Nr. 3, p. 193–203, 2003. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  13. L. Kelland, „Platinos pagrindu veikiančios vėžio chemoterapijos atgimimas“, Gamtos apžvalgos Vėžys, t. 7, Nr. 8, p. 573–584, 2007. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  14. M. J. Harper ir A. L. Walpole, „Naujas trifeniletileno darinys: poveikis implantacijai ir veikimo būdas žiurkėms“ Reprodukcijos ir vaisingumo žurnalas, t. 13, Nr. 1, p. 101–119, 1967. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  15. M. P. Cole, C. T. A. Jones ir I. D. H. Todd, „Naujas antiestrogeninis agentas sergant vėlyvuoju krūties vėžiu ir ankstyvas klinikinis ICI46474 įvertinimas“, Britų vėžio žurnalas, t. 25, Nr. 2, p. 270–275, 1971. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  16. V. C. Jordanas, „Tamoksifenas: perėjimo prie tikslinės terapijos katalizatorius“, Europos vėžio žurnalas, t. 44, Nr. 1, p. 30–38, 2008. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  17. M. E. Huang, Y. C. Ye, S. R. Chen, J. R. Chai, J. X. Lu, L. Zhoa ir kt., „Visų trans-retinoinės rūgšties naudojimas gydant ūminę promielocitinę leukemiją“, Kraujas, t. 72, p. 567–572, 1988. Žiūrėti: Google Scholar
  18. S. Castaigne, C. Chomienne, M. T.Daniel ir kt., „All-trans retinoic acid kaip diferenciacijos terapija ūminei promielocitinei leukemijai. I. Klinikiniai rezultatai“, Kraujas, t. 76, Nr. 9, p. 1704–1709, 1990. Žiūrėti: Google Scholar
  19. D. G. Maloney, A. J. Grillo-López, C. A. White ir kt., „IDEC-C2B8 (rituksimabo) anti-CD20 monokloninių antikūnų terapija pacientams, sergantiems recidyvuojančia žemo laipsnio ne Hodžkino limfoma“, Kraujas, t. 90, Nr. 6, p. 2188–2195, 1997. Žiūrėti: Google Scholar
  20. P. McLaughlin, A. J. Grillo-López, B. K. Link ir kt., „Rituksimabo chimerinių anti-CD20 monokloninių antikūnų terapija recidyvuotai indolentinei limfomai: pusė pacientų reaguoja į keturių dozių gydymo programą“, Klinikinės onkologijos žurnalas, t. 16, Nr. 8, p. 2825–2833, 1998. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  21. B. J. Druker, M. Talpaz, D. J. Resta ir kt., „BCR-ABL tirozino kinazės specifinio inhibitoriaus veiksmingumas ir saugumas sergant lėtine mieloidine leukemija“, Naujosios Anglijos medicinos žurnalas, t. 344, Nr. 14, p. 1031–1037, 2001. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  22. F. Montemurro, M. Donadio, M. Clavarezza ir kt., „Pacientų, sergančių HER2 teigiamu pažengusiu krūties vėžiu, progresuojančiu gydymo trastuzumabu metu, rezultatai“, Onkologas, t. 11, Nr. 4, p. 318–324, 2006. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  23. S. L. Topalian, F. S. Hodi, J. R. Brahmer ir kt., „Anti-PD-1 antikūnų sauga, aktyvumas ir imuninės koreliacijos sergant vėžiu“, Naujosios Anglijos medicinos žurnalas, t. 366, Nr. 26, p. 2443–2454, 2012. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  24. D. R. Leach, M. F. Krummel ir J. P. Allison, „Antnavikinio imuniteto stiprinimas naudojant CTLA-4 blokadą“, Mokslas, t. 271, Nr. 5256, p. 1734–1736, 1996. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  25. F. S. Hodi, S. J. O'Day, D. F. McDermott ir kt., „Pagerėjęs išgyvenamumas vartojant ipilimumabą pacientams, sergantiems metastazavusia melanoma“, Naujosios Anglijos medicinos žurnalas, t. 363, Nr. 8, p. 711–723, 2010. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  26. M. J. Bissell, H. G. Hall ir G. Parry, „Kaip ekstraląstelinė matrica nukreipia genų ekspresiją? Teorinės biologijos žurnalas, t. 99, Nr. 1, p. 31–68, 1982. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  27. A. Sigal, R. Milo, A. Cohen ir kt., „Baltymų lygių kintamumas ir atmintis žmogaus ląstelėse“, Gamta, t. 444, Nr. 7119, p. 643–646, 2006. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  28. S. A. Frank ir M. R. Rosner: „Nepaveldimas ląstelių kintamumas pagreitina vėžio evoliucinius procesus“, PLoS biologija, t. 10, Nr. 4, Straipsnio ID e1001296, 2012. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  29. S. B. Baylin, „DNR metilinimas ir genų nutildymas sergant vėžiu“, Gamtos klinikinė onkologijos praktika, t. 2, Nr. 1, p. S4–S11, 2005. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  30. J. Newell-Price, A. J. L. Clark ir P. King, „DNR metilinimas ir genų ekspresijos nutildymas“, Endokrinologijos ir metabolizmo tendencijos, t. 11, Nr. 4, p. 142–148, 2000. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  31. R. A. Irvine, I. G. Lin ir C.-L. Hsieh, „DNR metilinimas turi vietinį poveikį transkripcijai ir histono acetilinimui“, Molekulinė ir ląstelių biologija, t. 22, Nr. 19, p. 6689–6696, 2002. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  32. A. M. Deaton ir A. Bird, „CpG salos ir transkripcijos reguliavimas“, Genai & plėtra, t. 25, Nr. 10, p. 1010–1022, 2011. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  33. P. A. Jones, „DNR metilinimo funkcijos: salos, pradžios vietos, genų kūnai ir ne tik“ Gamtos apžvalgos Genetika, t. 13, Nr. 7, p. 484–492, 2012. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  34. B. D. Strahl ir C. D. Allis, „Kovalentinių histonų modifikacijų kalba“, Gamta, t. 403, Nr. 6765, p. 41–45, 2000. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  35. T. Jenuwein ir C. D. Allis, „Histono kodo vertimas“, Mokslas, t. 293, Nr. 5532, p. 1074–1080, 2001. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  36. C. L. Peterson ir M. Laniel, „Histonai ir histonų modifikacijos“, Dabartinė biologija, t. 14, Nr. 14, p. R546–R551, 2004. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  37. M. Esteller, „Nekoduojančios RNR žmogaus ligose“, Gamtos apžvalgos Genetika, t. 12, Nr. 12, p. 861–874, 2011. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  38. T. Mohandas, R. S. Sparkes ir L. J. Shapiro, „Neaktyvios žmogaus X chromosomos reaktyvacija: X inaktyvavimo DNR metilinimo įrodymai“, Mokslas, t. 211, Nr. 4480, p. 393–396, 1981. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  39. J. C. Y. Lau, M. L. Hanel ir R. Wevrick, „Audiniams būdingos ir įspaustos žmogaus NDN geno epigenetinės modifikacijos“, Nukleino rūgščių tyrimai, t. 32, Nr. 11, p. 3376–3382, 2004. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  40. A. C. Ferguson-Smith, „Genominis įspaudas: epigenetinės paradigmos atsiradimas“, Gamtos apžvalgos Genetika, t. 12, Nr. 8, p. 565–575, 2011. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  41. V. K. Cortessis, D. C. Thomas, A. J. Levine ir kt., „Aplinkos epigenetika: perspektyvos tirti epigenetinį poveikio ir atsako santykių tarpininkavimą“, Žmogaus genetika, t. 131, Nr. 10, p. 1565–1589, 2012. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  42. B. A. Benayoun, E. A. Pollina ir A. Brunet, „Epigenetinis senėjimo reguliavimas: aplinkos įnašų susiejimas su genomo stabilumu“, „Nature Reviews“ molekulinė ląstelių biologija, t. 16, Nr. 10, p. 593–610, 2015. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  43. D. Hanahan ir R. A. Weinberg, „Vėžio požymiai“, Ląstelė, t. 100, ne. 1, p. 57–70, 2000. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  44. D. Hanahan ir R. A. Weinberg, „Vėžio požymiai: kita karta“, Ląstelė, t. 144, Nr. 5, p. 646–674, 2011. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  45. P. Modrich, „Neatitikimų taisymas, genetinis stabilumas ir vėžys“, Mokslas, t. 266, Nr. 5193, p. 1959–1960, 1994. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  46. C. Lengauer, K. W. Kinzler ir B. Vogelstein, „Genetinis žmogaus vėžio nestabilumas“, Gamta, t. 396, Nr. 6712, p. 643–649, 1998. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  47. D. P. Cahill, K. W. Kinzler, B. Vogelstein ir C. Lengauer, „Genetinis nestabilumas ir darvino atranka augliuose“, Ląstelių biologijos tendencijos, t. 9, Nr. 12, p. M57–M60, 1999. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  48. B. Vogelstein ir K. W. Kinzler, „Vėžio genai ir jų kontroliuojami keliai“, Gamtos medicina, t. 10, Nr. 8, p. 789–799, 2004. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  49. C. Kandoth, M. D. McLellan, F. Vandin ir kt., „Mutacinis kraštovaizdis ir reikšmė 12 pagrindinių vėžio tipų“, Gamta, t. 502, Nr. 7471, p. 333–339, 2013. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  50. A. P. Feinbergas ir B. Vogelsteinas, „Ras onkogenų hipometilinimas pirminiuose žmogaus vėžiuose“, Biocheminių ir biofizinių tyrimų komunikacijos, t. 111, Nr. 1, p. 47–54, 1983. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  51. A. Fernández-Medarde ir E. Santos, „Ras sergant vėžiu ir vystymosi ligomis“, Genai ir vėžys, t. 2, Nr. 3, p. 344–358, 2011. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  52. M. R. Stratton, P. J. Campbell ir P. A. Futreal, „Vėžio genomas“, Gamta, t. 458, Nr. 7239, p. 719–724, 2009. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  53. S. Nik-Zainalis, H. Daviesas, J. Staafas, M. Ramakrishna, D. Glodzikas ir X. Zou, „Somatinių mutacijų peizažas 560 krūties vėžio viso genomo sekų“ Gamta, t. 534, p. 47–54, 2016. Žiūrėti: Google Scholar
  54. D. Tamborero, A. Gonzalez-Perez, C. Perez-Llamas, J. Deu-Pons, C. Kandoth ir J. Reimand, „Išsamus mutacijų vėžį skatinančių genų identifikavimas 12 navikų tipų“, Mokslinės ataskaitos, t. 3, p. 2650, 2013. Žiūrėti: Google Scholar
  55. Y. Chen, J. McGee, X. Chen, T. N. Doman ir X. Gong, „Vaistinių vėžio sukėlėjų genų identifikavimas, sustiprintas TCGA duomenų rinkiniuose“, PLoS ONE, t. 9, Nr. 9, Straipsnio ID e107646, 2014. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  56. A. G. Knudson Jr. „Mutacija ir vėžys: statistinis retinoblastomos tyrimas“, Jungtinių Amerikos Valstijų nacionalinės mokslų akademijos darbai, t. 68, Nr. 4, p. 820–823, 1971. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  57. A. G. Knudsonas, „Du genetiniai smūgiai (daugiau ar mažiau) vėžiui“, Gamtos apžvalgos Vėžys, t. 1, p. 157–162, 2001. Žiūrėti: Google Scholar
  58. A. J. W. Paige, „Iš naujo apibrėžiant naviko slopinimo genus: dviejų smūgių hipotezės išimtys“, Ląsteliniai ir molekuliniai gyvybės mokslai, t. 60, Nr. 10, p. 2147–2163, 2003. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  59. S. R. Payne ir C. J. Kemp, „Tumor supressor genetics“, Kancerogenezė, t. 26, Nr. 12, p. 2031–2045, 2005. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  60. C. J. Sherr, „Naviko slopinimo principai“, Ląstelė, t. 116, Nr. 2, p. 235–246, 2004. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  61. A. Dobrovic ir D. Simpfendorfer, „BRCA1 geno metilinimas sporadiniame krūties vėžyje“ Vėžio tyrimai, t. 57, Nr. 16, p. 3347–3350, 1997. Žiūrėti: Google Scholar
  62. M. Nakamura, Y. Yonekawa, P. Kleihues ir H. Ohgaki, „RB1 geno hipermetilacijos skatinimas glioblastomose“ Laboratorinis tyrimas, t. 81, Nr. 1, p. 77–82, 2001. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  63. M. Toyota ir J.-P. J. Issa, „Epigenetiniai solidinių ir hematopoetinių navikų pokyčiai“, Onkologijos seminarai, t. 32, Nr. 5, p. 521–531, 2005. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  64. V. Birgisdottir, O. A. Stefansson, S. K. Bodvarsdottir, H. Hilmarsdottir, J. G. Jonasson ir J. E. Eyfjord, „Epigenetinis nutildymas ir ištrynimas BRCA1 sporadinio krūties vėžio genas“, Krūties vėžio tyrimai, t. 8, Nr. 4, straipsnis R38, 2006. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  65. A. Balmain, „Vėžys: naujojo amžiaus navikų slopintojai“, Gamta, t. 417, Nr. 6886, p. 235–237, 2002. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  66. K. M. Coyle, J. P. Murphy, D. Vidovic ir kt., „Krūties vėžio potipis lemia DNR metilinimą ir ALDH1A3 sukeltą naviko slopintuvo RARRES1 ekspresiją“, Oncotarget, t. 7, Nr. 28, p. 44096–44112, 2016. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  67. D. P. Lane, „Vėžys: p53, genomo sergėtojas“, Gamta, t. 358, Nr. 6381, p. 15–16, 1992. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  68. M. Olivier, M. Hollstein ir P. Hainaut, „TP53 mutacijos žmogaus vėžio atveju: kilmė, pasekmės ir klinikinis panaudojimas“, Cold Spring Harbor perspektyvos biologijoje, t. 2, Nr. 1, straipsnio ID a001008, 2010. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  69. S. De ir F. Michor, „DNR antrinės struktūros ir epigenetiniai vėžio genomo evoliucijos veiksniai“, Gamtos struktūrinė ir molekulinė biologija, t. 18, Nr. 8, p. 950–955, 2011. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  70. J. Xia, L. Han ir Z. Zhao, „DNR metilinimo ryšio su mutacijų greičiu ir alelių dažniu žmogaus genome tyrimas“, BMC genomika, t. 13, straipsnis S7, 2012. Žiūrėti: Google Scholar
  71. B. Schuster-Bཬkler ir B. Lehner, „Chromatino organizacija turi didelę įtaką žmogaus vėžio ląstelių regioninių mutacijų dažniui“, Gamta, t. 488, Nr. 7412, p. 504–507, 2012. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  72. W. Timpas ir A. P. Feinbergas, „Vėžys kaip nereguliuojamas epigenomas, suteikiantis ląstelėms augimo pranašumą šeimininko sąskaita“, Gamtos apžvalgos Vėžys, t. 13, Nr. 7, p. 497–510, 2013. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  73. C. Park, W. Qian ir J. Zhang, „Genominiai įrodymai dėl padidėjusio mutacijų dažnio labai išreikštuose genuose“, EMBO ataskaitos, t. 13, Nr. 12, p. 1123–1129, 2012. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  74. H. Yang, D. Ye, K.-L. Guanas ir Y. Xiong, „IDH1 ir IDH2 mutacijos navikogenezėje: mechaninės įžvalgos ir klinikinės perspektyvos“, Klinikiniai vėžio tyrimai, t. 18, Nr. 20, p. 5562–5571, 2012. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  75. S. K. Knutson, T. J. Wigle, N. M. Warholic ir kt., „Selektyvi EZH2 inhibitorius blokuoja H3K27 metilinimą ir naikina mutantines limfomos ląsteles“, Gamtos cheminė biologija, t. 8, Nr. 11, p. 890–896, 2012. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  76. J. K. Shen, G. M. Cote, Y. Gao ir kt., „Taikymas į EZH2 sukeltą H3K27 metilinimą slopina sinovialinės sarkomos proliferaciją ir migraciją in vitro“, Mokslinės ataskaitos, t. 6, Straipsnio ID 25239, 2016. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  77. E. M. Stein, G. Garcia-Manero, D. A. Rizzieri, M. Savona, R. Tibes ir J. K. Altman, „DOT1L inhibitorius EPZ-5676: saugumas ir aktyvumas recidyvuojantiems / atspariems pacientams, sergantiems MLL pertvarkyta leukemija“, Kraujas, t. 124, p. 387, 2014. Žiūrėti: Google Scholar
  78. M. Ehrlich, „DNR metilinimas sergant vėžiu: per daug, bet ir per mažai“, Onkogenas, t. 21, Nr. 35, p. 5400–5413, 2002. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  79. A. De Capoa, A. Musolino, S. Della Rosa ir kt., „DNR demetilinimas yra tiesiogiai susijęs su naviko progresavimu: įrodymai normaliose, iki piktybinėse ir piktybinėse ląstelėse iš gimdos kaklelio mėginių“, Onkologijos ataskaitos, t. 10, Nr. 3, p. 545–549, 2003. Žiūrėti: Google Scholar
  80. B. Cadieux, T.-T. Ching, S. R. VandenBerg ir J. F. Costello, „Genomo masto hipometilacija žmogaus glioblastomose, susijusi su specifiniu kopijų skaičiaus pasikeitimu, metilentetrahidrofolato reduktazės alelio būkle ir padidėjusiu proliferacija“, Vėžio tyrimai, t. 66, Nr. 17, p. 8469–8476, 2006. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  81. H.-H. Seifert, V. Schmiemann, M. Mueller ir kt., „In situ globalios DNR hipometilinimo aptikimas eksfoliacinėje šlapimo citologijoje pacientams, kuriems įtariamas šlapimo pūslės vėžys“. Eksperimentinė ir molekulinė patologija, t. 82, Nr. 3, p. 292–297, 2007. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  82. M. Ehrlich, „DNR hipometilinimas vėžio ląstelėse“, Epigenomika, t. 1, Nr. 2, p. 239–259, 2009. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  83. D. Aranas, S. Sabato ir A. Hellmanas: „Distalinių reguliavimo vietų DNR metilinimas apibūdina vėžio genų reguliavimo sutrikimą“, Genomo biologija, t. 14, Nr. 3, straipsnis R21, 2013. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  84. B. S. Cobb, S. Morales-Alcelay, G. Kleiger, K. E. Brown, A. G. Fisher ir S. T. Smale, „Ikaros nukreipimas į pericentromerinį heterochromatiną tiesiogiai surišant DNR“, Genai ir raida, t. 14, Nr. 17, p. 2146–2160, 2000. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  85. P. Sabbattini, M. Lundgren, A. Georgiou, C.-M. Chow, G. Warnes ir N. Dillon, „Binding of Ikaros to the λ5 promotorius nutildo transkripciją per mechanizmą, kuriam nereikia heterochromatino susidarymo. EMBO žurnalas, t. 20, Nr. 11, p. 2812–2822, 2001. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  86. K. E. Brown, J. Baxter, D. Graf, M. Merkenschlager ir A. G. Fisher, „Dinaminis genų perstatymas limfocitų branduolyje, ruošiantis ląstelių dalijimuisi“, Molekulinė ląstelė, t. 3, Nr. 2, p. 207–217, 1999. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  87. S. M. Gasseris, „Potencialios pozicijos: branduolinė organizacija ir genų ekspresija“, Ląstelė, t. 104, Nr. 5, p. 639–642, 2001. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  88. M. Ehrlich, K. L. Buchanan, F. Tsien ir kt., „DNR metiltransferazės 3B mutacijos, susijusios su ICF sindromu, sukelia limfogenezės genų reguliavimo sutrikimus“. Žmogaus molekulinė genetika, t. 10, Nr. 25, p. 2917–2931, 2001. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  89. K. Hosoya, S. Yamashita, T. Ando, ​​T. Nakajima, F. Itoh ir T. Ushijima, „Adenomatous polyposis coli 1A greičiausiai bus metilintas kaip keleivis žmogaus skrandžio kancerogenezės metu“, Vėžio laiškai, t. 285, Nr. 2, p. 182–189, 2009. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  90. D. Levanon, Y. Bernstein, V. Negreanu ir kt., „Runx3 ekspresijos nebuvimas normaliame virškinimo trakto epitelyje kelia abejonių dėl jo naviko slopinimo funkcijos“, EMBO molekulinė medicina, t. 3, Nr. 10, p. 593–604, 2011. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  91. T. H. Bestor, „Neatsakyti klausimai apie promotoriaus metilinimo vaidmenį kancerogenezėje“, Niujorko mokslų akademijos metraštis, t. 983, p. 22–27, 2003. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  92. I. B. Weinstein ir A. K. Joe, „Ligos mechanizmai: priklausomybė nuo onkogenų – molekulinio taikymo vėžio terapijoje pagrindas“, Gamtos klinikinė onkologijos praktika, t. 3, Nr. 8, p. 448–457, 2006. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  93. M. G. Vander Heiden, „Taikymas vėžio metabolizmui: atsidaro terapinis langas“, „Nature Reviews“ narkotikų atradimas, t. 10, Nr. 9, 671–684 p., 2011 m.Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  94. A. H. Shain, I. Yeh, I. Kovalyshyn ir kt., „Genetinė melanomos evoliucija iš pirmtakų pažeidimų“, Naujosios Anglijos medicinos žurnalas, t. 373, Nr. 20, p. 1926–1936, 2015. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  95. S. T. Henderson ir T. D. Petes, „Paprastos sekos DNR nestabilumas Saccharomyces cerevisiae“, Molekulinė ir ląstelių biologija, t. 12, Nr. 6, p. 2749–2757, 1992. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  96. C. R. Boland ir A. Goel, „Mikrosatelito nestabilumas gaubtinės ir tiesiosios žarnos vėžyje“, Gastroenterologija, t. 138, Nr. 6, p. 2073–2087, 2010. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  97. M. R. Jones, K. A. Schrader, Y. Shen ir kt., „Reakcija į angiotenzino blokadą su irbesartanu pacientui, sergančiam metastazavusiu gaubtinės ir tiesiosios žarnos vėžiu“, Onkologijos metraščiai, t. 27, Nr. 5, straipsnio ID mdw018, p. 801–806, 2016. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  98. A. J. Redig ir P. A. Jänne, „Krepšelio tyrimai ir klinikinių tyrimų plano evoliucija genominės medicinos eroje“, Klinikinės onkologijos žurnalas, t. 33, Nr. 9, p. 975–977, 2015. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  99. T. K. Kelly, D. D. De Carvalho ir P. A. Jones, „Epigenetinės modifikacijos kaip terapiniai taikiniai“, Gamtos biotechnologija, t. 28, Nr. 10, p. 1069–1078, 2010. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  100. S. B. Baylin ir J. E. Ohm, „Epigenetinis genų nutildymas sergant vėžiu𠅊 ankstyvos onkogeninės priklausomybės mechanizmas? Gamtos apžvalgos Vėžys, t. 6, Nr. 2, p. 107–116, 2006. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  101. Y. Ying ir Q. Tao, „Epigenetinis WNT sutrikimas/β- katenino signalizacijos kelias sergant žmogaus vėžiu. Epigenetika, t. 4, Nr. 5, p. 34–39, 2009. Žiūrėti: Google Scholar
  102. B. Mair, S. Kubicek ir S. M. B. Nijman, „Epigenetinių pažeidžiamumo panaudojimas vėžio gydymui“, Farmakologijos mokslų tendencijos, t. 35, Nr. 3, p. 136–145, 2014. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  103. H. Suzuki, D. N. Watkins, K.-W. Jair ir kt., „Epigenetinis SFRP genų inaktyvavimas leidžia konstitucinį WNT signalizavimą sergant gaubtinės ir tiesiosios žarnos vėžiu“, Gamtos genetika, t. 36, Nr. 4, p. 417–422, 2004. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  104. M. M. Taketo, „Wnt signalo aktyvuoto vėžio išjungimas“, Gamtos genetika, t. 36, Nr. 4, p. 320–322, 2004. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  105. Y. C. Wen, D. H. Wang, C. Y. RayWhay, J. Luo, W. Gu ir S. B. Baylin, „Naviko slopintuvas HIC1 tiesiogiai reguliuoja SIRT1, kad moduliuotų nuo p53 priklausomus DNR pažeidimo atsakus“. Ląstelė, t. 123, Nr. 3, p. 437–448, 2005. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  106. J. Ihalainenas, S. Pakkala, E.-R. Savolainen, S.-E. Jansson ir A. Palotie, „Kalcitonino geno hipermetilinimas mielodisplaziniuose sindromuose“, Leukemija, t. 7, Nr. 2, p. 263–267, 1993. Žiūrėti: Google Scholar
  107. T. Shimamoto, J. H. Ohyashiki ir K. Ohyashiki: „P15INK4b ir E-kadherino genų metilinimas nepriklausomai koreliuoja su prasta ūminės mieloidinės leukemijos prognoze“, Leukemijos tyrimai, t. 29, Nr. 6, p. 653–659, 2005. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  108. H. Cechova, P. Lassuthova, L. Novakova ir kt., „Metilinimo pokyčių stebėjimas 9p21 regione pacientams, sergantiems mielodisplaziniais sindromais ir ūmine mieloidine leukemija“, Neoplazma, t. 59, Nr. 2, p. 168–174, 2012. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  109. S. K. Sadashiv, C. Hilton, C. Khan ir kt., „5 dienų gydymo azacitidinu veiksmingumas ir toleravimas senyviems pacientams, sergantiems ūmine mieloidine leukemija“, Vėžio medicina, t. 3, Nr. 6, p. 1570–1578, 2014. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  110. K. Raj ir G. J. Mufti, „Azacytidine (Vidaza) gydant mielodisplazinius sindromus“, Terapija ir klinikinės rizikos valdymas, t. 2, Nr. 4, p. 377–388, 2006. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  111. F. Creusot, G. Acs ir J. K. Christman, „DNR metiltransferazės slopinimas ir draugo eritroleukemijos ląstelių diferenciacijos indukcija 5-azacitidinu ir 5-aza-2′-deoksicitidinu“, Biologinės chemijos žurnalas, t. 257, Nr. 4, p. 2041–2048, 1982. Žiūrėti: Google Scholar
  112. J. K. Christman, „5-azacitidinas ir 5-aza-2′-deoksicitidinas kaip DNR metilinimo inhibitoriai: mechaniniai tyrimai ir jų reikšmė vėžio terapijai“, Onkogenas, t. 21, Nr. 35, p. 5483–5495, 2002. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  113. K. Ghoshal, J. Datta, S. Majumder ir kt., „5-aza-deoksicitidinas skatina selektyvų DNR metiltransferazės 1 skaidymą proteasominiu keliu, kuriam reikalinga KEN dėžutė, bromo greta esantis homologijos domenas ir branduolio lokalizacijos signalas“, Molekulinė ir ląstelių biologija, t. 25, Nr. 11, p. 4727–4741, 2005. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  114. P. A. Jones ir S. M. Taylor, „Hemimetilintos dvipusės DNR, pagamintos iš 5-azacitidinu apdorotų ląstelių“, Nukleino rūgščių tyrimai, t. 9, Nr. 12, p. 2933–2947, 1981. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  115. T. Murakami, X. Li, J. Gong, U. Bhatia, F. Traganos ir Z. Darzynkiewicz, „Apoptozės sukėlimas 5-azacytidinu: nuo vaisto koncentracijos priklausomi ląstelių ciklo specifiškumo skirtumai“, Vėžio tyrimai, t. 55, Nr. 14, p. 3093–3098, 1995. Žiūrėti: Google Scholar
  116. R. Khan, J. Schmidt-Mende, M. Karimi ir kt., „Hipometilinimas ir apoptozė 5-azacitidinu apdorotose mieloidinėse ląstelėse“, Eksperimentinė hematologija, t. 36, Nr. 2, p. 149–157, 2008. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  117. M. S. Soengas, P. Capodieci ir D. Polsky, „Apoptozės efektoriaus inaktyvavimas Apaf-1 sergant piktybine melanoma“, Gamta, t. 409, Nr. 6817, p. 207–211, 2001. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  118. A. P. Bird ir A. P. Wolffe, „Metilinimo sukeltos represijos— diržai, petnešos ir chromatinas“, Ląstelė, t. 99, Nr. 5, p. 451–454, 1999. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  119. A. W. Roberts, M. S. Davids, J. M. Pagel ir kt., „Taikymas BCL2 su venetoklaksu sergant recidyvuojančia lėtine limfocitine leukemija“ Naujosios Anglijos medicinos žurnalas, t. 374, Nr. 4, p. 311–322, 2016. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  120. S. S. Ramalingam, R. A. Parise, R. K. Ramananthan ir kt., „Vorinostato, histono deacetilazės inhibitoriaus, kartu su karboplatina ir paklitakseliu, I fazės ir farmakokinetikos tyrimas pažengusiems solidiems piktybiniams navikams gydyti“. Klinikiniai vėžio tyrimai, t. 13, Nr. 12, p. 3605–3610, 2007. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  121. S. S. Ramalingam, M. L. Maitland, P. Frankel ir kt., „Karboplatina ir paklitakselis kartu su vorinostatu arba placebu, skirtas pirmos eilės pažengusio nesmulkialąstelinio plaučių vėžio gydymui“, Klinikinės onkologijos žurnalas, t. 28, Nr. 1, p. 56–62, 2010. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  122. B. Yang, J. Wu, N. Maddodi, Y. Ma, V. Setaluri ir B. J. Longley, „Epigenetinė MAGE geno ekspresijos kontrolė KIT tirozino kinaze“, Tyrimo dermatologijos žurnalas, t. 127, Nr. 9, p. 2123–2128, 2007. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  123. P. van der Bruggen, C. Traversari, P. Chomez ir kt., „Genas, koduojantis antigeną, atpažįstamą žmogaus melanomos citolitinių T limfocitų“, Mokslas, t. 254, Nr. 5038, p. 1643–1647, 1991. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  124. M. Sang, L. Wang, C. Ding ir kt., „Su melanoma associated antigen gens𠅊n update“ Vėžio laiškai, t. 302, Nr. 2, p. 85–90, 2011. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  125. S. J. Jang, J. C. Soria, L. Wang, K. A. Hassan, R. C. Morice ir G. L. Walsh, „Melanomos antigeno naviko antigenų aktyvacija įvyksta ankstyvoje plaučių kancerogenezės stadijoje“, Vėžio tyrimai, t. 61, p. 7959–7963, 2001. Žiūrėti: Google Scholar
  126. M. Sang, Y. Lian, X. Zhou ir B. Shan, „MAGE-A šeima: patrauklūs vėžio imunoterapijos tikslai“, Vakcina, t. 29, Nr. 47, p. 8496–8500, 2011. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  127. A. P. Rapoport, E. A. Stadtmauer, G. K. Binder-Scholl, O. Goloubeva, D. T. Vogl ir S. F. Lacey, „NY-ESO-1 specifinės TCR sukurtos T ląstelės tarpininkauja nuolatiniam antigenui specifiniam priešnavikiniam poveikiui sergant mieloma“. Gamtos medicina, t. 21, p. 914–921, 2015. Žiūrėti: Google Scholar
  128. K. B. Chiappinelli, P. L. Strissel, A. Desrichard ir kt., „DNR metilinimo slopinimas sukelia interferono atsaką vėžiui per dsRNR, įskaitant endogeninius retrovirusus“, Ląstelė, t. 162, Nr. 5, p. 974–986, 2015. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  129. D. Roulois, H. Loo Yau, R. Singhania ir kt., „DNR demetiluojantys agentai nukreipia į gaubtinės ir tiesiosios žarnos vėžio ląsteles, sukeldami virusų mimiką endogeniniais transkriptais“, Ląstelė, t. 162, Nr. 5, p. 961–973, 2015. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  130. R. A. Juergens, J. Wrangle, F. P. Vendetti ir kt., „Kombinuota epigenetinė terapija yra veiksminga pacientams, sergantiems refrakteriniu pažengusiu nesmulkialąsteliniu plaučių vėžiu“. Vėžio atradimas, t. 1, Nr. 7, p. 598–607, 2011. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  131. J. Wrangle, W. Wang, A. Koch ir kt., „Nesmulkialąstelinio plaučių vėžio imuninio atsako pokyčiai vartojant azacitidiną“, Oncotarget, t. 4, Nr. 11, p. 2067–2079, 2013. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  132. S. P. Shah, A. Roth, R. Goya, A. Oloumi, G. Ha ir Y. Zhao, „pirminio trigubai neigiamo krūties vėžio kloninės ir mutacinės evoliucijos spektras“, Gamta, t. 486, p. 395–399, 2012. Žiūrėti: Google Scholar
  133. A. Bashashati, G. Ha, A. Tone ir kt., „Skirtingos pirminio aukšto laipsnio serozinio kiaušidžių vėžio evoliucinės trajektorijos, atskleistos atliekant erdvinį mutacijų profiliavimą“, Patologijos žurnalas, t. 231, Nr. 1, p. 21–34, 2013. Žiūrėti: Leidėjo svetainė | Google Scholar
  134. D. De Carvalho, S. Sharma, J. S. You ir kt., „DNR metilinimo patikra nustato vėžinių ląstelių išgyvenimo epigenetinius įvykius“, Vėžio ląstelė, t. 21, Nr. 5, p. 655–667, 2012. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  135. M. F. Paz, M. F. Fraga, S. Avila ir kt., „Sisteminis DNR metilinimo žmogaus vėžio ląstelių linijose profilis“, Vėžio tyrimai, t. 63, Nr. 5, p. 1114–1121, 2003. Žiūrėti: Google Scholar
  136. K. E. Gardner, C. D. Allis ir B. D. Strahl, „Operating on chromatin, spalvinga kalba, kurioje svarbus kontekstas“, Molekulinės biologijos žurnalas, t. 409, Nr. 1, p. 36–46, 2011. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  137. M. Zhang, S. Zhang, Y. Wen ir kt., „DNR metilinimo modeliai gali įvertinti nelygiavertes krūties vėžio baigtis su tais pačiais receptorių potipiais“, PLoS ONE, t. 10, Nr. 11, Straipsnio ID e0142279, 2015. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  138. M. Esteller, J. Garcia-Foncillas ir E. Andion, „DNR atkūrimo geno MGMT inaktyvavimas ir gliomų klinikinis atsakas į alkilinančius agentus“, Naujosios Anglijos medicinos žurnalas, t. 343, Nr. 19, p. 1350–1354, 2000. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  139. A. E. Pegg, M. E. Dolan ir R. C. Moschel, „O6-alkilguanino-DNR alkiltransferazės struktūra, funkcija ir slopinimas“, Nukleino rūgščių tyrimų ir molekulinės biologijos pažanga, t. 51, p. 167–223, 1995. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  140. D. B. Ludlum, „DNR alkilinimas halogenetilnitrozkarbamidais: pagamintų modifikacijų pobūdis ir jų fermentinis atstatymas arba pašalinimas“, Mutacijų tyrimai – pagrindiniai ir molekuliniai mutagenezės mechanizmai, t. 233, Nr. 1-2, p. 117-126, 1990. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  141. I. I. de Caceres, M. Cortes-Sempere, C. Moratilla ir kt., „IGFBP-3 hipermetilinimo sukeltas trūkumas tarpininkauja cisplatinos atsparumui sergant nesmulkialąsteliniu plaučių vėžiu“, Onkogenas, t. 29, Nr. 11, p. 1681–1690, 2010. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  142. S. Maier, I. Nimmrich, T. Koenig ir kt., „Homeodomeno transkripcijos faktoriaus PITX2 DNR metilinimas patikimai prognozuoja tolimo ligos pasikartojimo riziką pacientams, gydytiems tamoksifenu, mazgų neigiamu krūties vėžiu. Techninis ir klinikinis patvirtinimas daugiacentris centras, bendradarbiaujant su Europos vėžio tyrimų ir gydymo organizacijos (EORTC) patobiologijos grupe. Europos vėžio žurnalas, t. 43, Nr. 11, p. 1679–1686, 2007. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  143. P. A. Jones ir P. W. Laird, „Vėžio epigenetika ateina su amžiumi“, Gamtos genetika, t. 21, Nr. 2, p. 163–167, 1999. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  144. M. T. McCabe, H. M. Ott, G. Ganji ir kt., „EZH2 slopinimas kaip terapinė strategija limfomos su EZH2 aktyvuojančiomis mutacijomis“ Gamta, t. 491, Nr. 7427, p. 108–112, 2012. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  145. V. Ribragas, J-C. Soria, J-M. Michot ir kt., „Tazemetostato (EPZ-6438), Zeste-Homolog 2 stipriklio (EZH2) inhibitoriaus, 1 fazės tyrimas: preliminarus saugumas ir aktyvumas pacientams, sergantiems recidyvuojančia arba atsparia ne Hodžkino limfoma (NHL), Kraujas, t. 126, p. 473, 2015. Žiūrėti: Google Scholar
  146. F. Wang, J. Travins, B. DeLaBarre ir kt., „Tikslinis mutanto IDH2 slopinimas leukemijos ląstelėse sukelia ląstelių diferenciaciją“, Mokslas, t. 340, Nr. 6132, p. 622–626, 2013. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  147. D. Rohle, J. Popovici-Muller, N. Palaskas ir kt., „Mutantinio IDH1 inhibitorius lėtina augimą ir skatina gliomos ląstelių diferenciaciją“, Mokslas, t. 340, Nr. 6132, p. 626–630, 2013. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  148. A. C. West ir R. W. Johnstone, „Nauji ir atsirandantys HDAC inhibitoriai vėžio gydymui“, Klinikinių tyrimų žurnalas, t. 124, Nr. 1, p. 30–39, 2014. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  149. S. Yao, Z. He ir C. Chen, „CRISPR/Cas9 tarpininkaujantis genomo redagavimas epigenetinių veiksnių gydymui vėžio gydymui“, Žmogaus genų terapija, t. 26, Nr. 7, p. 463–471, 2015. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  150. I. B. Hilton, A. M. D'Ippolito, C. M. Vockley ir kt., „Epigenomo redagavimas CRISPR-Cas9 pagrindu veikiančia acetiltransferaze aktyvuoja genus iš promotorių ir stiprintuvų“, Gamtos biotechnologija, t. 33, Nr. 5, p. 510–517, 2015. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  151. A. Vojta, P. Dobrinic, V. Tadic ir kt., „CRISPR-Cas9 sistemos panaudojimas tiksliniam DNR metilinimui“, Nukleino rūgščių tyrimai, t. 44, Nr. 12, p. 5615–5628, 2016. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  152. G. Kungulovski ir A. Jeltsch, „Epigenome Editing: State of the Art, Concepts and Perspectives“, Genetikos tendencijos, t. 32, Nr. 2, p. 101–113, 2016. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  153. S. Paik, G. Tang, S. Shak ir kt., „Genų ekspresija ir chemoterapijos nauda moterims, sergančioms neigiamu estrogenų receptorių krūties vėžiu“. Klinikinės onkologijos žurnalas, t. 24, Nr. 23, p. 3726–3734, 2006. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  154. R. S. Heist ir J. A. Engelman, „SnapShot: nesmulkialąstelinis plaučių vėžys“, Vėžio ląstelė, t. 21, Nr. 3, p. 448–e2, 2012. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  155. P. A. Northcott, A. Korshunov, H. Witt ir kt., „Medulloblastoma apima keturis skirtingus molekulinius variantus“, Klinikinės onkologijos žurnalas, t. 29, Nr. 11, p. 1408–1414, 2011. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  156. S. E. S. Leary ir J. M. Olson, „Molekulinė medulloblastomos klasifikacija: naujos kartos klinikinių tyrimų skatinimas“, Dabartinė nuomonė apie pediatriją, t. 24, Nr. 1, p. 33–39, 2012. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  157. D. K. Changas, S. M. Grimmondas, T. R. J. Evansas ir A. V. Biankinas, „Išskirtinių atsakytojų genomų kasimas“, Gamtos apžvalgos Vėžys, t. 14, Nr. 5, p. 291–292, 2014. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  158. R. Bartsch, C. Wenzel ir G. G. Steger, „Trastuzumabas gydant ankstyvos ir pažengusios stadijos krūties vėžį“, Biologija: tikslai ir terapija, t. 1, p. 19–31, 2007. Žiūrėti: Google Scholar
  159. G. Iyer, A. J. Hanrahan, M. I. Milowsky ir kt., „Genomo sekos nustatymas nustato everolimuzo jautrumo pagrindą“, Mokslas, t. 338, Nr. 6104, p. 221, 2012. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  160. N. Wagle, B. C. Grabiner, E. M. Van Allen ir kt., „Reakcija ir įgytas atsparumas everolimuzui sergant anaplastiniu skydliaukės vėžiu“, Naujosios Anglijos medicinos žurnalas, t. 371, Nr. 15, p. 1426–1433, 2014. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  161. V. Marksas, „Vėžys: išskirtinis atsakas“, Gamta, t. 520, Nr. 7547, p. 389–393, 2015. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  162. M. Xu, M.-C. J. Kao, J. Nunez-Iglesias, J. R. Nevins, M. West ir X. J. Jasmine, „Integratyvus požiūris į ligos specifinių būdų apibūdinimą ir jų koordinavimą: vėžio atvejo tyrimas“, BMC genomika, t. 9, Nr. 1, straipsnis S12, 2008. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  163. S. Volinia, M. Galasso, S. Costinean ir kt., „MiRNR tinklų perprogramavimas sergant vėžiu ir leukemija“, Genomo tyrimai, t. 20, Nr. 5, p. 589–599, 2010. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  164. B. Vogelsteinas, N. Papadopoulosas, V. E. Velculescu, S. Zhou, L. A. Diazas jaunesnysis ir K. W.Kinzleris, „Vėžio genomo peizažai“, Mokslas, t. 340, Nr. 6127, p. 1546–1558, 2013. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  165. R. A. Burrell ir C. Swanton, „Iš naujo įvertinant klonų dominavimą vėžio evoliucijoje“, Vėžio tendencijos, t. 2, Nr. 5, p. 263–276, 2016. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  166. M. Gerlinger, S. Horswell, J. Larkin ir kt., „Genominė architektūra ir aiškių ląstelių inkstų ląstelių karcinomų evoliucija, apibrėžta kelių regionų sekos nustatymu“, Gamtos genetika, t. 46, Nr. 3, p. 225–233, 2014. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  167. D. A. Landau, S. L. Carteris, P. Stojanovas ir kt., „Subkloninių mutacijų raida ir įtaka lėtinės limfocitinės leukemijos atveju“, Ląstelė, t. 152, Nr. 4, p. 714–726, 2013. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  168. D. F. Ransohoff, „šališkumas kaip grėsmė vėžio molekulinių žymenų tyrimų pagrįstumui“, Gamtos apžvalgos Vėžys, t. 5, Nr. 2, p. 142–149, 2005. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  169. D. Brocks, Y. Assenov, S. Minner ir kt., „Intratumor DNR metilinimo heterogeniškumas atspindi klonų evoliuciją sergant agresyviu prostatos vėžiu“, Ląstelių ataskaitos, t. 8, Nr. 3, p. 798–806, 2014. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  170. A. P. Makohon-Moore, M. Zhang, J. G. Reiter ir kt., „Ribotas žinomų vairuotojų genų mutacijų heterogeniškumas tarp atskirų pacientų, sergančių kasos vėžiu“, metastazių. Gamtos genetika, t. 49, Nr. 3, p. 358–366, 2017. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  171. O. G. McDonald, X. Li, T. Saunders ir kt., „Epigenominis perprogramavimas kasos vėžio progresavimo metu susieja anabolinę gliukozės metabolizmą su tolimomis metastazėmis“, Gamtos genetika, t. 49, Nr. 3, p. 367–376, 2017. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  172. C. M. Lin, J. Jaswal, T. Vandenberg, A. Tuck ir M. Brackstone, „Silpnai hormonų receptoriams teigiamas krūties vėžys ir adjuvantinės hormoninės terapijos naudojimas“, Dabartinė onkologija, t. 20, Nr. 6, p. e612–e613, 2013. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  173. P. J. McDonald, R. Carpenter, G. T. Royle ir I. Taylor, „Prasta krūties vėžio reakcija į tamoksifeną“, Antrosios pakopos medicinos žurnalas, t. 66, Nr. 782, p. 1029–1031, 1990. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  174. N. Harbeck ir A. Rody, „Pasiklydę vertime? Estrogenų receptorių būklė ir endokrininis atsakas sergant krūties vėžiu. Klinikinės onkologijos žurnalas, t. 30, Nr. 7, p. 686–689, 2012. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  175. F. Lumachi, A. Brunello, M. Maruzzo, U. Basso ir S. M. M. Basso, „Estrogenų receptorių teigiamo krūties vėžio gydymas“, Dabartinė medicinos chemija, t. 20, Nr. 5, p. 596–604, 2013. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  176. B. E. Johnsonas, T. Mazoras, C. Hongas ir kt., „Mutacinė analizė atskleidžia pasikartojančios gliomos kilmę ir terapijos sukeltą evoliuciją“, Mokslas, t. 343, Nr. 6167, p. 189–193, 2014. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  177. M. Janiszewska, L. Liu, V. Almendro ir kt., „In situ vienos ląstelės analizė nustato PIK3CA mutacijos ir HER2 amplifikacijos heterogeniškumą sergant HER2 teigiamu krūties vėžiu“, Gamtos genetika, t. 47, Nr. 10, p. 1212–1219, 2015. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  178. S. Chang-Hao Tsao, J. Weiss, C. Hudson ir kt., „Reakcijos į melanomos terapiją stebėjimas, kiekybiškai įvertinant cirkuliuojančio naviko DNR naudojant lašelių skaitmeninę PGR BRAF ir NRAS mutacijoms“. Mokslinės ataskaitos, t. 5, straipsnis 11198, 2015. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  179. I. Garcia-Murillas, G. Schiavon, B. Weigelt ir kt., „Mutacijų sekimas cirkuliuojančio naviko DNR prognozuoja ankstyvojo krūties vėžio atkrytį“, Mokslas Transliacinė medicina, t. 7, Nr. 302, straipsnio ID 302ra133, 2015. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  180. L. A. Diaz Jr., R. T. Williams, J. Wu ir kt., „Molekulinė evoliucija įgyto atsparumo tikslinei EGFR blokadai sergant gaubtinės ir tiesiosios žarnos vėžiu“, Gamta, t. 486, Nr. 7404, p. 537–540, 2012. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  181. S. Misale, R. Yaeger, S. Hobor ir kt., „KRAS mutacijų atsiradimas ir įgytas atsparumas anti-EGFR terapijai sergant gaubtinės ir tiesiosios žarnos vėžiu“, Gamta, t. 486, Nr. 7404, p. 532–536, 2012. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  182. S. Misale, S. Arena, S. Lamba ir kt., „EGFR ir MEK blokada sulaiko heterogeninius įgyto atsparumo anti-EGFR terapijai sergant gaubtinės ir tiesiosios žarnos vėžiu mechanizmus“, Mokslas Transliacinė medicina, t. 6, Nr. 224, straipsnio ID 224ra26, 2014. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  183. T. deVos, R. Tetzner, F. Model ir kt., „Cirkuliuojanti metilinta SEPT9 DNR plazmoje yra gaubtinės ir tiesiosios žarnos vėžio biomarkeris“, Klinikinė chemija, t. 55, Nr. 7, p. 1337–1346, 2009. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  184. K. L. Mahonas, W. Qu, J. Devaney ir kt., „Metilintas glutationo S-transferazė 1 (mGSTP1) yra galimas plazmos neturintis DNR epigenetinis žymeklis, nurodantis prognozės ir atsako į chemoterapiją sergant kastratui atspariu prostatos vėžiu“, Britų vėžio žurnalas, t. 111, Nr. 9, p. 1802–1809, 2014. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  185. M. J. Fackler, Z. L. Bujanda, C. Umbricht ir kt., „Nauji metilinti biomarkeriai ir patikimas tyrimas, skirtas aptikti cirkuliuojančią naviko DNR sergant metastazavusiu krūties vėžiu“. Vėžio tyrimai, t. 74, Nr. 8, p. 2160–2170, 2014. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  186. H. Fiegl, S. Millinger, E. Mueller-Holzner ir kt., „Cirkuliuojanti navikui būdinga DNR: žymeklis, skirtas stebėti adjuvantinio gydymo veiksmingumą vėžiu sergantiems pacientams“, Vėžio tyrimai, t. 65, Nr. 4, p. 1141–1145, 2005. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  187. M. Zurita, P. C. Lara, R. del Moral ir kt., „Hipermetilintas 14-3-3-σ ir ESR1 geno promotorius serume kaip kandidatus į krūties vėžio metastazių diagnozavimo ir gydymo veiksmingumą. BMC vėžys, t. 10, 217 straipsnis, 2010. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  188. G. Sharma, S. Mirza, R. Parshad, S. D. Gupta ir R. Ralhan, „Cirkuliuojančios DNR DNR metilinimas: neoadjuvantinės chemoterapijos veiksmingumo stebėjimo krūties vėžiu pacientams žymuo“, Naviko biologija: Tarptautinės onkologinio vystymosi biologijos ir medicinos draugijos žurnalas, t. 33, Nr. 6, p. 1837–1843, 2012. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  189. A. A. Ponomaryova, E. Y. Rykova, N. V. Cherdyntseva ir kt., „Aberrantiškai metilintos cirkuliuojančios DNR galimybės plaučių vėžiu sergančių pacientų diagnostikai ir stebėjimui po gydymo“, Plaučių vėžys, t. 81, Nr. 3, p. 397–403, 2013. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  190. K. Warton, K. L. Mahon ir G. Samimi, „Metilintas cirkuliuojantis naviko DNR kraujyje: galia vėžio prognozėje ir atsake“, Su endokrinine sistema susijęs vėžys, t. 23, Nr. 3, p. R157–R171, 2016. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  191. Y. Hou, H. Guo, C. Cao ir kt., „Vienaląstės trigubos omikos sekos nustatymas atskleidžia genetinį, epigenetinį ir transkriptinį kepenų ląstelių karcinomų heterogeniškumą“, Ląstelių tyrimai, t. 26, Nr. 3, p. 304–319, 2016. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  192. F. Schmidt ir T. Efferth, „Naviko heterogeniškumas, vienos ląstelės sekvenavimas ir atsparumas vaistams“, Farmacijos produktai, t. 9, Nr. 2, straipsnis 33, 2016. Žiūrėti: Leidėjo svetainė | Google Scholar
  193. S. A. Smallwood, H. J. Lee, C. Angermueller ir kt., „Vienaląstelinio genomo bisulfito sekos nustatymas epigenetiniam heterogeniškumui įvertinti“, Gamtos metodai, t. 11, Nr. 8, p. 817–820, 2014. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  194. M. Farlik, N. C. Sheffield, A. Nuzzo ir kt., „Vienaląstės DNR metilomų sekos nustatymas ir bioinformatinė epigenominės ląstelės būsenos dinamikos išvada“, Ląstelių ataskaitos, t. 10, Nr. 8, p. 1386–1397, 2015. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  195. W. Jin, Q. Tang, M. Wan ir kt., „DNazės i padidėjusio jautrumo vietų genomo mastu aptikimas atskirose ląstelėse ir FFPE audinių mėginiuose“, Gamta, t. 528, Nr. 7580, p. 142–146, 2015. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  196. N. L. van Berkum, E. Lieberman-Aiden, L. Williams ir kt., „Hi-C: metodas trimatės genomų architektūros tyrimui“, Vizualizuotų eksperimentų žurnalas: JoVE, ne. 39, 2010. Žiūrėti: Google Scholar
  197. T. Nagano, Y. Lubling, T. J. Stevens ir kt., „Vienos ląstelės Hi-C atskleidžia chromosomų struktūros kintamumą tarp ląstelių“. Gamta, t. 502, Nr. 7469, p. 59–64, 2013. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  198. C. M. Torresas, A. Biranas, M. J. Burney ir kt., „Sąjungos histonas H1.0 sukuria epigenetinį ir funkcinį intratumor heterogeniškumą“, Mokslas, t. 353, Nr. 6307, p. aaf1644, 2016. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  199. A. Sharma, S. R. Shah, H. Illum ir J. Dowell, „Vemurafenibas: tikslinis mutavusio BRAF slopinimas, skirtas gydyti pažengusią melanomą ir jos potencialą sergant kitais piktybiniais navikais“, Narkotikai, t. 72, Nr. 17, p. 2207–2222, 2012. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  200. A. M. Menzies, G. V. Long ir R. Murali, „Dabrafenibas ir jo potencialas gydyti metastazavusią melanomą“, Vaistų projektavimas, kūrimas ir terapija, t. 6, p. 391–405, 2012. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  201. K. M. Coyle, M. L. Thomas, M. Sultan ir P. Marcato, „Taikymas į pagrindinius su stiebu susijusius kelius sergant žmogaus vėžiu“ Vėžio kamieninių ląstelių atsiradimo koncepcijos Ateities perspektyva Transl Oncol [internetas], S. Babashah, Red., p. 393–443, Springer International Publishing, Kembridžas, JK, 2015 m. Žiūrėti: Google Scholar
  202. JM Golas, K. Arndt, C. Etienne ir kt., „SKI-606, dvigubas 4-anilino-3-chinolinkarbonitrilo Src ir Abl kinazių inhibitorius, yra stiprus antiproliferacinis agentas prieš lėtines mieloleukemijos ląsteles kultūroje ir sukelia regresiją K562 ksenografų nuogose pelėse. Vėžio tyrimai, t. 63, Nr. 2, p. 375–381, 2003. Žiūrėti: Google Scholar
  203. LJ Lombardo, FY Lee, P. Chen ir kt., „N-(2-chlor-6-metilfenil)-2-(6-(4-(2-hidroksietil)-piperazin-1-il)-2 atradimas -metilpirimidin-4-ilamino)tiazol-5-karboksamidas (BMS-354825), dvigubas Src/Abl kinazės inhibitorius, turintis stiprų priešnavikinį poveikį ikiklinikinių tyrimų metu. Medicininės chemijos žurnalas, t. 47, Nr. 27, p. 6658–6661, 2004. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  204. E. Weisberg, P. W. Manley, W. Breitenstein ir kt., „AMN107, selektyvaus natūralaus ir mutantinio Bcr-Abl inhibitoriaus, apibūdinimas“, Vėžio ląstelė, t. 7, p. 129–141, 2005. Žiūrėti: Google Scholar
  205. P. Valentas, „Imatinibui atspari lėtinė mieloidinė leukemija (LML): dabartinės patogenezės koncepcijos ir nauji atsirandantys farmakologiniai metodai“, Biologija: tikslai ir terapija, t. 1, Nr. 4, p. 433–448, 2007. Žiūrėti: Google Scholar
  206. P. Pérez-Galán, G. Roué, N. Villamor, E. Campo ir D. Colomer: „BH3 imituojantis GX15-070 sinergizuojasi su bortezomibu sergant mantijos ląstelių limfoma, sustiprindamas Noxa sukeltą aktyvaciją Bako“, Kraujas, t. 109, Nr. 10, p. 4441–4449, 2007. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  207. G. R. Oxnard, P. C. Lo, M. Nishino ir kt., „Plaučių vėžio su egfr exon 20 intarpais istorija ir molekulinės charakteristikos“, Krūtinės ląstos onkologijos žurnalas, t. 8, Nr. 2, p. 179–184, 2013. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  208. A. B. Turke, K. Zejnullahu, Y.-L. Wu ir kt., „MET amplifikacijos egzistavimas ir kloninis pasirinkimas EGFR mutantiniame NSCLC“, Vėžio ląstelė, t. 17, Nr. 1, p. 77–88, 2010. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  209. L. M. Sholl, S. Weremowicz, S. W. Gray ir kt., „kombinuotas ALK imunohistochemijos ir FISH naudojimas optimaliam ALK pertvarkytų plaučių adenokarcinomų nustatymui“, Krūtinės ląstos onkologijos žurnalas, t. 8, Nr. 3, p. 322–328, 2013. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  210. J. J. Lin ir A. T. Shaw, „Atsparumas: tikslinė plaučių vėžio terapija“, Vėžio tendencijos, t. 2, Nr. 7, p. 350–364, 2016. Žiūrėti: leidėjo svetainė | Google Scholar
  211. AW Roberts, S. Ma, DM Brander, TJ Kipps, JC Barrientos ir MS Davids, „Rekomenduojamos 2 fazės ABT-199 (GDC-0199) kartu su rituksimabu (R) dozės nustatymas pacientams, kuriems yra recidyvas / refrakterinis (R). /R) lėtinė limfocitinė leukemija (LLL), Kraujas, t. 124, p. 325, 2014. Žiūrėti: Google Scholar

Autorių teisės

Autorių teisės © 2017 Krysta Mila Coyle ir kt. Tai atviros prieigos straipsnis, platinamas pagal Creative Commons Attribution License, kuris leidžia neribotai naudoti, platinti ir dauginti bet kokioje laikmenoje, jei originalus darbas yra tinkamai cituojamas.


Mokslininkai nustatė 13 naujų naviką slopinančių genų sergant kepenų vėžiu

Per daugelį metų su vėžiu susijusių genų medžioklė ir supratimas, kaip jie veikia, buvo svarbus, nors ir daug laiko reikalaujantis pratimas. „Cold Spring Harbor Laboratory“ (CSHL) penkios skirtingos tyrimų grupės dabar sujungė savo žinias, kad paspartintų su vėžiu susijusių genų atradimą ir jų funkcijos patvirtinimą gyvuose gyvūnuose.

Bendrų pastangų rezultatas – didelio masto, greitas ir ekonomiškas genetinis patikrinimas, kurio metu preliminariu tyrimu pavyko atskleisti 13 naujų naviko slopintuvų ir ndash genų, kurie slopina vėžio genų aktyvumą. Auglio slopintuvai yra svarbūs vėžio vystymuisi apskritai, o ypač kepenų vėžiui, kai dažnai buvo nustatyta, kad jų trūksta žmonėms, kuriems išsivysto ši liga.

Šie atradimai, paskelbti internete prieš spausdinimą lapkričio 17 d. ir planuojami pasirodyti lapkričio 26 d. Cell numeryje, yra didžiulis žingsnis į priekį siekiant suprasti vėžio genetiką ir atveria daugybę naujų strategijų, kaip pagerinti jo diagnozę ir gydymą, &rdquo pasak CSHL profesoriaus Scott W. Lowe, Ph.D., atitinkamo tyrimo autoriaus. Kiti autoriai yra Scott Powers, Ph.D., Žmogaus vėžio genomo centro prie CSHL direktorius, ir CSHL profesoriai Gregory J. Hannon, Ph.D., W. Richard McCombie, Ph.D. ir Michael Wigler, Ph. D.

Tikslus naviko slopinimo genų nustatymas

Auglio slopintuvai yra esminis tarpląstelinių signalizacijos tinklų komponentas, apsaugantis nuo nekontroliuojamo ląstelių dauginimosi. Tokių genų pranašumai gali būti prarasti, kai DNR keičiasi, įskaitant mutacijas arba ištisų chromosomų ruožų ištrynimus. Labai efektyvus genomo sekos nustatymo metodas, sukurtas prieš kelerius metus Wigler laboratorijoje, leido nuskaityti vėžinių ląstelių genomą, be kita ko, dėl pašalintų chromosomų dalių, kuriose greičiausiai yra naviko slopintuvų.

Daktaras Powersas atliko žmogaus kepenų vėžio mėginių genominę analizę, kuri suteikė pagrindą sujungtų komandų darbui. „Powers&rsquo“ laboratorija nuskaitė daugiau nei 100 pacientų kepenų vėžio genomus, kad sudarytų chromosomų regionų ištrynimų sąrašą. Buvo hipotezė, kad šie regionai yra daugumos trūkstamų naviko slopinimo genų vieta. Šio sąrašo palyginimas su normalios žmogaus ląstelės genomo seka atskleidė maždaug 300 genų tapatybę ištrintuose chromosomų segmentuose.

Chromosomų delecijos apsiriboja tik su vėžiu susijusiais genais, bet koks skaičius &ldquopassenger&rdquo arba nesusijusių gretimų genų taip pat gali būti netyčia prarastas. Todėl komanda turėjo tiksliai nustatyti naviko slopintuvus tarp 300 genų. &bdquoGenominė žmogaus navikų analizė yra svarbi,&rdquo Powers pastebėjo&rdquo&rdquo, bet jos derinimas su funkcine patikra pelių modeliuose yra svarbus žingsnis į priekį.

Įprastas geno ir rsquos funkcijos apibūdinimo būdas yra mutuoti jį pelių embrionuose ir tada sukurti pelių linijas, kurias vėliau galima ištirti dėl mutacijos ir rsquos poveikio. Lowe&rsquos grupė apėjo šį daug laiko reikalaujantį žingsnį, sukurdama mutacijas suaugusių pelių ląstelių genome ir vėl sušvirkščiant šias ląsteles suaugusioms pelėms. Komanda naudojo daktaro Hannono ištobulintą stabilių mutacijų įvedimo į pelių ląsteles metodą per RNR interferenciją arba RNRi metodą, kai į ląsteles įvedamos mažos RNR molekulės, kad būtų išjungti specifiniai genai.

RNR sekos, atitinkančios visus 300 pašalintų genų, buvo gautos iš Hannon laboratorijos sudarytos RNRi &ldquolibrary&rdquo. Lowe&rsquos komanda pristatė šiuos RNR įrankius (žinomus kaip trumpo plaukų segtuko RNR arba shRNR) į progenitorines ląsteles, kurios išsivysto į subrendusias kepenų ląsteles, nors ir sukurtas taip, kad gamintų per daug vėžio geno produkto, vadinamo Myc.

Ląstelėse su šiomis Myc mutacijomis vėžiui sukelti pakaktų papildomo &ldquotrigger&rdquo, pvz., naviko slopinimo geno išjungimo per RNRi. Sukurtos ląstelės, turinčios Myc mutaciją ir shRNR, buvo sušvirkštos pelėms. Dramatiškai tos, kurios gavo ląsteles, kuriose naviką slopinantis genas buvo „nutildytas“ shRNR, per mėnesį išsivystė navikai.

Mokslininkai išsiaiškino nutildytų navikų slopintuvų tapatybę tiesiog išskirdami ir išanalizuodami genetinę medžiagą iš navikų. Jų strategija nustatė 13 naujų naviką slopinančių genų, kurių dauguma anksčiau nebuvo susiję su vėžiu.

Turtingas ir netikėtas atlygis

„Šių naujų genų prigimtis nėra akivaizdi, ir mes nebūtume atspėję jų ryšio su vėžiu, jei nebūtume laikę šio požiūrio“, – sako Lowe'as. &bdquoDabar jie gali leisti mums žengti į priekį blogai suprantamose vėžio srityse.&ldquo

Naujai nustatyti naviko slopinimo genai veikia daugybę ląstelių veiklos, įskaitant ląstelių struktūros palaikymą, ląstelių metabolizmą, ląstelių proliferaciją ir įvairių naviko augimą skatinančių baltymų kiekio kontrolę ląstelės ir rsquos branduolyje. Vienu atveju komandos ir rsquos strategija taip pat atskleidė ne atskirus genus, o visą genų tinklą, kuris sugenda sergant kepenų vėžiu. &bdquoAtsižvelgiant į tai, kad vėžio galvosūkis apima kelis genus įvairiuose deriniuose, turime rasti visus smūgius, dėl kurių ląstelė virsta per kraštus, &ldquo sako Lowe'as, paaiškindamas vieną savo komandos plačios strategijos pranašumą.

Kai kurie nustatyti genai taip pat gali paskatinti naujas vėžio gydymo strategijas. Pavyzdžiui, kai kurie naujai atrasti naviką slopinantys genai „koduoja“ išskiriamus baltymus, o tai rodo, kad jų gebėjimas užkirsti kelią vėžiui priklauso nuo jų buvimo už ląstelės ribų. Pataisyti tokių baltymų praradimą ir ndash papildant jų kiekį injekcijomis &ndash yra lengviau išspręsti, nei taisyti genomo defektą taikant genų terapiją.

Kitaip tariant, CSHL komanda ir rsquos nauja strategija dabar leidžia greitai iš genominės informacijos išfiltruoti tuos genus, kurie konkrečiai veikia gyvų gyvūnų vėžio vystymąsi, ir tokiu būdu sutelkti tolesnius tyrimus į tuos, kurie gali būti kliniškai naudingiausi.

Istorijos šaltinis:

Pateiktos medžiagos Cold Spring Harbor laboratorija. Pastaba: turinys gali būti redaguojamas pagal stilių ir ilgį.


Saugus įjungimo jungiklis

Tada komanda ieškojo junginių, kurie galėtų blokuoti WWP1. Jie naudojo kompiuterį, kad sukurtų 3D WWP1 struktūros modelius, o tada praktiškai sutalpino kitas molekules, pavyzdžiui, raktas gali tilpti į spyną.

Analizė numatė, kad junginys, vadinamas indol-3-karbinoliu (I3C), gali prisijungti prie WWP1 ir neleisti jam sąveikauti su PTEN. I3C nedideliais kiekiais natūraliai randama kai kuriose daržovėse, įskaitant brokolius ir briuselio kopūstus. Jis taip pat parduodamas be recepto kaip maisto papildas.

Kai tyrėjai žmogaus ląsteles, kuriose yra per daug WWP1, apdorojo I3C, pastebėjo, kad PTEN pradėjo kauptis ląstelių paviršiuose, o tai rodo, kad WWP1 buvo blokuojamas.

Tada jie išbandė I3C su pelėmis, sukurtomis gaminti per daug MANO C. Pelėms, kurioms buvo suteiktas junginys, išsivystė daug mažesni navikai nei toms, kurioms nebuvo. Vartojant I3C tokiomis dozėmis, kurios reikalingos šiam naviką slopinančiam poveikiui, šalutinio poveikio nepastebėta.


Autoriaus informacija

Filialai

Sveikatos tyrimų institutas, Talasemijos ir hemoglobinopatijos tyrimų centras, Ahvaz Jundišapuro medicinos mokslų universitetas, Ahvaz, Iranas

Maria Kavianpour, Ahmadas Ahmadzadehas ir Najmaldinas Saki

Biochemijos ir hematologijos katedra, Medicinos fakultetas, Semnano medicinos mokslų universitetas, Semnan, Iranas

Taip pat galite ieškoti šio autoriaus PubMed Google Scholar

Taip pat galite ieškoti šio autoriaus PubMed Google Scholar

Taip pat galite ieškoti šio autoriaus PubMed Google Scholar

Taip pat galite ieškoti šio autoriaus PubMed Google Scholar

Autorius susirašinėjimui